38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2581 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_2581  translation initiation factor IF-5A  100 
 
 		 124 aa  254  3e-67  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.257819  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1604  translation initiation factor eIF-5A  89.52 
 
 		 124 aa  233  5.0000000000000005e-61  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3103  translation initiation factor eIF-5A  81.45 
 
 		 124 aa  215  2e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1207  translation initiation factor eIF-5A  81.45 
 
 		 124 aa  208  2e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.165485  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1578  translation initiation factor IF-5A  78.23 
 
 		 125 aa  206  6e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.238981 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1897  translation initiation factor IF-5A  54.47 
 
 		 127 aa  140  7e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.397681  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1350  translation initiation factor eIF-5A  50.41 
 
 		 125 aa  140  8e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0722695  normal  0.0450814 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0904  translation initiation factor IF-5A  52.03 
 
 		 127 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0110821  normal  0.486202 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0966  translation initiation factor eIF-5A  49.59 
 
 		 125 aa  133  7.000000000000001e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0003  translation initiation factor eIF-5A  51.59 
 
 		 131 aa  132  9.999999999999999e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2337  translation initiation factor eIF-5A  49.59 
 
 		 125 aa  131  3e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.316005 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0426  translation initiation factor 5A (eIF-5A)  46.77 
 
 		 151 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.609574 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1686  translation initiation factor IF-5A  50.43 
 
 		 127 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.230293  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1949  translation initiation factor eIF-5A  48.44 
 
 		 131 aa  124  6e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.735179  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1756  translation initiation factor IF-5A  46.09 
 
 		 131 aa  122  2e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.455468  normal  0.26313 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0695  translation initiation factor IF-5A  47.83 
 
 		 128 aa  120  7e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.612946  normal  0.300408 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1751  translation initiation factor IF-5A  48.84 
 
 		 132 aa  119  9.999999999999999e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000442771  hitchhiker  0.00446575 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0434  translation initiation factor IF-5A  48.84 
 
 		 132 aa  119  9.999999999999999e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0581  translation initiation factor IF-5A  49.22 
 
 		 132 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00138219 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1571  translation initiation factor IF-5A  48.06 
 
 		 132 aa  115  9.999999999999999e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0895  translation initiation factor IF-5A  41.98 
 
 		 132 aa  107  4.0000000000000004e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.354636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0409  translation initiation factor IF-5A  45.28 
 
 		 132 aa  105  2e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0529  translation initiation factor eIF-5A  40.62 
 
 		 136 aa  102  1e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0759  translation initiation factor IF-5A  37.82 
 
 		 131 aa  97.4  6e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.824142  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0915  translation initiation factor IF-5A  38.66 
 
 		 131 aa  97.1  8e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1703  translation initiation factor IF-5A  38.74 
 
 		 131 aa  95.9  2e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0199  translation initiation factor IF-5A  37.84 
 
 		 131 aa  92.4  2e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0237  translation initiation factor IF-5A  36.94 
 
 		 131 aa  91.3  4e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.676894  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17954  predicted protein  31.33 
 
 		 158 aa  57.8  0.00000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05400  initiation factor 5a (eif-5a), putative  31.91 
 
 		 158 aa  53.9  0.0000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.470767  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04015  eukaryotic translation initiation factor 5A-2 (Broad)  36.62 
 
 		 159 aa  53.1  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78463  Eukaryotic translation initiation factor 5A (eIF-5A) (eIF-4D)  30.85 
 
 		 156 aa  50.8  0.000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13807  predicted protein  28.17 
 
 		 165 aa  42.7  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0443254  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1301  elongation factor P  28.42 
 
 		 185 aa  41.2  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.105101  normal  0.268628 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1570  elongation factor P  35.29 
 
 		 188 aa  40.8  0.007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1421  elongation factor P  28.74 
 
 		 185 aa  40.4  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.556639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2130  translation initiation factor 5A (eIF-5A)  29 
 
 		 190 aa  40.4  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0576423  normal  0.464149 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1247  elongation factor P  32.94 
 
 		 189 aa  40.4  0.007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>