More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0415 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0415  elongation factor P  100 
 
 		 187 aa  384  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00396498  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0415  elongation factor P  98.4 
 
 		 187 aa  382  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0341  elongation factor P  85.03 
 
 		 187 aa  339  1e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000484075  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3303  elongation factor P  83.42 
 
 		 187 aa  335  2.9999999999999997e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.122821  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0099  elongation factor P  82.35 
 
 		 187 aa  323  9e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000893399  normal  0.296683 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0465  elongation factor P  76.47 
 
 		 187 aa  307  6.999999999999999e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000040903  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0684  elongation factor P  77.54 
 
 		 187 aa  306  1.0000000000000001e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0550  elongation factor P  66.31 
 
 		 187 aa  268  4e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  4.38651e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1301  elongation factor P  44.09 
 
 		 185 aa  158  5e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.105101  normal  0.268628 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15510  elongation factor P  43.85 
 
 		 185 aa  158  5e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.285367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1421  elongation factor P  44.09 
 
 		 185 aa  155  4e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.556639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1587  elongation factor P  43.32 
 
 		 185 aa  153  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00812845  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4050  elongation factor P  43.85 
 
 		 185 aa  152  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1620  elongation factor P  43.32 
 
 		 185 aa  153  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000025141  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0790  elongation factor P/YeiP  38.83 
 
 		 188 aa  152  4e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4307  elongation factor P  44.39 
 
 		 185 aa  150  8e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0664  translation elongation factor P  43.32 
 
 		 185 aa  150  8.999999999999999e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4270  elongation factor P  43.85 
 
 		 185 aa  150  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4327  elongation factor P  43.85 
 
 		 185 aa  150  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3148  translation elongation factor P  40.64 
 
 		 186 aa  150  1e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0372  elongation factor P  41.4 
 
 		 185 aa  149  2e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.146381 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2339  elongation factor P  42.78 
 
 		 185 aa  149  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4101  elongation factor P  43.85 
 
 		 185 aa  149  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00461512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3939  elongation factor P  43.85 
 
 		 185 aa  149  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3950  elongation factor P  43.85 
 
 		 185 aa  149  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000574802  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4217  elongation factor P  43.85 
 
 		 185 aa  149  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.691003 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4421  elongation factor P  43.85 
 
 		 185 aa  149  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0927  elongation factor P  43.85 
 
 		 185 aa  149  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1093  elongation factor P  42.25 
 
 		 185 aa  149  3e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1752  elongation factor P  40.11 
 
 		 187 aa  148  6e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000421728  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1538  elongation factor P  40.64 
 
 		 185 aa  147  7e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.112402 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1204  elongation factor P  41.4 
 
 		 185 aa  146  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0186048  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0233  elongation factor P  41.71 
 
 		 185 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2891  elongation factor P  42.25 
 
 		 185 aa  145  3e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.780726  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1842  elongation factor P  41.71 
 
 		 185 aa  144  5e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.145946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3145  translation elongation factor P  40.64 
 
 		 185 aa  144  7.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027119 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1953  elongation factor P  40.86 
 
 		 185 aa  144  8.000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000000145103  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1763  elongation factor P  39.04 
 
 		 187 aa  144  8.000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00363755  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1849  elongation factor P  40.64 
 
 		 185 aa  142  3e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.583476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1838  elongation factor P  39.57 
 
 		 187 aa  142  4e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2480  elongation factor P  39.78 
 
 		 185 aa  142  4e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.272577  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2651  elongation factor P  40.32 
 
 		 187 aa  142  4e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0077  elongation factor P  37.5 
 
 		 190 aa  141  7e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000164055 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5249  translation elongation factor P  39.78 
 
 		 187 aa  140  8e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0564  elongation factor P  40.32 
 
 		 185 aa  140  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2853  elongation factor P  39.57 
 
 		 186 aa  140  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0148324  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0547  elongation factor P  40.32 
 
 		 185 aa  140  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2693  elongation factor P  39.57 
 
 		 185 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1005  translation elongation factor P  38.5 
 
 		 185 aa  140  9.999999999999999e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5084  elongation factor P  38.17 
 
 		 185 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2399  elongation factor P  39.25 
 
 		 187 aa  139  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.212662 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3206  elongation factor P  38.17 
 
 		 187 aa  139  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0890237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2358  elongation factor P  39.25 
 
 		 187 aa  139  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.69717  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2417  elongation factor P  38.71 
 
 		 187 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.149803  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2405  elongation factor P  39.25 
 
 		 187 aa  139  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.576459  normal  0.0550099 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2147  elongation factor P  37.1 
 
 		 187 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000102512  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3752  elongation factor P  38.71 
 
 		 187 aa  139  3e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.180351 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1305  elongation factor P  39.57 
 
 		 187 aa  139  3e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.656375  normal  0.0587891 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12554  elongation factor P  39.78 
 
 		 187 aa  138  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0185944 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2021  translation elongation factor P  40.64 
 
 		 187 aa  138  4.999999999999999e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1702  elongation factor P  38.17 
 
 		 187 aa  137  7e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.452132  normal  0.100351 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1705  translation elongation factor P  38.17 
 
 		 187 aa  137  7e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.215577  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0094  elongation factor P  39.57 
 
 		 185 aa  137  1e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2358  elongation factor P  36.9 
 
 		 187 aa  137  1e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0880785  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2590  translation elongation factor P  38.17 
 
 		 187 aa  137  1e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.993931  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1051  elongation factor P  40.64 
 
 		 185 aa  137  1e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1061  elongation factor P  40.64 
 
 		 185 aa  137  1e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06150  translation elongation factor P  39.36 
 
 		 186 aa  136  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4283  translation elongation factor P  38.17 
 
 		 187 aa  135  4e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.496625 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1082  translation elongation factor P  38.89 
 
 		 190 aa  135  4e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.314487  normal  0.0381782 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2031  translation elongation factor P  39.25 
 
 		 186 aa  135  5e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0283739 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1795  translation elongation factor P  37.97 
 
 		 185 aa  135  5e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1838  translation elongation factor P  39.25 
 
 		 187 aa  134  8e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.464834  normal  0.192185 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0365  elongation factor P  39.57 
 
 		 189 aa  134  9e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2055  elongation factor P  36.56 
 
 		 187 aa  134  9e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2544  translation elongation factor P  38.59 
 
 		 186 aa  134  9.999999999999999e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0481189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2451  elongation factor P  37.04 
 
 		 190 aa  133  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0649907  normal  0.670538 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0340  elongation factor P  39.04 
 
 		 189 aa  133  9.999999999999999e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2448  elongation factor P  37.04 
 
 		 190 aa  133  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.264552  hitchhiker  0.000000115844 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2821  elongation factor P  37.23 
 
 		 188 aa  133  9.999999999999999e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000145694 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2405  elongation factor P  37.04 
 
 		 190 aa  133  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000243209 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2562  elongation factor P  37.04 
 
 		 190 aa  133  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.015045  decreased coverage  0.0000164335 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1313  elongation factor P  36.56 
 
 		 185 aa  133  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1542  translation elongation factor P  39.04 
 
 		 184 aa  133  9.999999999999999e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0036789  normal  0.0365403 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00261  elongation factor P  39.25 
 
 		 186 aa  134  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.382229  normal  0.051277 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2489  elongation factor P  37.43 
 
 		 187 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4171  translation elongation factor P  39.04 
 
 		 187 aa  133  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.374404  normal  0.818087 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2161  elongation factor P  36.02 
 
 		 187 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2393  translation elongation factor P  37.1 
 
 		 187 aa  132  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1618  translation elongation factor P (EF-P)  38.8 
 
 		 186 aa  132  1.9999999999999998e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000274122  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00667  elongation factor P  37.77 
 
 		 191 aa  133  1.9999999999999998e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00251  elongation factor P  36.02 
 
 		 186 aa  132  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1379  elongation factor P  38.71 
 
 		 189 aa  132  3e-30  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0132  elongation factor P  38.17 
 
 		 188 aa  132  3e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0655  elongation factor P  38.71 
 
 		 189 aa  132  3e-30  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00251  elongation factor P  37.63 
 
 		 187 aa  132  3e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0576  elongation factor P  38.71 
 
 		 189 aa  132  3e-30  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.925832  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1390  translation elongation factor P  36.9 
 
 		 186 aa  132  3e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.842759  normal  0.106183 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1187  elongation factor P  38.17 
 
 		 189 aa  132  3.9999999999999996e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1717  translation elongation factor P (EF-P)  38.71 
 
 		 188 aa  132  3.9999999999999996e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0425827 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>