70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1756 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1756  translation initiation factor IF-5A  100 
 
 		 131 aa  262  1e-69  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.455468  normal  0.26313 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1949  translation initiation factor eIF-5A  74.05 
 
 		 131 aa  214  2.9999999999999998e-55  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.735179  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0434  translation initiation factor IF-5A  57.58 
 
 		 132 aa  156  9e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1571  translation initiation factor IF-5A  57.58 
 
 		 132 aa  154  4e-37  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1751  translation initiation factor IF-5A  56.06 
 
 		 132 aa  151  4e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000442771  hitchhiker  0.00446575 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0581  translation initiation factor IF-5A  53.79 
 
 		 132 aa  148  2e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00138219 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0409  translation initiation factor IF-5A  60.16 
 
 		 132 aa  144  6e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0895  translation initiation factor IF-5A  53.03 
 
 		 132 aa  139  9.999999999999999e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.354636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0003  translation initiation factor eIF-5A  50.41 
 
 		 131 aa  134  4e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0915  translation initiation factor IF-5A  53.66 
 
 		 131 aa  126  8.000000000000001e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0759  translation initiation factor IF-5A  50.39 
 
 		 131 aa  126  9.000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.824142  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0237  translation initiation factor IF-5A  49.61 
 
 		 131 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.676894  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2581  translation initiation factor IF-5A  46.09 
 
 		 124 aa  122  2e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.257819  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1703  translation initiation factor IF-5A  48.06 
 
 		 131 aa  120  4e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0529  translation initiation factor eIF-5A  45.45 
 
 		 136 aa  121  4e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0199  translation initiation factor IF-5A  47.29 
 
 		 131 aa  120  9e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1207  translation initiation factor eIF-5A  46.88 
 
 		 124 aa  118  1.9999999999999998e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.165485  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1578  translation initiation factor IF-5A  46.28 
 
 		 125 aa  117  3.9999999999999996e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.238981 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1604  translation initiation factor eIF-5A  44.53 
 
 		 124 aa  117  3.9999999999999996e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1350  translation initiation factor eIF-5A  46.72 
 
 		 125 aa  117  4.9999999999999996e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0722695  normal  0.0450814 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3103  translation initiation factor eIF-5A  43.75 
 
 		 124 aa  115  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0966  translation initiation factor eIF-5A  43.33 
 
 		 125 aa  111  3e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0904  translation initiation factor IF-5A  42.62 
 
 		 127 aa  110  7.000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0110821  normal  0.486202 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1897  translation initiation factor IF-5A  43.33 
 
 		 127 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.397681  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1686  translation initiation factor IF-5A  45.3 
 
 		 127 aa  105  3e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.230293  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0426  translation initiation factor 5A (eIF-5A)  36.67 
 
 		 151 aa  103  7e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.609574 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0695  translation initiation factor IF-5A  43.33 
 
 		 128 aa  103  9e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.612946  normal  0.300408 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2337  translation initiation factor eIF-5A  40 
 
 		 125 aa  103  9e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.316005 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17954  predicted protein  38.68 
 
 		 158 aa  80.9  0.000000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05400  initiation factor 5a (eif-5a), putative  29.25 
 
 		 158 aa  66.2  0.0000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.470767  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13807  predicted protein  31.25 
 
 		 165 aa  65.5  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0443254  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04015  eukaryotic translation initiation factor 5A-2 (Broad)  28.68 
 
 		 159 aa  63.9  0.0000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78463  Eukaryotic translation initiation factor 5A (eIF-5A) (eIF-4D)  35.29 
 
 		 156 aa  62.4  0.000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0341  elongation factor P  31.45 
 
 		 187 aa  53.5  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000484075  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1305  elongation factor P  33.93 
 
 		 187 aa  49.7  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.656375  normal  0.0587891 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1660  translation elongation factor P  31.25 
 
 		 186 aa  47.8  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1187  elongation factor P  35.29 
 
 		 189 aa  46.6  0.0001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0099  elongation factor P  30.3 
 
 		 187 aa  46.6  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000893399  normal  0.296683 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0011  elongation factor P  30.91 
 
 		 185 aa  46.2  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000000591354  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0519  translation elongation factor P  29.79 
 
 		 184 aa  45.4  0.0002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4726  translation elongation factor P  29.36 
 
 		 185 aa  46.2  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0198786  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0655  elongation factor P  33.98 
 
 		 189 aa  45.8  0.0002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0576  elongation factor P  33.98 
 
 		 189 aa  45.8  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.925832  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1379  elongation factor P  33.98 
 
 		 189 aa  45.8  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0132  elongation factor P  35.11 
 
 		 188 aa  45.1  0.0003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0908  elongation factor P  33.64 
 
 		 188 aa  44.3  0.0005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1523  elongation factor P  32.71 
 
 		 185 aa  44.3  0.0006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0465  elongation factor P  30.21 
 
 		 187 aa  43.9  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000040903  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1247  elongation factor P  33.01 
 
 		 189 aa  43.1  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl407  translation elongation factor P  27.66 
 
 		 185 aa  42.7  0.001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0415  elongation factor P  30.91 
 
 		 187 aa  42.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1570  elongation factor P  33.65 
 
 		 188 aa  42.4  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0622  translation elongation factor P  33.33 
 
 		 187 aa  42.4  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.449055  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0233  elongation factor P  30.91 
 
 		 185 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1051  elongation factor P  29 
 
 		 185 aa  42.7  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5084  elongation factor P  33.33 
 
 		 185 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0415  elongation factor P  30.91 
 
 		 187 aa  42.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00396498  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1061  elongation factor P  29 
 
 		 185 aa  42.7  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0684  elongation factor P  26.05 
 
 		 187 aa  42  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0550  elongation factor P  24.17 
 
 		 187 aa  42  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  4.38651e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1005  translation elongation factor P  29.55 
 
 		 185 aa  41.2  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15510  elongation factor P  27.43 
 
 		 185 aa  41.2  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.285367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1795  translation elongation factor P  33.7 
 
 		 185 aa  41.2  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3303  elongation factor P  30.69 
 
 		 187 aa  41.2  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.122821  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0511  elongation factor P  32.69 
 
 		 187 aa  40.4  0.007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0547  elongation factor P  37.93 
 
 		 185 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1849  elongation factor P  29.46 
 
 		 185 aa  40.4  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.583476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0564  elongation factor P  37.93 
 
 		 185 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0094  elongation factor P  30.77 
 
 		 185 aa  40.4  0.008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1061  elongation factor P  24.77 
 
 		 190 aa  40  0.009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>