More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0684 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_0684  elongation factor P  100 
 
 
187 aa  383  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0415  elongation factor P  76.47 
 
 
187 aa  306  1.0000000000000001e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0415  elongation factor P  77.54 
 
 
187 aa  306  1.0000000000000001e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00396498  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0341  elongation factor P  76.47 
 
 
187 aa  306  2.0000000000000002e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000484075  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0099  elongation factor P  78.07 
 
 
187 aa  303  1.0000000000000001e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000893399  normal  0.296683 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0465  elongation factor P  76.47 
 
 
187 aa  301  5.000000000000001e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000040903  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3303  elongation factor P  74.33 
 
 
187 aa  299  2e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.122821  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0550  elongation factor P  59.36 
 
 
187 aa  244  4e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  4.38651e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1301  elongation factor P  43.55 
 
 
185 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.105101  normal  0.268628 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4307  elongation factor P  42.78 
 
 
185 aa  143  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1421  elongation factor P  43.01 
 
 
185 aa  142  2e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.556639  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0664  translation elongation factor P  42.25 
 
 
185 aa  142  3e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0927  elongation factor P  42.25 
 
 
185 aa  142  3e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4270  elongation factor P  42.25 
 
 
185 aa  141  4e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4101  elongation factor P  42.25 
 
 
185 aa  142  4e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00461512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3939  elongation factor P  42.25 
 
 
185 aa  142  4e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3950  elongation factor P  42.25 
 
 
185 aa  142  4e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000574802  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4217  elongation factor P  42.25 
 
 
185 aa  142  4e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.691003 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0790  elongation factor P/YeiP  39.36 
 
 
188 aa  142  4e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4421  elongation factor P  42.25 
 
 
185 aa  142  4e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4327  elongation factor P  42.25 
 
 
185 aa  141  4e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15510  elongation factor P  41.18 
 
 
185 aa  140  8e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.285367  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1752  elongation factor P  39.04 
 
 
187 aa  140  9e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000421728  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3148  translation elongation factor P  40.64 
 
 
186 aa  140  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4050  elongation factor P  41.71 
 
 
185 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3145  translation elongation factor P  41.18 
 
 
185 aa  139  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0027119 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1587  elongation factor P  40.64 
 
 
185 aa  139  3e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00812845  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1620  elongation factor P  40.64 
 
 
185 aa  139  3e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000025141  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1953  elongation factor P  41.4 
 
 
185 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000000145103  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2480  elongation factor P  41.94 
 
 
185 aa  137  7.999999999999999e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.272577  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2147  elongation factor P  37.1 
 
 
187 aa  137  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000102512  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0233  elongation factor P  40.64 
 
 
185 aa  137  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0077  elongation factor P  37.5 
 
 
190 aa  137  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000164055 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0372  elongation factor P  41.4 
 
 
185 aa  137  1e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.146381 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0045  elongation factor P  40.86 
 
 
188 aa  136  2e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2015  elongation factor P  40.86 
 
 
188 aa  136  2e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2339  elongation factor P  40.11 
 
 
185 aa  136  2e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1204  elongation factor P  41.94 
 
 
185 aa  136  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0186048  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2891  elongation factor P  40.11 
 
 
185 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.780726  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1763  elongation factor P  38.5 
 
 
187 aa  135  4e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00363755  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3206  elongation factor P  39.25 
 
 
187 aa  135  5e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0890237  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1705  translation elongation factor P  38.17 
 
 
187 aa  134  5e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.215577  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1849  elongation factor P  40.11 
 
 
185 aa  134  6.0000000000000005e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.583476  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1082  translation elongation factor P (EF-P)  38.17 
 
 
189 aa  134  7.000000000000001e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.160371 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4283  translation elongation factor P  40.86 
 
 
187 aa  134  7.000000000000001e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.496625 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0466  elongation factor P  40.54 
 
 
188 aa  134  8e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1741  translation elongation factor P  40.54 
 
 
188 aa  134  9e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1305  elongation factor P  38.5 
 
 
187 aa  134  9e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.656375  normal  0.0587891 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2417  elongation factor P  38.17 
 
 
187 aa  134  9.999999999999999e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.149803  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1320  elongation factor P  40.32 
 
 
188 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2626  elongation factor P  39.78 
 
 
189 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2544  translation elongation factor P  39.67 
 
 
186 aa  132  1.9999999999999998e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0481189  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1538  elongation factor P  37.97 
 
 
185 aa  133  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.112402 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03678  elongation factor P  40.54 
 
 
189 aa  133  1.9999999999999998e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.107744  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12630  translation elongation factor P (EF-P)  39.67 
 
 
204 aa  133  1.9999999999999998e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.05803 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1581  elongation factor P  35.83 
 
 
185 aa  133  1.9999999999999998e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000212505  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2270  elongation factor P  38.71 
 
 
187 aa  133  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.155082  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2007  elongation factor P  38.71 
 
 
187 aa  132  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000960288 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1838  elongation factor P  37.43 
 
 
187 aa  132  3e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118087  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5249  translation elongation factor P  39.78 
 
 
187 aa  132  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2853  elongation factor P  37.97 
 
 
186 aa  132  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0148324  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2651  elongation factor P  38.71 
 
 
187 aa  132  3e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1329  translation elongation factor P  38.71 
 
 
187 aa  132  3.9999999999999996e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.708183  normal  0.80129 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0365  elongation factor P  39.04 
 
 
189 aa  131  5e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12554  elongation factor P  39.25 
 
 
187 aa  131  6e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0185944 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2590  translation elongation factor P  38.17 
 
 
187 aa  131  6e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.993931  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1082  translation elongation factor P  39.44 
 
 
190 aa  131  6.999999999999999e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.314487  normal  0.0381782 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5084  elongation factor P  40.64 
 
 
185 aa  130  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2089  elongation factor P  37.97 
 
 
185 aa  130  9e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0137098  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1803  elongation factor P  37.97 
 
 
185 aa  130  9e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1061  elongation factor P  40.64 
 
 
185 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0340  elongation factor P  38.5 
 
 
189 aa  130  1.0000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2693  elongation factor P  37.97 
 
 
185 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1523  elongation factor P  37.97 
 
 
185 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2399  elongation factor P  38.17 
 
 
187 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.212662 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2358  elongation factor P  38.17 
 
 
187 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.69717  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2333  translation elongation factor P  39.78 
 
 
187 aa  130  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0872984  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1051  elongation factor P  40.64 
 
 
185 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2405  elongation factor P  38.17 
 
 
187 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.576459  normal  0.0550099 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0879  translation elongation factor P  38.38 
 
 
216 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.351022 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1390  translation elongation factor P  37.43 
 
 
186 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.842759  normal  0.106183 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1093  elongation factor P  37.97 
 
 
185 aa  129  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0972  translation elongation factor P  38.71 
 
 
191 aa  129  2.0000000000000002e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3009  elongation factor P  38.59 
 
 
211 aa  129  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.144718 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3752  elongation factor P  37.63 
 
 
187 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.180351 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2031  translation elongation factor P  38.17 
 
 
186 aa  130  2.0000000000000002e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0283739 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1842  elongation factor P  39.04 
 
 
185 aa  129  3e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.145946  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1618  translation elongation factor P (EF-P)  39.34 
 
 
186 aa  129  3e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000274122  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0465  translation elongation factor P  39.46 
 
 
187 aa  128  4.0000000000000003e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.754261 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1702  elongation factor P  38.71 
 
 
187 aa  129  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.452132  normal  0.100351 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1536  elongation factor P  37.23 
 
 
188 aa  128  5.0000000000000004e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.0067814  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1838  translation elongation factor P  38.17 
 
 
187 aa  128  5.0000000000000004e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.464834  normal  0.192185 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0094  elongation factor P  39.04 
 
 
185 aa  128  5.0000000000000004e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1093  elongation factor P  37.97 
 
 
187 aa  127  7.000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1232  translation elongation factor P  41.62 
 
 
187 aa  127  8.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.120458  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1680  elongation factor P  37.97 
 
 
190 aa  127  9.000000000000001e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2489  elongation factor P  36.36 
 
 
187 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2055  elongation factor P  34.95 
 
 
187 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07870  translation elongation factor P  39.46 
 
 
187 aa  126  2.0000000000000002e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.884317  hitchhiker  0.00530797 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1950  elongation factor P  37.97 
 
 
190 aa  126  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>