34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1686 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_1686  translation initiation factor IF-5A  100 
 
 		 127 aa  255  1e-67  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.230293  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1897  translation initiation factor IF-5A  59.06 
 
 		 127 aa  168  3e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.397681  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1350  translation initiation factor eIF-5A  62.4 
 
 		 125 aa  165  2e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0722695  normal  0.0450814 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0966  translation initiation factor eIF-5A  61.6 
 
 		 125 aa  164  4e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0695  translation initiation factor IF-5A  56.69 
 
 		 128 aa  164  5e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.612946  normal  0.300408 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0904  translation initiation factor IF-5A  57.94 
 
 		 127 aa  157  4e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0110821  normal  0.486202 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2337  translation initiation factor eIF-5A  60.8 
 
 		 125 aa  157  5e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.316005 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0426  translation initiation factor 5A (eIF-5A)  54.33 
 
 		 151 aa  155  2e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.609574 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0003  translation initiation factor eIF-5A  53.33 
 
 		 131 aa  133  9e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2581  translation initiation factor IF-5A  50.43 
 
 		 124 aa  125  2.0000000000000002e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.257819  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1207  translation initiation factor eIF-5A  48.7 
 
 		 124 aa  120  5e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.165485  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0581  translation initiation factor IF-5A  48.78 
 
 		 132 aa  120  9e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00138219 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0434  translation initiation factor IF-5A  46.34 
 
 		 132 aa  118  3e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3103  translation initiation factor eIF-5A  46.09 
 
 		 124 aa  117  3.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1571  translation initiation factor IF-5A  47.97 
 
 		 132 aa  117  3.9999999999999996e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1751  translation initiation factor IF-5A  45.53 
 
 		 132 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000442771  hitchhiker  0.00446575 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1604  translation initiation factor eIF-5A  46.96 
 
 		 124 aa  115  1.9999999999999998e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0915  translation initiation factor IF-5A  41.67 
 
 		 131 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1578  translation initiation factor IF-5A  48 
 
 		 125 aa  108  2.0000000000000002e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.238981 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0895  translation initiation factor IF-5A  47.37 
 
 		 132 aa  107  4.0000000000000004e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.354636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1756  translation initiation factor IF-5A  45.3 
 
 		 131 aa  105  3e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.455468  normal  0.26313 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0529  translation initiation factor eIF-5A  44.27 
 
 		 136 aa  104  5e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1703  translation initiation factor IF-5A  40.34 
 
 		 131 aa  102  1e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0759  translation initiation factor IF-5A  37.82 
 
 		 131 aa  102  3e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.824142  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0409  translation initiation factor IF-5A  45.45 
 
 		 132 aa  100  5e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0237  translation initiation factor IF-5A  37.82 
 
 		 131 aa  100  8e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.676894  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1949  translation initiation factor eIF-5A  38.46 
 
 		 131 aa  99.8  1e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.735179  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0199  translation initiation factor IF-5A  36.97 
 
 		 131 aa  98.2  3e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04015  eukaryotic translation initiation factor 5A-2 (Broad)  32.54 
 
 		 159 aa  57.8  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND05400  initiation factor 5a (eif-5a), putative  29.91 
 
 		 158 aa  57.8  0.00000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.470767  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78463  Eukaryotic translation initiation factor 5A (eIF-5A) (eIF-4D)  30.95 
 
 		 156 aa  57  0.00000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17954  predicted protein  33.33 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13807  predicted protein  31.2 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0443254  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1301  elongation factor P  29.41 
 
 		 185 aa  41.2  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.105101  normal  0.268628 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>