More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0874 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_0874  Elongation factor P  100 
 
 		 188 aa  384  1e-106  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2575  translation elongation factor P  41.34 
 
 		 185 aa  160  1e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.156985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1705  translation elongation factor P  32.04 
 
 		 187 aa  129  3e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.215577  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1082  translation elongation factor P (EF-P)  32.98 
 
 		 189 aa  122  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.160371 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0673  translation elongation factor P  34.62 
 
 		 192 aa  122  3e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3606  translation elongation factor P (EF-P)  35.14 
 
 		 186 aa  122  3e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.169587 
 
 
-
 
NC_002950  PG1274  elongation factor P  34.97 
 
 		 188 aa  122  4e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2417  elongation factor P  33.33 
 
 		 187 aa  122  4e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.149803  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0568  elongation factor P  34.97 
 
 		 188 aa  121  6e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1054  elongation factor P  33.86 
 
 		 189 aa  121  6e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.636587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0761  elongation factor P  33.7 
 
 		 188 aa  121  6e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.490004  normal  0.378671 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1329  translation elongation factor P  33.15 
 
 		 187 aa  120  1.9999999999999998e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.708183  normal  0.80129 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2544  translation elongation factor P  29.35 
 
 		 186 aa  119  1.9999999999999998e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0481189  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08176  translation elongation factor P  35.68 
 
 		 188 aa  119  1.9999999999999998e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.838989  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2404  elongation factor P  35.87 
 
 		 188 aa  119  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.474133 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0479  elongation factor P  36.41 
 
 		 188 aa  119  3e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2131  elongation factor P  36.41 
 
 		 188 aa  119  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.648865 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1034  translation elongation factor P  35 
 
 		 185 aa  119  3e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3206  elongation factor P  31.11 
 
 		 187 aa  119  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0890237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2901  elongation factor P  32.97 
 
 		 188 aa  117  7.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0923486  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0920  translation elongation factor P  33.15 
 
 		 187 aa  117  9.999999999999999e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07870  translation elongation factor P  30.48 
 
 		 187 aa  117  9.999999999999999e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.884317  hitchhiker  0.00530797 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1093  elongation factor P  32.42 
 
 		 187 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2393  translation elongation factor P  32.22 
 
 		 187 aa  116  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1758  elongation factor P  31.32 
 
 		 188 aa  115  3e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.141605  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1458  translation elongation factor P (EF-P)  33.33 
 
 		 185 aa  115  3e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0677588  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3478  elongation factor P  32.8 
 
 		 189 aa  115  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.619484  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0879  translation elongation factor P  33.88 
 
 		 216 aa  115  3.9999999999999997e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.351022 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2891  elongation factor P  33.15 
 
 		 185 aa  115  5e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.780726  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1884  elongation factor P  33.33 
 
 		 188 aa  115  5e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1660  translation elongation factor P  34.25 
 
 		 186 aa  114  6e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2792  elongation factor P  33.87 
 
 		 188 aa  114  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.113127  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0748  elongation factor P  30.85 
 
 		 189 aa  114  6.9999999999999995e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.305929  hitchhiker  0.000261541 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3411  elongation factor P  34.62 
 
 		 187 aa  113  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.186085  normal  0.564269 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0547  elongation factor P  35.2 
 
 		 185 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0851  translation elongation factor P  32.61 
 
 		 186 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0977  translation elongation factor P  32.61 
 
 		 186 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.025181 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0564  elongation factor P  35.2 
 
 		 185 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03678  elongation factor P  31.91 
 
 		 189 aa  113  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.107744  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2738  elongation factor P  34.78 
 
 		 188 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.827612 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1061  elongation factor P  33.33 
 
 		 190 aa  112  3e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0927  elongation factor P  33.15 
 
 		 185 aa  112  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1523  elongation factor P  35 
 
 		 185 aa  112  3e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1702  elongation factor P  33.33 
 
 		 187 aa  112  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.452132  normal  0.100351 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17910  translation elongation factor P (EF-P)  28.18 
 
 		 187 aa  112  4.0000000000000004e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.272241  normal  0.645314 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1538  elongation factor P  31.67 
 
 		 185 aa  112  4.0000000000000004e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.112402 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5247  translation elongation factor P  32.42 
 
 		 187 aa  112  5e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.956535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4307  elongation factor P  32.61 
 
 		 185 aa  111  6e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4050  elongation factor P  32.61 
 
 		 185 aa  111  7.000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4101  elongation factor P  32.61 
 
 		 185 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00461512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3939  elongation factor P  32.61 
 
 		 185 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3950  elongation factor P  32.61 
 
 		 185 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000574802  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4421  elongation factor P  32.61 
 
 		 185 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5249  translation elongation factor P  29.83 
 
 		 187 aa  111  8.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2531  translation elongation factor P (EF-P)  31.91 
 
 		 188 aa  110  8.000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.218639  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4217  elongation factor P  32.61 
 
 		 185 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.691003 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4270  elongation factor P  32.61 
 
 		 185 aa  110  9e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4327  elongation factor P  32.61 
 
 		 185 aa  110  9e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0714  hypothetical protein  32.24 
 
 		 190 aa  110  1.0000000000000001e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.469656 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5084  elongation factor P  31.84 
 
 		 185 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1713  translation elongation factor P  31.67 
 
 		 189 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15510  elongation factor P  31.28 
 
 		 185 aa  110  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.285367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2943  translation elongation factor P  30.73 
 
 		 185 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000799114  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0082  elongation factor P  29.28 
 
 		 188 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0077  elongation factor P  30.39 
 
 		 190 aa  110  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000164055 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4283  translation elongation factor P  30.39 
 
 		 187 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.496625 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1953  elongation factor P  31.28 
 
 		 185 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000000145103  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3009  elongation factor P  30.39 
 
 		 211 aa  109  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.144718 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3519  elongation factor P  32.4 
 
 		 185 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.8476e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1518  elongation factor P  32.97 
 
 		 187 aa  109  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0357828 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2234  elongation factor P  32.62 
 
 		 188 aa  108  3e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1052  translation elongation factor P  31.67 
 
 		 185 aa  109  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000883108  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12650  translation elongation factor P (EF-P)  29.28 
 
 		 199 aa  109  3e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0427626  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1838  translation elongation factor P  29.83 
 
 		 187 aa  109  3e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.464834  normal  0.192185 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2853  elongation factor P  31.11 
 
 		 186 aa  108  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0148324  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2270  elongation factor P  28.73 
 
 		 187 aa  108  3e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.155082  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1842  elongation factor P  31.28 
 
 		 185 aa  108  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.145946  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1320  elongation factor P  31.55 
 
 		 188 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3148  translation elongation factor P  29.83 
 
 		 186 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2693  elongation factor P  30.73 
 
 		 185 aa  108  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0468  translation elongation factor P  28.88 
 
 		 187 aa  108  4.0000000000000004e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.019587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4171  translation elongation factor P  34.25 
 
 		 187 aa  108  4.0000000000000004e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.374404  normal  0.818087 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0664  translation elongation factor P  32.78 
 
 		 185 aa  108  5e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3194  elongation factor P  31.52 
 
 		 188 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1581  elongation factor P  31.69 
 
 		 185 aa  108  7.000000000000001e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000212505  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00251  elongation factor P  33.7 
 
 		 186 aa  107  8.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3230  elongation factor P  31.72 
 
 		 188 aa  107  9.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.444474 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0972  translation elongation factor P  29.57 
 
 		 191 aa  107  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0899  translation elongation factor P  31.38 
 
 		 191 aa  107  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1741  translation elongation factor P  30.65 
 
 		 188 aa  107  1e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2339  elongation factor P  29.89 
 
 		 185 aa  107  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0684  elongation factor P  30.85 
 
 		 189 aa  107  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1390  translation elongation factor P  31.36 
 
 		 186 aa  107  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.842759  normal  0.106183 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0486  elongation factor P  32.46 
 
 		 191 aa  106  2e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000541045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05180  translation elongation factor P (EF-P)  26.09 
 
 		 186 aa  106  2e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2956  elongation factor P  32.4 
 
 		 188 aa  106  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4150  translation elongation factor P  31.32 
 
 		 188 aa  106  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.399759 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0379  elongation factor P  32.07 
 
 		 188 aa  106  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.399775 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00251  elongation factor P  32.6 
 
 		 186 aa  106  2e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.202091  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00251  elongation factor P  33.15 
 
 		 186 aa  106  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>