48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_0915 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009635  Maeo_0915  translation initiation factor IF-5A  100 
 
 		 131 aa  263  5e-70  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0759  translation initiation factor IF-5A  78.63 
 
 		 131 aa  216  1e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.824142  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0199  translation initiation factor IF-5A  73.28 
 
 		 131 aa  202  1e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1703  translation initiation factor IF-5A  71.76 
 
 		 131 aa  201  3e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0237  translation initiation factor IF-5A  71.76 
 
 		 131 aa  199  9e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.676894  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0003  translation initiation factor eIF-5A  51.61 
 
 		 131 aa  135  2e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1756  translation initiation factor IF-5A  53.66 
 
 		 131 aa  126  8.000000000000001e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.455468  normal  0.26313 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1350  translation initiation factor eIF-5A  45.38 
 
 		 125 aa  121  3e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0722695  normal  0.0450814 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0529  translation initiation factor eIF-5A  44.36 
 
 		 136 aa  120  8e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1949  translation initiation factor eIF-5A  46.34 
 
 		 131 aa  119  9.999999999999999e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.735179  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0581  translation initiation factor IF-5A  46.51 
 
 		 132 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00138219 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0434  translation initiation factor IF-5A  46.51 
 
 		 132 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1571  translation initiation factor IF-5A  46.51 
 
 		 132 aa  117  7e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0409  translation initiation factor IF-5A  48.84 
 
 		 132 aa  116  9.999999999999999e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1751  translation initiation factor IF-5A  45.74 
 
 		 132 aa  116  9.999999999999999e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000442771  hitchhiker  0.00446575 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0904  translation initiation factor IF-5A  42.86 
 
 		 127 aa  114  6e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0110821  normal  0.486202 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2337  translation initiation factor eIF-5A  43.7 
 
 		 125 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.316005 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0695  translation initiation factor IF-5A  42.62 
 
 		 128 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.612946  normal  0.300408 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1897  translation initiation factor IF-5A  40.98 
 
 		 127 aa  111  3e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.397681  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1686  translation initiation factor IF-5A  41.67 
 
 		 127 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.230293  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0966  translation initiation factor eIF-5A  42.02 
 
 		 125 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0895  translation initiation factor IF-5A  42.97 
 
 		 132 aa  108  3e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.354636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0426  translation initiation factor 5A (eIF-5A)  39.17 
 
 		 151 aa  103  8e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.609574 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1604  translation initiation factor eIF-5A  40.34 
 
 		 124 aa  102  2e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1207  translation initiation factor eIF-5A  41.53 
 
 		 124 aa  102  3e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.165485  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2581  translation initiation factor IF-5A  38.66 
 
 		 124 aa  97.1  8e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.257819  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3103  translation initiation factor eIF-5A  36.97 
 
 		 124 aa  96.3  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1578  translation initiation factor IF-5A  38.6 
 
 		 125 aa  95.9  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.238981 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04015  eukaryotic translation initiation factor 5A-2 (Broad)  35.45 
 
 		 159 aa  74.3  0.0000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND05400  initiation factor 5a (eif-5a), putative  35 
 
 		 158 aa  73.6  0.0000000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.470767  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78463  Eukaryotic translation initiation factor 5A (eIF-5A) (eIF-4D)  35.78 
 
 		 156 aa  71.2  0.000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17954  predicted protein  33.05 
 
 		 158 aa  70.5  0.000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13807  predicted protein  33.06 
 
 		 165 aa  63.2  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0443254  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1093  elongation factor P  27.68 
 
 		 185 aa  48.5  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0132  elongation factor P  30.77 
 
 		 188 aa  46.2  0.0001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1620  elongation factor P  26.79 
 
 		 185 aa  45.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000025141  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2339  elongation factor P  28.87 
 
 		 185 aa  45.4  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1587  elongation factor P  26.79 
 
 		 185 aa  45.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00812845  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2480  elongation factor P  31.46 
 
 		 185 aa  44.7  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.272577  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0233  elongation factor P  27.84 
 
 		 185 aa  44.3  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0908  elongation factor P  28.09 
 
 		 188 aa  44.3  0.0006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3145  translation elongation factor P  30.34 
 
 		 185 aa  43.9  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027119 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1842  elongation factor P  31.82 
 
 		 185 aa  43.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.145946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0550  elongation factor P  29.09 
 
 		 187 aa  42.7  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  4.38651e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1849  elongation factor P  30.68 
 
 		 185 aa  42  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.583476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3206  elongation factor P  32.98 
 
 		 187 aa  41.2  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0890237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1061  elongation factor P  22.81 
 
 		 190 aa  40.8  0.006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1421  elongation factor P  29.7 
 
 		 185 aa  40  0.01  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.556639  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>