48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0409 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0409  translation initiation factor IF-5A  100 
 
 		 132 aa  264  2.9999999999999995e-70  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0895  translation initiation factor IF-5A  68.94 
 
 		 132 aa  180  6e-45  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.354636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1571  translation initiation factor IF-5A  63.64 
 
 		 132 aa  177  2.9999999999999997e-44  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0581  translation initiation factor IF-5A  62.12 
 
 		 132 aa  175  2e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00138219 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1751  translation initiation factor IF-5A  60.61 
 
 		 132 aa  174  4e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000442771  hitchhiker  0.00446575 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0434  translation initiation factor IF-5A  60.61 
 
 		 132 aa  172  9.999999999999999e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1756  translation initiation factor IF-5A  60.16 
 
 		 131 aa  159  2e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.455468  normal  0.26313 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1949  translation initiation factor eIF-5A  54.96 
 
 		 131 aa  157  3e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.735179  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0003  translation initiation factor eIF-5A  55.38 
 
 		 131 aa  145  2.0000000000000003e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1703  translation initiation factor IF-5A  51.56 
 
 		 131 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0915  translation initiation factor IF-5A  50.39 
 
 		 131 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0759  translation initiation factor IF-5A  46.88 
 
 		 131 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.824142  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0199  translation initiation factor IF-5A  47.66 
 
 		 131 aa  126  8.000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0237  translation initiation factor IF-5A  44.96 
 
 		 131 aa  123  1e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.676894  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0529  translation initiation factor eIF-5A  42.65 
 
 		 136 aa  121  3e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1350  translation initiation factor eIF-5A  50.41 
 
 		 125 aa  121  4e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0722695  normal  0.0450814 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1897  translation initiation factor IF-5A  44.63 
 
 		 127 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.397681  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0695  translation initiation factor IF-5A  44.63 
 
 		 128 aa  108  3e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.612946  normal  0.300408 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2581  translation initiation factor IF-5A  42.97 
 
 		 124 aa  108  3e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.257819  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1686  translation initiation factor IF-5A  45.45 
 
 		 127 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.230293  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2337  translation initiation factor eIF-5A  44.63 
 
 		 125 aa  107  5e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.316005 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1604  translation initiation factor eIF-5A  41.41 
 
 		 124 aa  104  4e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0966  translation initiation factor eIF-5A  42.15 
 
 		 125 aa  104  4e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0904  translation initiation factor IF-5A  41.32 
 
 		 127 aa  104  4e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0110821  normal  0.486202 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0426  translation initiation factor 5A (eIF-5A)  40.5 
 
 		 151 aa  104  5e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.609574 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1207  translation initiation factor eIF-5A  43.48 
 
 		 124 aa  103  6e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.165485  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1578  translation initiation factor IF-5A  41.53 
 
 		 125 aa  100  6e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.238981 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3103  translation initiation factor eIF-5A  37.5 
 
 		 124 aa  96.7  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17954  predicted protein  33.33 
 
 		 158 aa  77.8  0.00000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13807  predicted protein  32 
 
 		 165 aa  69.7  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0443254  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05400  initiation factor 5a (eif-5a), putative  31.37 
 
 		 158 aa  64.7  0.0000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.470767  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04015  eukaryotic translation initiation factor 5A-2 (Broad)  30.77 
 
 		 159 aa  63.2  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78463  Eukaryotic translation initiation factor 5A (eIF-5A) (eIF-4D)  29.37 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1379  elongation factor P  32.73 
 
 		 189 aa  45.8  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0655  elongation factor P  32.73 
 
 		 189 aa  45.8  0.0002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0576  elongation factor P  32.73 
 
 		 189 aa  45.8  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.925832  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1061  elongation factor P  29.46 
 
 		 185 aa  45.1  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1051  elongation factor P  29.46 
 
 		 185 aa  45.1  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0908  elongation factor P  28.18 
 
 		 188 aa  44.7  0.0004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1187  elongation factor P  31.82 
 
 		 189 aa  43.1  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1715  elongation factor P  31.75 
 
 		 186 aa  41.2  0.004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000224452  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0011  elongation factor P  26.79 
 
 		 185 aa  41.2  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000000591354  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0519  translation elongation factor P  24.56 
 
 		 184 aa  40.4  0.008  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1858  elongation factor P  25.71 
 
 		 189 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.453569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0132  elongation factor P  30.17 
 
 		 188 aa  40  0.009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3856  elongation factor P  25.71 
 
 		 189 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.198418  normal  0.116801 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1433  elongation factor P  24.76 
 
 		 189 aa  40  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279879 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1468  elongation factor P  24.76 
 
 		 189 aa  40  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>