41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0904 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_0904  translation initiation factor IF-5A  100 
 
 		 127 aa  257  4e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0110821  normal  0.486202 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2337  translation initiation factor eIF-5A  70.4 
 
 		 125 aa  191  3e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.316005 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1350  translation initiation factor eIF-5A  64 
 
 		 125 aa  182  2.0000000000000003e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0722695  normal  0.0450814 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0966  translation initiation factor eIF-5A  66.4 
 
 		 125 aa  176  8e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0426  translation initiation factor 5A (eIF-5A)  65.35 
 
 		 151 aa  175  2e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.609574 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1897  translation initiation factor IF-5A  60.32 
 
 		 127 aa  166  1e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.397681  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1686  translation initiation factor IF-5A  57.94 
 
 		 127 aa  157  4e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.230293  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0695  translation initiation factor IF-5A  55.56 
 
 		 128 aa  151  4e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.612946  normal  0.300408 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0003  translation initiation factor eIF-5A  53.78 
 
 		 131 aa  140  6e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2581  translation initiation factor IF-5A  52.03 
 
 		 124 aa  139  1.9999999999999998e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.257819  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3103  translation initiation factor eIF-5A  46.34 
 
 		 124 aa  126  8.000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1604  translation initiation factor eIF-5A  45.53 
 
 		 124 aa  126  1.0000000000000001e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1207  translation initiation factor eIF-5A  47.15 
 
 		 124 aa  123  1e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.165485  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0529  translation initiation factor eIF-5A  44.27 
 
 		 136 aa  116  9.999999999999999e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0581  translation initiation factor IF-5A  45.08 
 
 		 132 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00138219 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0434  translation initiation factor IF-5A  45.08 
 
 		 132 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1751  translation initiation factor IF-5A  44.26 
 
 		 132 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000442771  hitchhiker  0.00446575 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1578  translation initiation factor IF-5A  48 
 
 		 125 aa  114  3.9999999999999997e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.238981 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0915  translation initiation factor IF-5A  42.86 
 
 		 131 aa  114  6e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1571  translation initiation factor IF-5A  44.26 
 
 		 132 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0895  translation initiation factor IF-5A  46.23 
 
 		 132 aa  110  5e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.354636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1756  translation initiation factor IF-5A  42.62 
 
 		 131 aa  110  7.000000000000001e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.455468  normal  0.26313 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1703  translation initiation factor IF-5A  43.7 
 
 		 131 aa  110  7.000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1949  translation initiation factor eIF-5A  40.98 
 
 		 131 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.735179  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0237  translation initiation factor IF-5A  40.34 
 
 		 131 aa  107  6e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.676894  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0199  translation initiation factor IF-5A  41.18 
 
 		 131 aa  105  1e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0759  translation initiation factor IF-5A  39.17 
 
 		 131 aa  105  3e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.824142  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0409  translation initiation factor IF-5A  41.32 
 
 		 132 aa  101  3e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17954  predicted protein  43.37 
 
 		 158 aa  77.8  0.00000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05400  initiation factor 5a (eif-5a), putative  29.82 
 
 		 158 aa  59.3  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.470767  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04015  eukaryotic translation initiation factor 5A-2 (Broad)  30.95 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78463  Eukaryotic translation initiation factor 5A (eIF-5A) (eIF-4D)  31.71 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13807  predicted protein  29.73 
 
 		 165 aa  48.5  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0443254  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1717  translation elongation factor P (EF-P)  32.71 
 
 		 188 aa  44.7  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0425827 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1379  elongation factor P  31.25 
 
 		 189 aa  42  0.003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0655  elongation factor P  31.25 
 
 		 189 aa  42  0.003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0576  elongation factor P  31.25 
 
 		 189 aa  42  0.003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.925832  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0132  elongation factor P  29.35 
 
 		 188 aa  40.8  0.007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1581  elongation factor P  32.22 
 
 		 185 aa  40.8  0.007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000212505  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2480  elongation factor P  32.97 
 
 		 185 aa  40.4  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.272577  n/a   
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_41511  predicted protein  30.21 
 
 		 227 aa  40.4  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0285567  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>