34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2337 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2337  translation initiation factor eIF-5A  100 
 
 		 125 aa  253  9e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.316005 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1350  translation initiation factor eIF-5A  76 
 
 		 125 aa  206  7e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0722695  normal  0.0450814 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0904  translation initiation factor IF-5A  70.4 
 
 		 127 aa  191  3e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0110821  normal  0.486202 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0966  translation initiation factor eIF-5A  68 
 
 		 125 aa  183  6e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0426  translation initiation factor 5A (eIF-5A)  61.9 
 
 		 151 aa  167  4e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.609574 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1897  translation initiation factor IF-5A  61.6 
 
 		 127 aa  166  9e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.397681  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1686  translation initiation factor IF-5A  60.8 
 
 		 127 aa  157  4e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.230293  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0695  translation initiation factor IF-5A  54.4 
 
 		 128 aa  149  1e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.612946  normal  0.300408 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0003  translation initiation factor eIF-5A  54.17 
 
 		 131 aa  136  8.999999999999999e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2581  translation initiation factor IF-5A  49.59 
 
 		 124 aa  131  3e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.257819  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1604  translation initiation factor eIF-5A  47.97 
 
 		 124 aa  128  2.0000000000000002e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3103  translation initiation factor eIF-5A  46.34 
 
 		 124 aa  125  1.0000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1207  translation initiation factor eIF-5A  47.15 
 
 		 124 aa  122  2e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.165485  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1578  translation initiation factor IF-5A  45.53 
 
 		 125 aa  119  9.999999999999999e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.238981 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0434  translation initiation factor IF-5A  47.32 
 
 		 132 aa  113  6.9999999999999995e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1751  translation initiation factor IF-5A  48.21 
 
 		 132 aa  113  6.9999999999999995e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000442771  hitchhiker  0.00446575 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0915  translation initiation factor IF-5A  43.7 
 
 		 131 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0895  translation initiation factor IF-5A  45.83 
 
 		 132 aa  113  1.0000000000000001e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.354636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1571  translation initiation factor IF-5A  48.65 
 
 		 132 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0581  translation initiation factor IF-5A  52.13 
 
 		 132 aa  111  3e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00138219 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0529  translation initiation factor eIF-5A  42.62 
 
 		 136 aa  103  6e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1756  translation initiation factor IF-5A  40 
 
 		 131 aa  103  9e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.455468  normal  0.26313 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1703  translation initiation factor IF-5A  42.02 
 
 		 131 aa  102  2e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0409  translation initiation factor IF-5A  46.46 
 
 		 132 aa  101  4e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1949  translation initiation factor eIF-5A  36.89 
 
 		 131 aa  100  6e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.735179  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0237  translation initiation factor IF-5A  39.47 
 
 		 131 aa  99.8  1e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.676894  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0199  translation initiation factor IF-5A  39.5 
 
 		 131 aa  98.2  4e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0759  translation initiation factor IF-5A  36.67 
 
 		 131 aa  96.3  1e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.824142  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17954  predicted protein  44.58 
 
 		 158 aa  74.3  0.0000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05400  initiation factor 5a (eif-5a), putative  32.23 
 
 		 158 aa  60.5  0.000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.470767  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04015  eukaryotic translation initiation factor 5A-2 (Broad)  34.74 
 
 		 159 aa  60.5  0.000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13807  predicted protein  32.82 
 
 		 165 aa  57.8  0.00000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0443254  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78463  Eukaryotic translation initiation factor 5A (eIF-5A) (eIF-4D)  31.15 
 
 		 156 aa  57.8  0.00000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0132  elongation factor P  31 
 
 		 188 aa  41.2  0.004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>