More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2102 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2102  elongation factor P  100 
 
 		 187 aa  384  1e-106  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0533599  hitchhiker  0.00367804 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3184  elongation factor P  74.33 
 
 		 187 aa  298  2e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.509533  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1710  elongation factor P  74.19 
 
 		 186 aa  296  1e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.820092  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1652  elongation factor P  74.73 
 
 		 186 aa  295  2e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.397183  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0158  elongation factor P  72.97 
 
 		 190 aa  295  3e-79  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1206  elongation factor P  73.12 
 
 		 211 aa  293  7e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.593204  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3217  elongation factor P  70.43 
 
 		 188 aa  276  1e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2589  translation elongation factor P (EF-P)  68.09 
 
 		 188 aa  273  1.0000000000000001e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.626789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2094  elongation factor P  70.27 
 
 		 213 aa  273  1.0000000000000001e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3710  elongation factor P  68.28 
 
 		 189 aa  272  2.0000000000000002e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0822316 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3254  elongation factor P  70.27 
 
 		 187 aa  272  2.0000000000000002e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.310404  normal  0.360922 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1987  elongation factor P  68.65 
 
 		 187 aa  269  2e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2980  elongation factor P  65.24 
 
 		 187 aa  259  1e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.279152 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2021  elongation factor P  64.67 
 
 		 187 aa  248  3e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2743  elongation factor P  61.08 
 
 		 187 aa  244  6e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.481823 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0248  elongation factor P  63.04 
 
 		 187 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.72476  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1891  elongation factor P  63.04 
 
 		 187 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.271867  normal  0.405804 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1314  elongation factor P  60.43 
 
 		 187 aa  239  1e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.785399  normal  0.461526 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1958  elongation factor P  59.36 
 
 		 187 aa  237  6.999999999999999e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1077  elongation factor P  51.08 
 
 		 187 aa  217  6e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.212963  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1706  elongation factor P  55.91 
 
 		 188 aa  207  5e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0608317  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1500  elongation factor P  54.3 
 
 		 188 aa  204  8e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.627549 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4012  elongation factor P  46.24 
 
 		 188 aa  188  5e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0379  elongation factor P  45.7 
 
 		 188 aa  186  1e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.399775 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3478  elongation factor P  46.77 
 
 		 189 aa  186  1e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.619484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2404  elongation factor P  45.16 
 
 		 188 aa  186  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.474133 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1884  elongation factor P  45.16 
 
 		 188 aa  185  3e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2792  elongation factor P  43.55 
 
 		 188 aa  185  4e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.113127  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3194  elongation factor P  45.7 
 
 		 188 aa  185  4e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3230  elongation factor P  44.62 
 
 		 188 aa  184  9e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.444474 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3799  elongation factor P  46.77 
 
 		 189 aa  184  9e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.282842  normal  0.601984 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6026  elongation factor P  45.7 
 
 		 189 aa  183  1.0000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.524609  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0851  translation elongation factor P  47.31 
 
 		 186 aa  183  1.0000000000000001e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0977  translation elongation factor P  47.31 
 
 		 186 aa  183  1.0000000000000001e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.025181 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2131  elongation factor P  44.09 
 
 		 188 aa  182  3e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.648865 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0479  elongation factor P  44.09 
 
 		 188 aa  182  3e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4128  elongation factor P  45.7 
 
 		 189 aa  181  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.593775  normal  0.232702 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2956  elongation factor P  41.94 
 
 		 188 aa  181  8.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3005  elongation factor P  44.51 
 
 		 186 aa  179  2e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.150691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2531  elongation factor P  42.47 
 
 		 189 aa  179  2e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0777  translation elongation factor P  45.9 
 
 		 189 aa  179  2e-44  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.155438  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2738  elongation factor P  45.16 
 
 		 188 aa  178  4.999999999999999e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.827612 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0301  translation elongation factor P (EF-P)  45.36 
 
 		 189 aa  177  5.999999999999999e-44  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0761  elongation factor P  43.01 
 
 		 188 aa  177  5.999999999999999e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.490004  normal  0.378671 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0455  elongation factor P  44.39 
 
 		 189 aa  177  5.999999999999999e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.627481 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2302  elongation factor P  43.01 
 
 		 188 aa  177  7e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0910613  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1643  elongation factor P  42.47 
 
 		 188 aa  177  8e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.666832 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3225  elongation factor P  44.92 
 
 		 189 aa  177  8e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1281  translation elongation factor P  45.86 
 
 		 188 aa  176  2e-43  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2504  elongation factor P  40.32 
 
 		 188 aa  175  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.279878  normal  0.485445 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2809  elongation factor P  40.86 
 
 		 216 aa  174  9e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.158684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1313  elongation factor P  44.81 
 
 		 185 aa  167  6e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5084  elongation factor P  45.9 
 
 		 185 aa  167  8e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2565  elongation factor P  45.36 
 
 		 185 aa  166  1e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.870653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1268  translation elongation factor P  45.95 
 
 		 188 aa  166  2e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00251  elongation factor P  43.78 
 
 		 186 aa  164  5.9999999999999996e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4101  elongation factor P  44.02 
 
 		 185 aa  164  9e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00461512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3939  elongation factor P  44.02 
 
 		 185 aa  164  9e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3950  elongation factor P  44.02 
 
 		 185 aa  164  9e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000574802  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4421  elongation factor P  44.02 
 
 		 185 aa  164  9e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4217  elongation factor P  44.02 
 
 		 185 aa  164  9e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.691003 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4327  elongation factor P  44.02 
 
 		 185 aa  163  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4270  elongation factor P  44.02 
 
 		 185 aa  163  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00301  elongation factor P  44.81 
 
 		 186 aa  163  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0679  translation elongation factor P  44.26 
 
 		 185 aa  163  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0708926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0026  elongation factor P  43.72 
 
 		 186 aa  162  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00251  elongation factor P  43.72 
 
 		 186 aa  162  3e-39  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.202091  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4307  elongation factor P  43.48 
 
 		 185 aa  161  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0196  translation elongation factor P  43.32 
 
 		 191 aa  161  6e-39  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101901  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2891  elongation factor P  44.02 
 
 		 185 aa  161  6e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.780726  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0810  translation elongation factor P  44.81 
 
 		 185 aa  160  8.000000000000001e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0927  elongation factor P  42.93 
 
 		 185 aa  160  9e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1849  elongation factor P  45.3 
 
 		 185 aa  160  1e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.583476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3145  translation elongation factor P  44.2 
 
 		 185 aa  159  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027119 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00251  elongation factor P  43.72 
 
 		 187 aa  159  2e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1655  elongation factor P  43.01 
 
 		 207 aa  159  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.668126 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1353  elongation factor P  43.72 
 
 		 187 aa  158  3e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2315  elongation factor P  44.26 
 
 		 185 aa  158  5e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3009  elongation factor P  41.21 
 
 		 211 aa  157  6e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.144718 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1795  translation elongation factor P  41.3 
 
 		 185 aa  158  6e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4050  elongation factor P  42.93 
 
 		 185 aa  157  7e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2270  elongation factor P  40.11 
 
 		 187 aa  157  8e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.155082  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00251  elongation factor P  42.08 
 
 		 186 aa  156  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2339  elongation factor P  41.85 
 
 		 185 aa  157  1e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1093  elongation factor P  40.76 
 
 		 185 aa  156  2e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0547  elongation factor P  43.17 
 
 		 185 aa  156  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3519  elongation factor P  39.67 
 
 		 185 aa  156  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.8476e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2007  elongation factor P  40.56 
 
 		 187 aa  156  2e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000960288 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0564  elongation factor P  43.17 
 
 		 185 aa  156  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0233  elongation factor P  41.85 
 
 		 185 aa  156  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00261  elongation factor P  42.62 
 
 		 186 aa  155  3e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.382229  normal  0.051277 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0029  elongation factor P  43.17 
 
 		 186 aa  155  3e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0033  elongation factor P  43.72 
 
 		 187 aa  155  3e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3606  translation elongation factor P (EF-P)  40.86 
 
 		 186 aa  155  4e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.169587 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2853  elongation factor P  43.96 
 
 		 186 aa  154  6e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0148324  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17910  translation elongation factor P (EF-P)  40.66 
 
 		 187 aa  154  6e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.272241  normal  0.645314 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1538  elongation factor P  41.85 
 
 		 185 aa  154  7e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.112402 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2693  elongation factor P  39.67 
 
 		 185 aa  154  1e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1042  translation elongation factor P  40.22 
 
 		 190 aa  153  1e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000205263  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1390  translation elongation factor P  42.86 
 
 		 186 aa  153  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.842759  normal  0.106183 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>