85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0003 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_0003  translation initiation factor eIF-5A  100 
 
 		 131 aa  265  1e-70  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1897  translation initiation factor IF-5A  57.38 
 
 		 127 aa  149  1e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.397681  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1949  translation initiation factor eIF-5A  52.31 
 
 		 131 aa  144  3e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.735179  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0904  translation initiation factor IF-5A  53.78 
 
 		 127 aa  140  6e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0110821  normal  0.486202 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0695  translation initiation factor IF-5A  54.92 
 
 		 128 aa  140  7e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.612946  normal  0.300408 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0434  translation initiation factor IF-5A  52.67 
 
 		 132 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0581  translation initiation factor IF-5A  54.2 
 
 		 132 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00138219 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1571  translation initiation factor IF-5A  53.44 
 
 		 132 aa  137  3.9999999999999997e-32  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2337  translation initiation factor eIF-5A  54.17 
 
 		 125 aa  136  8.999999999999999e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.316005 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1350  translation initiation factor eIF-5A  50.83 
 
 		 125 aa  136  8.999999999999999e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0722695  normal  0.0450814 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1751  translation initiation factor IF-5A  51.15 
 
 		 132 aa  136  1e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000442771  hitchhiker  0.00446575 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0915  translation initiation factor IF-5A  51.61 
 
 		 131 aa  135  2e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1756  translation initiation factor IF-5A  50.41 
 
 		 131 aa  134  4e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.455468  normal  0.26313 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0409  translation initiation factor IF-5A  55.38 
 
 		 132 aa  134  4e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0966  translation initiation factor eIF-5A  54.62 
 
 		 125 aa  133  7.000000000000001e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1686  translation initiation factor IF-5A  53.33 
 
 		 127 aa  133  9e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.230293  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2581  translation initiation factor IF-5A  51.59 
 
 		 124 aa  132  9.999999999999999e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.257819  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1207  translation initiation factor eIF-5A  51.59 
 
 		 124 aa  132  1.9999999999999998e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.165485  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0895  translation initiation factor IF-5A  48.46 
 
 		 132 aa  131  3e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.354636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3103  translation initiation factor eIF-5A  48.41 
 
 		 124 aa  129  1.0000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0529  translation initiation factor eIF-5A  49.61 
 
 		 136 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0759  translation initiation factor IF-5A  47.97 
 
 		 131 aa  124  3e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.824142  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0237  translation initiation factor IF-5A  45.6 
 
 		 131 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.676894  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1604  translation initiation factor eIF-5A  48.41 
 
 		 124 aa  124  4.0000000000000003e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0426  translation initiation factor 5A (eIF-5A)  49.59 
 
 		 151 aa  122  2e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.609574 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1578  translation initiation factor IF-5A  49.17 
 
 		 125 aa  121  3e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.238981 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1703  translation initiation factor IF-5A  47.9 
 
 		 131 aa  121  3e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0199  translation initiation factor IF-5A  46.22 
 
 		 131 aa  118  3e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17954  predicted protein  33.33 
 
 		 158 aa  84.3  5e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05400  initiation factor 5a (eif-5a), putative  37.5 
 
 		 158 aa  78.6  0.00000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.470767  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04015  eukaryotic translation initiation factor 5A-2 (Broad)  37.76 
 
 		 159 aa  76.3  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78463  Eukaryotic translation initiation factor 5A (eIF-5A) (eIF-4D)  32.06 
 
 		 156 aa  73.2  0.000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13807  predicted protein  35.4 
 
 		 165 aa  71.2  0.000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0443254  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1093  elongation factor P  32.69 
 
 		 185 aa  49.3  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1715  elongation factor P  32.69 
 
 		 186 aa  45.4  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000224452  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0132  elongation factor P  35.29 
 
 		 188 aa  45.1  0.0003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1204  elongation factor P  32.05 
 
 		 185 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0186048  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0720  elongation factor P  30.1 
 
 		 185 aa  45.1  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000911584  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1705  translation elongation factor P  28.7 
 
 		 187 aa  44.7  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.215577  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3752  elongation factor P  33 
 
 		 187 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.180351 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1717  translation elongation factor P (EF-P)  34 
 
 		 188 aa  44.7  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0425827 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1187  elongation factor P  35.29 
 
 		 189 aa  44.3  0.0005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1421  elongation factor P  35.23 
 
 		 185 aa  44.3  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.556639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0233  elongation factor P  33.01 
 
 		 185 aa  44.3  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0655  elongation factor P  35.29 
 
 		 189 aa  44.3  0.0006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1620  elongation factor P  30.77 
 
 		 185 aa  43.9  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000025141  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1587  elongation factor P  30.77 
 
 		 185 aa  43.9  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00812845  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0576  elongation factor P  35.29 
 
 		 189 aa  44.3  0.0006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.925832  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1379  elongation factor P  35.29 
 
 		 189 aa  44.3  0.0006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1061  elongation factor P  24.47 
 
 		 190 aa  43.9  0.0007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0622  translation elongation factor P  31.93 
 
 		 187 aa  43.9  0.0007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.449055  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1838  translation elongation factor P  30.43 
 
 		 187 aa  43.9  0.0007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.464834  normal  0.192185 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1305  elongation factor P  32.61 
 
 		 187 aa  43.9  0.0007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.656375  normal  0.0587891 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2405  elongation factor P  33.68 
 
 		 187 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.576459  normal  0.0550099 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2358  elongation factor P  33.68 
 
 		 187 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.69717  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2399  elongation factor P  33.68 
 
 		 187 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.212662 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl407  translation elongation factor P  25 
 
 		 185 aa  43.5  0.0009  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0519  translation elongation factor P  26.04 
 
 		 184 aa  43.5  0.001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2651  elongation factor P  33.68 
 
 		 187 aa  43.5  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0077  elongation factor P  30.34 
 
 		 190 aa  42.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000164055 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0908  elongation factor P  30.49 
 
 		 188 aa  42.7  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2333  translation elongation factor P  30 
 
 		 187 aa  42.4  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0872984  n/a   
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_41511  predicted protein  28.91 
 
 		 227 aa  42.4  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0285567  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2031  translation elongation factor P  31.52 
 
 		 186 aa  42  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0283739 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1005  translation elongation factor P  27.96 
 
 		 185 aa  42  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1741  translation elongation factor P  29.35 
 
 		 188 aa  42  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12630  translation elongation factor P (EF-P)  29.9 
 
 		 204 aa  42  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.05803 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2339  elongation factor P  31.07 
 
 		 185 aa  41.6  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1538  elongation factor P  31.07 
 
 		 185 aa  41.6  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.112402 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1849  elongation factor P  29.46 
 
 		 185 aa  41.2  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.583476  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1695  elongation factor P  30.53 
 
 		 186 aa  41.6  0.004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002232  translation elongation factor P  31.46 
 
 		 188 aa  41.2  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1093  elongation factor P  33.33 
 
 		 187 aa  40.8  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1858  elongation factor P  25.56 
 
 		 189 aa  40.4  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.453569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2480  elongation factor P  31.63 
 
 		 185 aa  40.8  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.272577  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2901  elongation factor P  35.14 
 
 		 188 aa  40.4  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0923486  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3856  elongation factor P  25.56 
 
 		 189 aa  40.4  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.198418  normal  0.116801 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1795  translation elongation factor P  28.72 
 
 		 185 aa  40.4  0.008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14700  translation elongation factor P (EF-P)  28.44 
 
 		 185 aa  40.4  0.008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.948878  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12554  elongation factor P  30.53 
 
 		 187 aa  40.4  0.008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0185944 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3009  elongation factor P  30.34 
 
 		 211 aa  40.4  0.008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.144718 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1842  elongation factor P  32.18 
 
 		 185 aa  40.4  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.145946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1570  elongation factor P  34.12 
 
 		 188 aa  40.4  0.009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf281  elongation factor P  28.42 
 
 		 185 aa  40  0.01  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0172375  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00137  elongation factor P  30.34 
 
 		 188 aa  40  0.01  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>