More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_41511 on replicon NC_011699
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011699  PHATRDRAFT_41511  predicted protein  100 
 
 
227 aa  454  1e-127  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0285567  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0664  translation elongation factor P  44.02 
 
 
185 aa  170  2e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0077  elongation factor P  37.23 
 
 
190 aa  161  6e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000164055 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1523  elongation factor P  43.09 
 
 
185 aa  161  9e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1301  elongation factor P  39.89 
 
 
185 aa  161  9e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.105101  normal  0.268628 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0468  elongation factor P  37.16 
 
 
185 aa  160  2e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0449395  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1660  translation elongation factor P  41.3 
 
 
186 aa  160  2e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06150  translation elongation factor P  39.13 
 
 
186 aa  159  4e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4171  translation elongation factor P  41.08 
 
 
187 aa  158  6e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.374404  normal  0.818087 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1538  elongation factor P  39.89 
 
 
185 aa  155  3e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.112402 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1313  elongation factor P  38.25 
 
 
185 aa  155  4e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0810  translation elongation factor P  39.89 
 
 
185 aa  155  7e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1052  translation elongation factor P  41.85 
 
 
185 aa  152  5e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000883108  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2565  elongation factor P  39.34 
 
 
185 aa  151  8.999999999999999e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.870653  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0441  elongation factor P  40.44 
 
 
189 aa  150  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0948  translation elongation factor P (EF-P)  41.11 
 
 
187 aa  150  2e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00103286  decreased coverage  0.000108298 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1421  elongation factor P  37.57 
 
 
185 aa  150  2e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.556639  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0511  elongation factor P  40.43 
 
 
187 aa  149  3e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2531  translation elongation factor P (EF-P)  41.21 
 
 
188 aa  149  3e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.218639  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2161  elongation factor P  39.23 
 
 
187 aa  149  4e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0365  elongation factor P  39.13 
 
 
189 aa  149  4e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2315  elongation factor P  37.16 
 
 
185 aa  149  5e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1570  elongation factor P  40.98 
 
 
188 aa  149  5e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1741  translation elongation factor P  40.44 
 
 
188 aa  149  5e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0847  elongation factor P  39.13 
 
 
185 aa  148  7e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000412318  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1187  elongation factor P  38.25 
 
 
189 aa  148  7e-35  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0622  translation elongation factor P  41.62 
 
 
187 aa  148  8e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.449055  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1042  translation elongation factor P  36.9 
 
 
190 aa  148  8e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000205263  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1247  elongation factor P  39.67 
 
 
189 aa  148  8e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4726  translation elongation factor P  38.04 
 
 
185 aa  147  9e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0198786  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2529  translation elongation factor P  39.13 
 
 
185 aa  148  9e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0006044  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0132  elongation factor P  36.61 
 
 
188 aa  147  1.0000000000000001e-34  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0340  elongation factor P  38.04 
 
 
189 aa  147  1.0000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1838  elongation factor P  39.23 
 
 
187 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118087  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1953  elongation factor P  40.33 
 
 
185 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000000145103  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1717  translation elongation factor P (EF-P)  39.67 
 
 
188 aa  146  2.0000000000000003e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0425827 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2055  elongation factor P  38.67 
 
 
187 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1005  translation elongation factor P  37.7 
 
 
185 aa  146  2.0000000000000003e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1379  elongation factor P  38.25 
 
 
189 aa  146  3e-34  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0655  elongation factor P  38.25 
 
 
189 aa  146  3e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3519  elongation factor P  37.16 
 
 
185 aa  146  3e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.8476e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0576  elongation factor P  38.25 
 
 
189 aa  146  3e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.925832  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0029  elongation factor P  38.92 
 
 
186 aa  145  4.0000000000000006e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00251  elongation factor P  38.38 
 
 
186 aa  145  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4612  elongation factor P  39.01 
 
 
188 aa  145  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4604  elongation factor P  39.01 
 
 
188 aa  145  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.724396  normal  0.715091 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4695  elongation factor P  39.01 
 
 
188 aa  145  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0684  elongation factor P  39.56 
 
 
189 aa  145  6e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0546  translation elongation factor P  38.04 
 
 
185 aa  145  6e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4752  elongation factor P  39.01 
 
 
188 aa  145  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.69408 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4731  elongation factor P  39.01 
 
 
188 aa  145  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1037  elongation factor P  37.16 
 
 
185 aa  145  7.0000000000000006e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.429569  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0547  elongation factor P  38.25 
 
 
185 aa  144  9e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0564  elongation factor P  38.25 
 
 
185 aa  144  9e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2480  elongation factor P  39.78 
 
 
185 aa  144  9e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.272577  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0233  elongation factor P  38.25 
 
 
185 aa  144  9e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4270  elongation factor P  36.61 
 
 
185 aa  144  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0033  elongation factor P  39.46 
 
 
187 aa  144  1e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4327  elongation factor P  36.61 
 
 
185 aa  144  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2147  elongation factor P  38.12 
 
 
187 aa  144  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000102512  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1705  translation elongation factor P  37.5 
 
 
187 aa  144  1e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.215577  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04017  elongation factor P  39.01 
 
 
188 aa  143  2e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3845  translation elongation factor P  39.01 
 
 
188 aa  143  2e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4217  elongation factor P  36.61 
 
 
185 aa  143  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.691003 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4616  elongation factor P  39.01 
 
 
188 aa  143  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.23769 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4101  elongation factor P  36.61 
 
 
185 aa  143  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00461512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3939  elongation factor P  36.61 
 
 
185 aa  143  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3950  elongation factor P  36.61 
 
 
185 aa  143  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000574802  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5663  elongation factor P  39.01 
 
 
188 aa  143  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.140312 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1353  elongation factor P  38.25 
 
 
187 aa  143  2e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0372  elongation factor P  37.02 
 
 
185 aa  143  2e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.146381 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4421  elongation factor P  36.61 
 
 
185 aa  143  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4389  elongation factor P  39.01 
 
 
188 aa  143  2e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4704  elongation factor P  39.01 
 
 
188 aa  143  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03678  elongation factor P  39.13 
 
 
189 aa  143  2e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.107744  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0845  elongation factor P  38.8 
 
 
185 aa  144  2e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2339  elongation factor P  37.16 
 
 
185 aa  143  2e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0466  elongation factor P  39.01 
 
 
188 aa  143  2e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4677  elongation factor P  39.01 
 
 
188 aa  143  2e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03979  hypothetical protein  39.01 
 
 
188 aa  143  2e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3865  elongation factor P  39.01 
 
 
188 aa  143  2e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.334824 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4307  elongation factor P  36.07 
 
 
185 aa  143  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00251  elongation factor P  38.25 
 
 
187 aa  143  2e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1320  elongation factor P  40.22 
 
 
188 aa  142  3e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1093  elongation factor P  38.59 
 
 
187 aa  143  3e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2792  elongation factor P  40 
 
 
188 aa  143  3e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00201072  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2891  elongation factor P  36.61 
 
 
185 aa  142  3e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.780726  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1542  translation elongation factor P  36.61 
 
 
184 aa  142  4e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0036789  normal  0.0365403 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17910  translation elongation factor P (EF-P)  35.87 
 
 
187 aa  142  4e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.272241  normal  0.645314 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0679  translation elongation factor P  37.16 
 
 
185 aa  142  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0708926  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0927  elongation factor P  35.52 
 
 
185 aa  142  5e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2128  elongation factor P  38.04 
 
 
185 aa  142  5e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000767038  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1752  elongation factor P  37.57 
 
 
187 aa  141  7e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000421728  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0972  translation elongation factor P  37.57 
 
 
191 aa  141  7e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0026  elongation factor P  37.3 
 
 
186 aa  141  8e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1082  translation elongation factor P (EF-P)  36.07 
 
 
189 aa  141  8e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.160371 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1054  elongation factor P  40.76 
 
 
189 aa  141  8e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.636587  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0356  elongation factor P  35.45 
 
 
194 aa  141  9e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.142965  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1913  elongation factor P  37.77 
 
 
187 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000066721  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4050  elongation factor P  35.52 
 
 
185 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>