72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0434 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0434  translation initiation factor IF-5A  100 
 
 		 132 aa  262  8.999999999999999e-70  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1571  translation initiation factor IF-5A  95.45 
 
 		 132 aa  256  8e-68  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1751  translation initiation factor IF-5A  93.18 
 
 		 132 aa  253  7e-67  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000442771  hitchhiker  0.00446575 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0581  translation initiation factor IF-5A  92.42 
 
 		 132 aa  248  1e-65  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00138219 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0895  translation initiation factor IF-5A  62.88 
 
 		 132 aa  186  8e-47  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.354636  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1949  translation initiation factor eIF-5A  61.36 
 
 		 131 aa  162  1.0000000000000001e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.735179  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1756  translation initiation factor IF-5A  57.58 
 
 		 131 aa  156  9e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.455468  normal  0.26313 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0409  translation initiation factor IF-5A  60.61 
 
 		 132 aa  155  2e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0003  translation initiation factor eIF-5A  52.67 
 
 		 131 aa  139  1.9999999999999998e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0529  translation initiation factor eIF-5A  46.32 
 
 		 136 aa  130  9e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1350  translation initiation factor eIF-5A  47.97 
 
 		 125 aa  122  2e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0722695  normal  0.0450814 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1897  translation initiation factor IF-5A  49.59 
 
 		 127 aa  120  9e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.397681  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2581  translation initiation factor IF-5A  48.84 
 
 		 124 aa  119  9.999999999999999e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.257819  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0237  translation initiation factor IF-5A  46.15 
 
 		 131 aa  118  1.9999999999999998e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.676894  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1686  translation initiation factor IF-5A  46.34 
 
 		 127 aa  118  3e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.230293  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0966  translation initiation factor eIF-5A  48.36 
 
 		 125 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0915  translation initiation factor IF-5A  46.51 
 
 		 131 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0759  translation initiation factor IF-5A  46.51 
 
 		 131 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.824142  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0695  translation initiation factor IF-5A  52.03 
 
 		 128 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.612946  normal  0.300408 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1703  translation initiation factor IF-5A  45.38 
 
 		 131 aa  115  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0904  translation initiation factor IF-5A  45.08 
 
 		 127 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0110821  normal  0.486202 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1207  translation initiation factor eIF-5A  48.84 
 
 		 124 aa  115  3e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.165485  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3103  translation initiation factor eIF-5A  47.29 
 
 		 124 aa  114  3.9999999999999997e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2337  translation initiation factor eIF-5A  47.32 
 
 		 125 aa  113  6.9999999999999995e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.316005 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0199  translation initiation factor IF-5A  43.85 
 
 		 131 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0426  translation initiation factor 5A (eIF-5A)  43.9 
 
 		 151 aa  111  3e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.609574 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1604  translation initiation factor eIF-5A  46.51 
 
 		 124 aa  109  1.0000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1578  translation initiation factor IF-5A  52.08 
 
 		 125 aa  103  7e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.238981 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17954  predicted protein  38 
 
 		 158 aa  78.6  0.00000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05400  initiation factor 5a (eif-5a), putative  36.9 
 
 		 158 aa  67  0.00000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.470767  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04015  eukaryotic translation initiation factor 5A-2 (Broad)  34.83 
 
 		 159 aa  64.3  0.0000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78463  Eukaryotic translation initiation factor 5A (eIF-5A) (eIF-4D)  36.14 
 
 		 156 aa  63.9  0.0000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13807  predicted protein  31.15 
 
 		 165 aa  63.5  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0443254  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0233  elongation factor P  31.07 
 
 		 185 aa  48.5  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf281  elongation factor P  31.68 
 
 		 185 aa  47.8  0.00005  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0172375  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1379  elongation factor P  32.14 
 
 		 189 aa  46.6  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0655  elongation factor P  32.14 
 
 		 189 aa  46.6  0.0001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0576  elongation factor P  32.14 
 
 		 189 aa  46.6  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.925832  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0132  elongation factor P  31.73 
 
 		 188 aa  45.8  0.0002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0622  translation elongation factor P  30.39 
 
 		 187 aa  46.2  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.449055  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2339  elongation factor P  29.13 
 
 		 185 aa  45.4  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3145  translation elongation factor P  31.25 
 
 		 185 aa  45.1  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027119 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1187  elongation factor P  31.25 
 
 		 189 aa  45.1  0.0004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1051  elongation factor P  32.58 
 
 		 185 aa  44.7  0.0005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl407  translation elongation factor P  29.13 
 
 		 185 aa  44.3  0.0005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0519  translation elongation factor P  29.7 
 
 		 184 aa  44.7  0.0005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1061  elongation factor P  32.58 
 
 		 185 aa  44.7  0.0005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1301  elongation factor P  29.41 
 
 		 185 aa  44.3  0.0006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.105101  normal  0.268628 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1660  translation elongation factor P  30.68 
 
 		 186 aa  43.5  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0908  elongation factor P  28.16 
 
 		 188 aa  43.5  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1570  elongation factor P  30.77 
 
 		 188 aa  43.1  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1305  elongation factor P  29.7 
 
 		 187 aa  42.7  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.656375  normal  0.0587891 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1849  elongation factor P  31.82 
 
 		 185 aa  42.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.583476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0748  elongation factor P  29.13 
 
 		 189 aa  42.7  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.305929  hitchhiker  0.000261541 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3999  elongation factor P  29.47 
 
 		 189 aa  41.6  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000867749  normal  0.464968 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1838  translation elongation factor P  30.69 
 
 		 187 aa  41.6  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.464834  normal  0.192185 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0011  elongation factor P  28.95 
 
 		 185 aa  41.6  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000000591354  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1093  elongation factor P  28.07 
 
 		 185 aa  41.6  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1468  elongation factor P  29.13 
 
 		 189 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1433  elongation factor P  29.13 
 
 		 189 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279879 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0511  elongation factor P  29.67 
 
 		 187 aa  41.2  0.005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1715  elongation factor P  30.77 
 
 		 186 aa  41.2  0.005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000224452  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3628  elongation factor P  27.37 
 
 		 189 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000158679  normal  0.046264 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1765  translation elongation factor P  27.37 
 
 		 189 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2480  elongation factor P  27.55 
 
 		 185 aa  40.8  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.272577  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3856  elongation factor P  29.13 
 
 		 189 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.198418  normal  0.116801 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1858  elongation factor P  29.13 
 
 		 189 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.453569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1620  elongation factor P  27.19 
 
 		 185 aa  40.4  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000025141  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1587  elongation factor P  27.19 
 
 		 185 aa  40.4  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00812845  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0920  translation elongation factor P  27.72 
 
 		 187 aa  40.4  0.008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1247  elongation factor P  28.57 
 
 		 189 aa  40  0.01  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0968  translation elongation factor P  25.44 
 
 		 187 aa  40  0.01  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>