More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1655 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1655  elongation factor P  100 
 
 		 207 aa  421  1e-117  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.668126 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2404  elongation factor P  79.14 
 
 		 188 aa  318  5e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.474133 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2131  elongation factor P  79.14 
 
 		 188 aa  317  9e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.648865 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0479  elongation factor P  79.14 
 
 		 188 aa  317  9e-86  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4128  elongation factor P  68.98 
 
 		 189 aa  279  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.593775  normal  0.232702 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1884  elongation factor P  69.52 
 
 		 188 aa  278  5e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0379  elongation factor P  68.98 
 
 		 188 aa  276  1e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.399775 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3478  elongation factor P  68.45 
 
 		 189 aa  276  2e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.619484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3799  elongation factor P  68.45 
 
 		 189 aa  275  3e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.282842  normal  0.601984 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2738  elongation factor P  68.45 
 
 		 188 aa  272  3e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.827612 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6026  elongation factor P  66.31 
 
 		 189 aa  272  3e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.524609  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2531  elongation factor P  67.38 
 
 		 189 aa  270  8.000000000000001e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3230  elongation factor P  66.31 
 
 		 188 aa  270  1e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.444474 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3194  elongation factor P  67.38 
 
 		 188 aa  268  4e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2956  elongation factor P  65.24 
 
 		 188 aa  266  2e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3005  elongation factor P  65.95 
 
 		 186 aa  266  2e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.150691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2504  elongation factor P  65.24 
 
 		 188 aa  262  3e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.279878  normal  0.485445 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2792  elongation factor P  63.64 
 
 		 188 aa  259  3e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.113127  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0761  elongation factor P  65.78 
 
 		 188 aa  256  2e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.490004  normal  0.378671 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3225  elongation factor P  61.17 
 
 		 189 aa  255  4e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4012  elongation factor P  61.5 
 
 		 188 aa  250  8.000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0455  elongation factor P  57.98 
 
 		 189 aa  250  1e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.627481 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1643  elongation factor P  62.57 
 
 		 188 aa  249  2e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.666832 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2809  elongation factor P  61.5 
 
 		 216 aa  249  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.158684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2302  elongation factor P  62.57 
 
 		 188 aa  248  4e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0910613  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1206  elongation factor P  44.1 
 
 		 211 aa  180  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.593204  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1710  elongation factor P  44.09 
 
 		 186 aa  179  2.9999999999999997e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.820092  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2102  elongation factor P  43.01 
 
 		 187 aa  178  4e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0533599  hitchhiker  0.00367804 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3184  elongation factor P  42.47 
 
 		 187 aa  177  1e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.509533  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1706  elongation factor P  45.45 
 
 		 188 aa  176  2e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0608317  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1652  elongation factor P  44.09 
 
 		 186 aa  176  3e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.397183  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3710  elongation factor P  42.78 
 
 		 189 aa  175  3e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0822316 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0158  elongation factor P  41.62 
 
 		 190 aa  175  3e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1500  elongation factor P  43.85 
 
 		 188 aa  174  9.999999999999999e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.627549 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2980  elongation factor P  40.86 
 
 		 187 aa  169  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.279152 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1314  elongation factor P  40.86 
 
 		 187 aa  167  8e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.785399  normal  0.461526 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1077  elongation factor P  40.64 
 
 		 187 aa  167  1e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.212963  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2094  elongation factor P  40.54 
 
 		 213 aa  166  2e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3254  elongation factor P  40.54 
 
 		 187 aa  166  2.9999999999999998e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.310404  normal  0.360922 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1987  elongation factor P  40 
 
 		 187 aa  164  6.9999999999999995e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3217  elongation factor P  40.54 
 
 		 188 aa  164  1.0000000000000001e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1958  elongation factor P  39.25 
 
 		 187 aa  164  1.0000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2589  translation elongation factor P (EF-P)  42.25 
 
 		 188 aa  162  2.0000000000000002e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.626789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2021  elongation factor P  39.67 
 
 		 187 aa  153  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2743  elongation factor P  36.22 
 
 		 187 aa  150  1e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.481823 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0248  elongation factor P  39.67 
 
 		 187 aa  150  2e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.72476  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1891  elongation factor P  39.67 
 
 		 187 aa  150  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.271867  normal  0.405804 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0301  translation elongation factor P (EF-P)  40.22 
 
 		 189 aa  148  5e-35  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0777  translation elongation factor P  40.22 
 
 		 189 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.155438  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1581  elongation factor P  41.9 
 
 		 185 aa  142  4e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000212505  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1268  translation elongation factor P  37.84 
 
 		 188 aa  138  7e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0851  translation elongation factor P  37.1 
 
 		 186 aa  137  7.999999999999999e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0977  translation elongation factor P  37.1 
 
 		 186 aa  137  7.999999999999999e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.025181 
 
 
-
 
NC_002978  WD1281  translation elongation factor P  36.07 
 
 		 188 aa  136  3.0000000000000003e-31  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2128  elongation factor P  35.36 
 
 		 185 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000767038  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0233  elongation factor P  37.57 
 
 		 185 aa  129  3e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1717  translation elongation factor P (EF-P)  34.59 
 
 		 188 aa  128  8.000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0425827 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1538  elongation factor P  34.78 
 
 		 185 aa  127  9.000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.112402 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0664  translation elongation factor P  34.97 
 
 		 185 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2339  elongation factor P  36.46 
 
 		 185 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1037  elongation factor P  35.23 
 
 		 185 aa  125  4.0000000000000003e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.429569  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0196  translation elongation factor P  34.59 
 
 		 191 aa  123  2e-27  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101901  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0132  elongation factor P  33.7 
 
 		 188 aa  122  3e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2565  elongation factor P  34.43 
 
 		 185 aa  122  4e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.870653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1042  translation elongation factor P  33.51 
 
 		 190 aa  122  5e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000205263  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1523  elongation factor P  34.97 
 
 		 185 aa  121  6e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2021  translation elongation factor P  36.11 
 
 		 187 aa  121  7e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0655  elongation factor P  33.15 
 
 		 189 aa  120  9.999999999999999e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1379  elongation factor P  33.15 
 
 		 189 aa  120  9.999999999999999e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1458  translation elongation factor P (EF-P)  34.43 
 
 		 185 aa  120  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0677588  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0576  elongation factor P  33.15 
 
 		 189 aa  120  9.999999999999999e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.925832  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3519  elongation factor P  32.07 
 
 		 185 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.8476e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3606  translation elongation factor P (EF-P)  33.33 
 
 		 186 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.169587 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1247  elongation factor P  34.08 
 
 		 189 aa  120  1.9999999999999998e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1795  translation elongation factor P  32.61 
 
 		 185 aa  119  3e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1313  elongation factor P  34.43 
 
 		 185 aa  119  3e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2417  elongation factor P  34.62 
 
 		 187 aa  119  3e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.149803  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0927  elongation factor P  35.36 
 
 		 185 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2891  elongation factor P  35.36 
 
 		 185 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.780726  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4171  translation elongation factor P  35.91 
 
 		 187 aa  119  3.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.374404  normal  0.818087 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0376  elongation factor P  33.15 
 
 		 188 aa  118  4.9999999999999996e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4307  elongation factor P  34.81 
 
 		 185 aa  118  7e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1187  elongation factor P  32.6 
 
 		 189 aa  118  7e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1705  translation elongation factor P  32.6 
 
 		 187 aa  118  7e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.215577  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4327  elongation factor P  34.81 
 
 		 185 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4270  elongation factor P  34.81 
 
 		 185 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4101  elongation factor P  34.81 
 
 		 185 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00461512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3939  elongation factor P  34.81 
 
 		 185 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3950  elongation factor P  34.81 
 
 		 185 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000574802  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2358  elongation factor P  34.97 
 
 		 187 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0880785  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2489  elongation factor P  35.14 
 
 		 187 aa  117  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4217  elongation factor P  34.81 
 
 		 185 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.691003 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4421  elongation factor P  34.81 
 
 		 185 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1570  elongation factor P  34.25 
 
 		 188 aa  117  9.999999999999999e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1274  elongation factor P  32.97 
 
 		 188 aa  115  3e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3765  elongation factor P  32.79 
 
 		 188 aa  116  3e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1838  translation elongation factor P  34.44 
 
 		 187 aa  116  3e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.464834  normal  0.192185 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0511  elongation factor P  33.7 
 
 		 187 aa  115  3e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0033  elongation factor P  31.15 
 
 		 187 aa  115  3.9999999999999997e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2270  elongation factor P  32.78 
 
 		 187 aa  115  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.155082  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>