34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_78463 on replicon NC_009045
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009045  PICST_78463  Eukaryotic translation initiation factor 5A (eIF-5A) (eIF-4D)  100 
 
 		 156 aa  320  7e-87  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND05400  initiation factor 5a (eif-5a), putative  78.85 
 
 		 158 aa  254  3e-67  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.470767  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04015  eukaryotic translation initiation factor 5A-2 (Broad)  75.47 
 
 		 159 aa  240  6e-63  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13807  predicted protein  53.42 
 
 		 165 aa  171  5e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0443254  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17954  predicted protein  42.76 
 
 		 158 aa  139  1.9999999999999998e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0003  translation initiation factor eIF-5A  32.06 
 
 		 131 aa  73.2  0.000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0915  translation initiation factor IF-5A  35.78 
 
 		 131 aa  71.2  0.000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0581  translation initiation factor IF-5A  37.35 
 
 		 132 aa  65.1  0.0000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00138219 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1571  translation initiation factor IF-5A  31.4 
 
 		 132 aa  64.7  0.0000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1350  translation initiation factor eIF-5A  30.65 
 
 		 125 aa  64.7  0.0000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0722695  normal  0.0450814 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0434  translation initiation factor IF-5A  36.14 
 
 		 132 aa  63.9  0.0000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1751  translation initiation factor IF-5A  36.14 
 
 		 132 aa  63.5  0.000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000442771  hitchhiker  0.00446575 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1756  translation initiation factor IF-5A  35.29 
 
 		 131 aa  62.4  0.000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.455468  normal  0.26313 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1949  translation initiation factor eIF-5A  32.43 
 
 		 131 aa  62  0.000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.735179  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1897  translation initiation factor IF-5A  32.26 
 
 		 127 aa  61.6  0.000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.397681  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0759  translation initiation factor IF-5A  34.23 
 
 		 131 aa  60.1  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.824142  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0409  translation initiation factor IF-5A  30.39 
 
 		 132 aa  60.1  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0199  translation initiation factor IF-5A  32.43 
 
 		 131 aa  60.1  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0966  translation initiation factor eIF-5A  38.37 
 
 		 125 aa  59.3  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1703  translation initiation factor IF-5A  31.53 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0426  translation initiation factor 5A (eIF-5A)  37.21 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.609574 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2337  translation initiation factor eIF-5A  31.15 
 
 		 125 aa  57.8  0.00000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.316005 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0895  translation initiation factor IF-5A  32.05 
 
 		 132 aa  57  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.354636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1686  translation initiation factor IF-5A  30.95 
 
 		 127 aa  57  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.230293  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3103  translation initiation factor eIF-5A  35.9 
 
 		 124 aa  55.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1207  translation initiation factor eIF-5A  35.9 
 
 		 124 aa  55.8  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.165485  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0237  translation initiation factor IF-5A  29.41 
 
 		 131 aa  55.5  0.0000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.676894  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0904  translation initiation factor IF-5A  31.71 
 
 		 127 aa  55.1  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0110821  normal  0.486202 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0529  translation initiation factor eIF-5A  28.43 
 
 		 136 aa  54.3  0.0000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1578  translation initiation factor IF-5A  31.63 
 
 		 125 aa  54.3  0.0000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.238981 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1604  translation initiation factor eIF-5A  32.08 
 
 		 124 aa  52.4  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04695  Woronin body major protein [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q9P8K9]  25.33 
 
 		 177 aa  52.8  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000213252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0695  translation initiation factor IF-5A  29.03 
 
 		 128 aa  51.2  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.612946  normal  0.300408 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2581  translation initiation factor IF-5A  30.85 
 
 		 124 aa  50.8  0.000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.257819  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>