More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1401 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_1401  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 260 aa  523  1e-147  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.278227  normal  0.338656 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0009  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.22 
 
 		 257 aa  243  1.9999999999999999e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.247011  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0765  hypothetical protein  38.4 
 
 		 253 aa  167  1e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0747  hypothetical protein  38.4 
 
 		 253 aa  167  2e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46579  predicted protein  37.54 
 
 		 308 aa  156  4e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3256  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 		 249 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3561  short chain dehydrogenase  32.89 
 
 		 249 aa  132  6e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3565  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 		 249 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.578221  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3655  short chain dehydrogenase  32.46 
 
 		 249 aa  129  3e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1662  short chain dehydrogenase  32.46 
 
 		 249 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.637972  hitchhiker  0.000000702398 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3250  short chain dehydrogenase  32.46 
 
 		 249 aa  128  9.000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0558976  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3341  short chain dehydrogenase  32.46 
 
 		 249 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.431422  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3306  short chain dehydrogenase  32.46 
 
 		 249 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3602  short chain dehydrogenase  32.46 
 
 		 249 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0750697  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3555  short chain dehydrogenase  32.46 
 
 		 249 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000931047 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2223  short chain dehydrogenase  31.58 
 
 		 249 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.637126  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.88 
 
 		 235 aa  119  6e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3230  short chain dehydrogenase  37.44 
 
 		 254 aa  119  6e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.272744 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0422  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.96 
 
 		 259 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4245  short chain dehydrogenase  37.92 
 
 		 249 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00332  FAD linked oxidase, N-terminal  30 
 
 		 705 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5440  short chain dehydrogenase  44.44 
 
 		 254 aa  115  5e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0792659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0080  short chain dehydrogenase  44.52 
 
 		 254 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.104238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4890  short chain dehydrogenase  43.75 
 
 		 254 aa  113  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0244727 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1071  short chain dehydrogenase  37.34 
 
 		 272 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0120  hypothetical protein  31.56 
 
 		 265 aa  110  3e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2637  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.68 
 
 		 249 aa  108  8.000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0309  short chain dehydrogenase  38.03 
 
 		 246 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1931  short chain dehydrogenase  38.03 
 
 		 246 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1673  short chain dehydrogenase  38.03 
 
 		 246 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1035  short chain dehydrogenase  37.5 
 
 		 256 aa  108  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.158204 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2225  glucose 1-dehydrogenase, putative  33.04 
 
 		 261 aa  108  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1879  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.04 
 
 		 261 aa  108  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.828765 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2209  short chain dehydrogenase  38.03 
 
 		 246 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0946  short chain dehydrogenase  38.03 
 
 		 253 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0219  short chain dehydrogenase  37.61 
 
 		 246 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1234  short chain dehydrogenase  38.03 
 
 		 279 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.446635  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6980  short chain dehydrogenase  36.1 
 
 		 252 aa  105  6e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4625  short chain dehydrogenase  32.64 
 
 		 249 aa  104  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.402352  normal  0.18483 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1917  short chain dehydrogenase  33.05 
 
 		 248 aa  103  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.242165  hitchhiker  0.00000598098 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3005  short chain dehydrogenase  36.71 
 
 		 252 aa  103  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.702214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1510  short chain dehydrogenase  32.64 
 
 		 249 aa  102  5e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.360234 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0959  short chain dehydrogenase  38.12 
 
 		 246 aa  101  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0597094 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5248  short chain dehydrogenase  43.15 
 
 		 253 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4617  short chain dehydrogenase  42.47 
 
 		 253 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.891469  hitchhiker  0.00163121 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5611  short chain dehydrogenase  43.15 
 
 		 253 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.637794  normal  0.281069 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3544  short chain dehydrogenase  38.36 
 
 		 246 aa  101  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.16365  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1440  short chain dehydrogenase  31.38 
 
 		 250 aa  100  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.637118  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0894  short chain dehydrogenase  38.12 
 
 		 246 aa  101  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.211983  normal  0.0749879 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3510  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.06 
 
 		 251 aa  100  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.439576 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2778  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.68 
 
 		 252 aa  100  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2999  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.79 
 
 		 250 aa  100  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.109628  normal  0.14985 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.11 
 
 		 239 aa  99.8  4e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.640458 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2225  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.73 
 
 		 267 aa  99.4  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.801106 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1529  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.06 
 
 		 265 aa  99.4  6e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0206025  normal  0.910086 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0066  dehydrogenase/reductase  37.44 
 
 		 252 aa  99  6e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000301861 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3370  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.84 
 
 		 248 aa  99  7e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0275  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.33 
 
 		 243 aa  98.6  8e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000379715  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1029  short chain dehydrogenase  41.96 
 
 		 246 aa  98.2  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.264626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0225  short chain dehydrogenase  38.6 
 
 		 311 aa  97.8  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5146  short chain dehydrogenase  29.71 
 
 		 249 aa  98.6  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.485132 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5381  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.04 
 
 		 251 aa  98.2  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.000130997  normal  0.577572 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20330  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.2 
 
 		 281 aa  98.2  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5129  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.91 
 
 		 263 aa  97.1  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.204744  normal  0.374158 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2450  short chain dehydrogenase  35.26 
 
 		 248 aa  97.1  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00157623  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3357  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.03 
 
 		 255 aa  96.7  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.69 
 
 		 254 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.393683 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2771  short chain dehydrogenase  31.71 
 
 		 253 aa  96.7  4e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1526  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.28 
 
 		 254 aa  96.3  5e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0982  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.03 
 
 		 268 aa  96.3  5e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3366  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.86 
 
 		 250 aa  95.9  5e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1712  short chain dehydrogenase  29.84 
 
 		 252 aa  95.9  6e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1886  short chain dehydrogenase  30.24 
 
 		 252 aa  95.9  6e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1847  short chain dehydrogenase  29.84 
 
 		 252 aa  95.9  6e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.07 
 
 		 261 aa  95.5  7e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0587036  normal  0.882414 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4922  short chain dehydrogenase  35.26 
 
 		 248 aa  95.5  8e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1689  short chain dehydrogenase  29.44 
 
 		 252 aa  95.1  9e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_21608  predicted protein  30.53 
 
 		 276 aa  95.1  9e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2039  short chain dehydrogenase  29.15 
 
 		 255 aa  95.1  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0111409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3773  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.04 
 
 		 253 aa  94  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1385  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.19 
 
 		 259 aa  94  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0412  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.65 
 
 		 249 aa  94  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.956154 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05911  short chain dehydrogenase  28.8 
 
 		 244 aa  94.4  2e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2297  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.38 
 
 		 267 aa  93.6  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0843841 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1425  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.8 
 
 		 258 aa  93.2  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.315018 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2409  short chain dehydrogenase  32.29 
 
 		 245 aa  93.2  3e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00187204  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1601  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.35 
 
 		 258 aa  93.6  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1535  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.87 
 
 		 261 aa  93.6  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0579067  normal  0.028281 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2989  short-chain alcohol dehydrogenase/reductase  30.34 
 
 		 243 aa  93.6  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1857  glucose 1-dehydrogenase, putative  30.87 
 
 		 261 aa  93.6  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.637675  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.35 
 
 		 246 aa  93.6  3e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0248  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.51 
 
 		 253 aa  92.8  4e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000114763 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003017  oxidoreductase short-chain dehydrogenase/reductase family  31.34 
 
 		 248 aa  92.8  4e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00557089  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6036  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.75 
 
 		 243 aa  92.8  5e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.191154 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4258  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.76 
 
 		 253 aa  92.8  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  normal  0.414505 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04715  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.33 
 
 		 249 aa  92.8  5e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.863639  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2597  dehydrogenase/reductase oxidoreductase protein  33.85 
 
 		 252 aa  92.4  6e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5277  putative oxidoreductase  34.02 
 
 		 251 aa  92.4  6e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.241792  normal  0.218182 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_5780  predicted protein  37.37 
 
 		 194 aa  92.4  7e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.155733  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0397  oxidoreductase  29.96 
 
 		 248 aa  92.4  7e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.290459 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>