45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0529 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0529  translation initiation factor eIF-5A  100 
 
 		 136 aa  279  8.000000000000001e-75  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1751  translation initiation factor IF-5A  48.53 
 
 		 132 aa  130  6e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000442771  hitchhiker  0.00446575 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0434  translation initiation factor IF-5A  46.32 
 
 		 132 aa  130  9e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1703  translation initiation factor IF-5A  47.37 
 
 		 131 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0759  translation initiation factor IF-5A  47.37 
 
 		 131 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.824142  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0003  translation initiation factor eIF-5A  49.61 
 
 		 131 aa  129  2.0000000000000002e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1571  translation initiation factor IF-5A  46.32 
 
 		 132 aa  128  3e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0199  translation initiation factor IF-5A  45.86 
 
 		 131 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0581  translation initiation factor IF-5A  45.59 
 
 		 132 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00138219 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0237  translation initiation factor IF-5A  44.36 
 
 		 131 aa  122  2e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.676894  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1756  translation initiation factor IF-5A  45.45 
 
 		 131 aa  121  4e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.455468  normal  0.26313 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0915  translation initiation factor IF-5A  44.36 
 
 		 131 aa  120  8e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1949  translation initiation factor eIF-5A  42.42 
 
 		 131 aa  120  9e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.735179  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0904  translation initiation factor IF-5A  44.27 
 
 		 127 aa  116  9.999999999999999e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0110821  normal  0.486202 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0895  translation initiation factor IF-5A  44.85 
 
 		 132 aa  116  9.999999999999999e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.354636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0966  translation initiation factor eIF-5A  44.27 
 
 		 125 aa  111  3e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1350  translation initiation factor eIF-5A  44.27 
 
 		 125 aa  111  3e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0722695  normal  0.0450814 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3103  translation initiation factor eIF-5A  43.75 
 
 		 124 aa  110  5e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0409  translation initiation factor IF-5A  42.65 
 
 		 132 aa  108  3e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0695  translation initiation factor IF-5A  41.22 
 
 		 128 aa  107  6e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.612946  normal  0.300408 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1686  translation initiation factor IF-5A  44.27 
 
 		 127 aa  104  5e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.230293  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2337  translation initiation factor eIF-5A  42.62 
 
 		 125 aa  103  6e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.316005 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1604  translation initiation factor eIF-5A  40.62 
 
 		 124 aa  102  1e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2581  translation initiation factor IF-5A  40.62 
 
 		 124 aa  102  1e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.257819  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1897  translation initiation factor IF-5A  40.46 
 
 		 127 aa  100  6e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.397681  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0426  translation initiation factor 5A (eIF-5A)  36.64 
 
 		 151 aa  99.8  1e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.609574 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1207  translation initiation factor eIF-5A  41.73 
 
 		 124 aa  100  1e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.165485  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1578  translation initiation factor IF-5A  40.71 
 
 		 125 aa  95.1  3e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.238981 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17954  predicted protein  31.97 
 
 		 158 aa  66.6  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05400  initiation factor 5a (eif-5a), putative  31.9 
 
 		 158 aa  61.6  0.000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.470767  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04015  eukaryotic translation initiation factor 5A-2 (Broad)  32.41 
 
 		 159 aa  57.8  0.00000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78463  Eukaryotic translation initiation factor 5A (eIF-5A) (eIF-4D)  28.43 
 
 		 156 aa  54.3  0.0000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13807  predicted protein  31.52 
 
 		 165 aa  50.8  0.000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0443254  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0622  translation elongation factor P  35.64 
 
 		 187 aa  48.1  0.00004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.449055  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0908  elongation factor P  33.75 
 
 		 188 aa  47  0.00009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0576  elongation factor P  33.64 
 
 		 189 aa  44.7  0.0004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.925832  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0655  elongation factor P  33.64 
 
 		 189 aa  44.7  0.0004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1379  elongation factor P  33.64 
 
 		 189 aa  44.7  0.0004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0132  elongation factor P  34.58 
 
 		 188 aa  44.7  0.0004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1187  elongation factor P  32.67 
 
 		 189 aa  42.4  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1570  elongation factor P  33.66 
 
 		 188 aa  42  0.003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0511  elongation factor P  33.66 
 
 		 187 aa  42  0.003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_41511  predicted protein  28.83 
 
 		 227 aa  41.2  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0285567  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2853  elongation factor P  30.11 
 
 		 186 aa  41.2  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0148324  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1247  elongation factor P  32.67 
 
 		 189 aa  40.8  0.007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>