More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0356 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0356  elongation factor P  100 
 
 		 194 aa  394  1e-109  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.142965  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1061  elongation factor P  64.21 
 
 		 190 aa  248  3e-65  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0664  translation elongation factor P  47.83 
 
 		 185 aa  192  2e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1660  translation elongation factor P  50.3 
 
 		 186 aa  191  6e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1538  elongation factor P  49.18 
 
 		 185 aa  189  2.9999999999999997e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.112402 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0077  elongation factor P  44.68 
 
 		 190 aa  186  1e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000164055 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0233  elongation factor P  46.99 
 
 		 185 aa  185  4e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2339  elongation factor P  46.99 
 
 		 185 aa  184  5e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06150  translation elongation factor P  46.74 
 
 		 186 aa  183  1.0000000000000001e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2693  elongation factor P  46.45 
 
 		 185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1717  translation elongation factor P (EF-P)  47.28 
 
 		 188 aa  183  2.0000000000000003e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0425827 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1523  elongation factor P  50 
 
 		 185 aa  182  3e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2128  elongation factor P  49.44 
 
 		 185 aa  182  3e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000767038  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1037  elongation factor P  51.37 
 
 		 185 aa  181  6e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.429569  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0693  translation elongation factor P  42.55 
 
 		 190 aa  181  7e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0648  translation elongation factor P (EF-P)  41.49 
 
 		 190 aa  180  1e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.581307  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0682  translation elongation factor P  41.49 
 
 		 190 aa  179  2e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0682  translation elongation factor P  41.49 
 
 		 190 aa  179  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1313  elongation factor P  46.99 
 
 		 185 aa  177  5.999999999999999e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0673  translation elongation factor P  46.03 
 
 		 192 aa  177  7e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0684  elongation factor P  45.3 
 
 		 189 aa  175  4e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2565  elongation factor P  46.99 
 
 		 185 aa  174  5e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.870653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2626  elongation factor P  47.02 
 
 		 189 aa  174  9e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0748  elongation factor P  41.4 
 
 		 189 aa  174  9e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.305929  hitchhiker  0.000261541 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1052  translation elongation factor P  42.39 
 
 		 185 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000883108  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0333  elongation factor P  45.86 
 
 		 188 aa  172  1.9999999999999998e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000340238 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1795  translation elongation factor P  46.45 
 
 		 185 aa  172  1.9999999999999998e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2531  translation elongation factor P (EF-P)  44.75 
 
 		 188 aa  171  3.9999999999999995e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.218639  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1005  translation elongation factor P  42.08 
 
 		 185 aa  171  3.9999999999999995e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1082  translation elongation factor P (EF-P)  46.2 
 
 		 189 aa  171  7.999999999999999e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.160371 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0719  elongation factor P  43.09 
 
 		 188 aa  171  7.999999999999999e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3672  elongation factor P  43.09 
 
 		 188 aa  171  7.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3818  elongation factor P  43.09 
 
 		 188 aa  171  7.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.145028  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0045  elongation factor P  43.33 
 
 		 188 aa  170  1e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2015  elongation factor P  43.33 
 
 		 188 aa  170  1e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4604  elongation factor P  44.2 
 
 		 188 aa  169  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.724396  normal  0.715091 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4695  elongation factor P  44.2 
 
 		 188 aa  169  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4731  elongation factor P  44.2 
 
 		 188 aa  169  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4612  elongation factor P  44.2 
 
 		 188 aa  169  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4752  elongation factor P  44.2 
 
 		 188 aa  169  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.69408 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0622  translation elongation factor P  44.02 
 
 		 187 aa  169  3e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.449055  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0026  elongation factor P  44.26 
 
 		 186 aa  169  3e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00251  elongation factor P  44.81 
 
 		 186 aa  169  3e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04017  elongation factor P  44.2 
 
 		 188 aa  168  4e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3845  translation elongation factor P  44.2 
 
 		 188 aa  168  4e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4389  elongation factor P  44.2 
 
 		 188 aa  168  4e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03979  hypothetical protein  44.2 
 
 		 188 aa  168  4e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3865  elongation factor P  44.2 
 
 		 188 aa  168  4e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.334824 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4704  elongation factor P  44.2 
 
 		 188 aa  168  4e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0847  elongation factor P  47.67 
 
 		 185 aa  168  4e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000412318  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4616  elongation factor P  44.2 
 
 		 188 aa  168  4e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.23769 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1576  elongation factor P  42.31 
 
 		 188 aa  168  4e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5663  elongation factor P  44.2 
 
 		 188 aa  168  4e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.140312 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0546  translation elongation factor P  42.93 
 
 		 185 aa  168  4e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4677  elongation factor P  44.2 
 
 		 188 aa  168  4e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0655  elongation factor P  41.99 
 
 		 189 aa  168  5e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1379  elongation factor P  41.99 
 
 		 189 aa  168  5e-41  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0576  elongation factor P  41.99 
 
 		 189 aa  168  5e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.925832  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00251  elongation factor P  44.26 
 
 		 186 aa  167  6e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.202091  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0679  translation elongation factor P  43.72 
 
 		 185 aa  167  7e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0708926  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0466  elongation factor P  43.09 
 
 		 188 aa  167  8e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0340  elongation factor P  44.58 
 
 		 189 aa  167  9e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1713  translation elongation factor P  42.55 
 
 		 189 aa  167  1e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00251  elongation factor P  44.26 
 
 		 186 aa  167  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1353  elongation factor P  44.81 
 
 		 187 aa  166  2e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0376  elongation factor P  41.99 
 
 		 188 aa  166  2e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00251  elongation factor P  44.81 
 
 		 187 aa  166  2e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1187  elongation factor P  41.99 
 
 		 189 aa  166  2e-40  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1247  elongation factor P  41.44 
 
 		 189 aa  166  2e-40  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3519  elongation factor P  43.72 
 
 		 185 aa  166  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.8476e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0033  elongation factor P  44.81 
 
 		 187 aa  165  2.9999999999999998e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0810  translation elongation factor P  43.17 
 
 		 185 aa  165  4e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0365  elongation factor P  43.98 
 
 		 189 aa  165  4e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1093  elongation factor P  46.47 
 
 		 187 aa  165  4e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0564  elongation factor P  44.26 
 
 		 185 aa  165  4e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0547  elongation factor P  44.26 
 
 		 185 aa  165  4e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2792  elongation factor P  42.93 
 
 		 188 aa  165  4e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00201072  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4307  elongation factor P  42.08 
 
 		 185 aa  165  4e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4050  elongation factor P  42.62 
 
 		 185 aa  165  5e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1320  elongation factor P  42.6 
 
 		 188 aa  164  5e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0511  elongation factor P  41.3 
 
 		 187 aa  164  5.9999999999999996e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1922  elongation factor P  48.19 
 
 		 186 aa  164  5.9999999999999996e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.775944  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5084  elongation factor P  44.81 
 
 		 185 aa  164  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1232  translation elongation factor P  44.97 
 
 		 187 aa  164  6.9999999999999995e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.120458  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0927  elongation factor P  42.08 
 
 		 185 aa  164  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0412  elongation factor P  41.44 
 
 		 188 aa  164  8e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000757192 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0899  translation elongation factor P  46.75 
 
 		 191 aa  164  8e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002232  translation elongation factor P  40.76 
 
 		 188 aa  164  9e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4217  elongation factor P  42.08 
 
 		 185 aa  163  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.691003 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4101  elongation factor P  42.08 
 
 		 185 aa  163  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00461512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3939  elongation factor P  42.08 
 
 		 185 aa  163  1.0000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2234  elongation factor P  41.3 
 
 		 188 aa  163  1.0000000000000001e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3950  elongation factor P  42.08 
 
 		 185 aa  163  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000574802  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00301  elongation factor P  43.17 
 
 		 186 aa  163  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2315  elongation factor P  42.62 
 
 		 185 aa  163  1.0000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4421  elongation factor P  42.08 
 
 		 185 aa  163  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1633  elongation factor P  42.31 
 
 		 187 aa  164  1.0000000000000001e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2891  elongation factor P  41.53 
 
 		 185 aa  163  1.0000000000000001e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.780726  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1979  elongation factor P  41.11 
 
 		 189 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4270  elongation factor P  42.08 
 
 		 185 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>