More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0094 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0094  elongation factor P  100 
 
 		 185 aa  374  1e-103  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0845  elongation factor P  77.3 
 
 		 185 aa  307  4e-83  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1061  elongation factor P  72.43 
 
 		 185 aa  281  4.0000000000000003e-75  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1051  elongation factor P  72.43 
 
 		 185 aa  281  4.0000000000000003e-75  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0011  elongation factor P  65.41 
 
 		 185 aa  261  4.999999999999999e-69  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000000591354  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0748  elongation factor P  47.57 
 
 		 189 aa  191  5e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.305929  hitchhiker  0.000261541 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1660  translation elongation factor P  50 
 
 		 186 aa  189  2e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1795  translation elongation factor P  48.65 
 
 		 185 aa  189  2.9999999999999997e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0664  translation elongation factor P  47.28 
 
 		 185 aa  181  5.0000000000000004e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1037  elongation factor P  49.19 
 
 		 185 aa  179  2e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.429569  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2339  elongation factor P  44.86 
 
 		 185 aa  179  2e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1538  elongation factor P  47.03 
 
 		 185 aa  179  2e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.112402 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1523  elongation factor P  48.37 
 
 		 185 aa  178  2.9999999999999997e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2693  elongation factor P  45.41 
 
 		 185 aa  178  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1042  translation elongation factor P  43.24 
 
 		 190 aa  176  2e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000205263  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06150  translation elongation factor P  46.49 
 
 		 186 aa  176  2e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0233  elongation factor P  43.78 
 
 		 185 aa  176  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2128  elongation factor P  46.2 
 
 		 185 aa  171  5.999999999999999e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000767038  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2021  translation elongation factor P  47.03 
 
 		 187 aa  169  2e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1717  translation elongation factor P (EF-P)  43.48 
 
 		 188 aa  167  6e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0425827 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15510  elongation factor P  44.32 
 
 		 185 aa  167  8e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.285367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2943  translation elongation factor P  43.24 
 
 		 185 aa  167  9e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000799114  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3072  translation elongation factor P  43.55 
 
 		 186 aa  167  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1052  translation elongation factor P  39.13 
 
 		 185 aa  166  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000883108  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1005  translation elongation factor P  43.78 
 
 		 185 aa  165  4e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3519  elongation factor P  41.08 
 
 		 185 aa  165  4e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.8476e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1305  elongation factor P  42.16 
 
 		 187 aa  165  4e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.656375  normal  0.0587891 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1187  elongation factor P  43.41 
 
 		 189 aa  164  6.9999999999999995e-40  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0655  elongation factor P  43.41 
 
 		 189 aa  162  2.0000000000000002e-39  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0576  elongation factor P  43.41 
 
 		 189 aa  162  2.0000000000000002e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.925832  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1379  elongation factor P  43.41 
 
 		 189 aa  162  2.0000000000000002e-39  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0468  elongation factor P  39.46 
 
 		 185 aa  163  2.0000000000000002e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0449395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3145  translation elongation factor P  42.7 
 
 		 185 aa  161  5.0000000000000005e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027119 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12554  elongation factor P  41.85 
 
 		 187 aa  161  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0185944 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2651  elongation factor P  41.3 
 
 		 187 aa  161  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1093  elongation factor P  43.24 
 
 		 187 aa  160  8.000000000000001e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1353  elongation factor P  40.76 
 
 		 187 aa  160  8.000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00251  elongation factor P  40.76 
 
 		 187 aa  160  9e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2358  elongation factor P  41.3 
 
 		 187 aa  160  9e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.69717  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2399  elongation factor P  41.3 
 
 		 187 aa  160  9e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.212662 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2405  elongation factor P  41.3 
 
 		 187 aa  160  9e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.576459  normal  0.0550099 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1301  elongation factor P  40.54 
 
 		 185 aa  160  9e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.105101  normal  0.268628 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12650  translation elongation factor P (EF-P)  40.78 
 
 		 199 aa  160  1e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0427626  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0564  elongation factor P  41.3 
 
 		 185 aa  160  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1842  elongation factor P  41.62 
 
 		 185 aa  160  1e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.145946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0547  elongation factor P  41.3 
 
 		 185 aa  160  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2358  elongation factor P  44.86 
 
 		 187 aa  159  2e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0880785  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0372  elongation factor P  43.78 
 
 		 185 aa  159  2e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.146381 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1849  elongation factor P  41.08 
 
 		 185 aa  159  3e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.583476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2891  elongation factor P  40.54 
 
 		 185 aa  158  3e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.780726  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1458  translation elongation factor P (EF-P)  41.3 
 
 		 185 aa  159  3e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0677588  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5084  elongation factor P  40.22 
 
 		 185 aa  158  4e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0879  translation elongation factor P  42.78 
 
 		 216 aa  158  4e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.351022 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0847  elongation factor P  41.3 
 
 		 185 aa  158  4e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000412318  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0356  elongation factor P  43.17 
 
 		 194 aa  158  4e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.142965  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1247  elongation factor P  40.66 
 
 		 189 aa  158  5e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0511  elongation factor P  42.31 
 
 		 187 aa  157  6e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1204  elongation factor P  42.7 
 
 		 185 aa  157  8e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0186048  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1034  translation elongation factor P  43.48 
 
 		 185 aa  157  8e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2333  translation elongation factor P  40.22 
 
 		 187 aa  156  1e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0872984  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0033  elongation factor P  40.22 
 
 		 187 aa  157  1e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00261  elongation factor P  40.22 
 
 		 186 aa  157  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.382229  normal  0.051277 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3009  elongation factor P  40.78 
 
 		 211 aa  156  1e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.144718 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3148  translation elongation factor P  40.54 
 
 		 186 aa  156  1e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0077  elongation factor P  40.98 
 
 		 190 aa  156  1e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000164055 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3752  elongation factor P  39.67 
 
 		 187 aa  156  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.180351 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1313  elongation factor P  40.76 
 
 		 185 aa  155  2e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1421  elongation factor P  43.24 
 
 		 185 aa  156  2e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.556639  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1093  elongation factor P  40.54 
 
 		 185 aa  155  3e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2026  translation elongation factor P  42.16 
 
 		 184 aa  155  3e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0568495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1240  translation elongation factor P (EF-P)  40 
 
 		 187 aa  155  3e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0546  translation elongation factor P  41.3 
 
 		 185 aa  155  4e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1581  elongation factor P  42.16 
 
 		 185 aa  154  5.0000000000000005e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000212505  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1570  elongation factor P  41.21 
 
 		 188 aa  154  6e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2590  translation elongation factor P  39.13 
 
 		 187 aa  154  7e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.993931  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1953  elongation factor P  42.7 
 
 		 185 aa  154  7e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000000145103  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4270  elongation factor P  40 
 
 		 185 aa  154  9e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4327  elongation factor P  40 
 
 		 185 aa  154  9e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0029  elongation factor P  38.59 
 
 		 186 aa  154  9e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1390  translation elongation factor P  40.32 
 
 		 186 aa  153  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.842759  normal  0.106183 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1542  translation elongation factor P  40 
 
 		 184 aa  153  1e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0036789  normal  0.0365403 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0132  elongation factor P  41.21 
 
 		 188 aa  152  2e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4050  elongation factor P  40 
 
 		 185 aa  152  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4101  elongation factor P  40 
 
 		 185 aa  152  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00461512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3939  elongation factor P  40 
 
 		 185 aa  152  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3950  elongation factor P  40 
 
 		 185 aa  152  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000574802  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4217  elongation factor P  40 
 
 		 185 aa  152  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.691003 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1838  elongation factor P  44.02 
 
 		 187 aa  152  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4421  elongation factor P  40 
 
 		 185 aa  152  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2031  translation elongation factor P  39.13 
 
 		 186 aa  152  2e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0283739 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4726  translation elongation factor P  38.59 
 
 		 185 aa  152  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0198786  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0622  translation elongation factor P  42.08 
 
 		 187 aa  153  2e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.449055  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2480  elongation factor P  39.13 
 
 		 185 aa  152  2e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.272577  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4307  elongation factor P  40 
 
 		 185 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12630  translation elongation factor P (EF-P)  40.78 
 
 		 204 aa  152  2.9999999999999998e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.05803 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08176  translation elongation factor P  40.32 
 
 		 188 aa  151  4e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.838989  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0927  elongation factor P  39.46 
 
 		 185 aa  151  5e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1922  elongation factor P  41.08 
 
 		 186 aa  151  5e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.775944  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00301  elongation factor P  38.04 
 
 		 186 aa  150  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1763  elongation factor P  42.93 
 
 		 187 aa  150  1e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00363755  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>