More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_3230 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010086  Bmul_3230  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 254 aa  501  1e-141  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.272744 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5440  short chain dehydrogenase  85.32 
 
 		 254 aa  425  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0792659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4890  short chain dehydrogenase  85.32 
 
 		 254 aa  426  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0244727 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0080  short chain dehydrogenase  82.54 
 
 		 254 aa  414  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.104238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5248  short chain dehydrogenase  81.75 
 
 		 253 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5611  short chain dehydrogenase  81.75 
 
 		 253 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.637794  normal  0.281069 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4617  short chain dehydrogenase  80.95 
 
 		 253 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.891469  hitchhiker  0.00163121 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0946  short chain dehydrogenase  73.41 
 
 		 253 aa  348  4e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1234  short chain dehydrogenase  73.41 
 
 		 279 aa  347  7e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.446635  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2209  short chain dehydrogenase  74.39 
 
 		 246 aa  347  1e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1931  short chain dehydrogenase  74.39 
 
 		 246 aa  347  1e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1673  short chain dehydrogenase  74.39 
 
 		 246 aa  347  1e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0309  short chain dehydrogenase  74.39 
 
 		 246 aa  347  1e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0219  short chain dehydrogenase  73.77 
 
 		 246 aa  347  1e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0225  short chain dehydrogenase  72 
 
 		 311 aa  332  3e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4245  short chain dehydrogenase  65.98 
 
 		 249 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3005  short chain dehydrogenase  66.53 
 
 		 252 aa  301  6.000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.702214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6980  short chain dehydrogenase  66.14 
 
 		 252 aa  300  2e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3544  short chain dehydrogenase  52.89 
 
 		 246 aa  218  6e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.16365  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5003  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.6 
 
 		 256 aa  153  2.9999999999999998e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0899775  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1275  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.87 
 
 		 251 aa  150  1e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.805935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4337  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.2 
 
 		 258 aa  146  3e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0532431 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1035  short chain dehydrogenase  39.27 
 
 		 256 aa  145  9e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.158204 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3250  short chain dehydrogenase  35.09 
 
 		 249 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0558976  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3561  short chain dehydrogenase  34.07 
 
 		 249 aa  137  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0894  short chain dehydrogenase  39.51 
 
 		 246 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.211983  normal  0.0749879 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3256  short chain dehydrogenase  33.48 
 
 		 249 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1662  short chain dehydrogenase  33.19 
 
 		 249 aa  135  5e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.637972  hitchhiker  0.000000702398 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3565  short chain dehydrogenase  33.48 
 
 		 249 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.578221  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3655  short chain dehydrogenase  33.63 
 
 		 249 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0959  short chain dehydrogenase  40.16 
 
 		 246 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0597094 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2223  short chain dehydrogenase  31.49 
 
 		 249 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.637126  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1071  short chain dehydrogenase  38.71 
 
 		 272 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1735  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.8 
 
 		 260 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.355166  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3555  short chain dehydrogenase  32.74 
 
 		 249 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000931047 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3341  short chain dehydrogenase  32.74 
 
 		 249 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.431422  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3306  short chain dehydrogenase  32.74 
 
 		 249 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3602  short chain dehydrogenase  32.74 
 
 		 249 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0750697  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1932  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.41 
 
 		 260 aa  132  5e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.125802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3151  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.8 
 
 		 270 aa  128  9.000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.11649  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1029  short chain dehydrogenase  38.68 
 
 		 246 aa  122  5e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.264626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0009  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 		 257 aa  114  1.0000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.247011  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2989  short-chain alcohol dehydrogenase/reductase  32.16 
 
 		 243 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3334  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.51 
 
 		 258 aa  113  3e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1401  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.47 
 
 		 260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.278227  normal  0.338656 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5381  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.48 
 
 		 251 aa  105  5e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.000130997  normal  0.577572 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0120  hypothetical protein  33.47 
 
 		 265 aa  95.5  7e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3071  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.48 
 
 		 241 aa  89  7e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.362756  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0994  3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase  30 
 
 		 243 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.840356  normal  0.274345 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1097  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30 
 
 		 243 aa  79  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46579  predicted protein  28.96 
 
 		 308 aa  78.2  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2560  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.02 
 
 		 240 aa  77.8  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.008135 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1811  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.41 
 
 		 240 aa  78.2  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.300255  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4592  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.35 
 
 		 247 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.278018 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4772  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.75 
 
 		 239 aa  77.4  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00775431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5053  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.35 
 
 		 247 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.607642  normal  0.406832 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3904  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.46 
 
 		 228 aa  77.8  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164626 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6725  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.22 
 
 		 241 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.198108  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3795  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.58 
 
 		 252 aa  76.6  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.586754  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1086  short chain dehydrogenase  30.46 
 
 		 232 aa  76.6  0.0000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2637  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.66 
 
 		 249 aa  76.3  0.0000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0979  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  29.95 
 
 		 232 aa  75.9  0.0000000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2999  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.03 
 
 		 250 aa  74.7  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.109628  normal  0.14985 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0067  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.11 
 
 		 247 aa  75.1  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61312  predicted protein  29.91 
 
 		 253 aa  74.7  0.000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.243713  normal  0.492851 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09357  short-chain dehydrogenase/reductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G02370)  31.33 
 
 		 258 aa  73.9  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00364064 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0577  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.61 
 
 		 241 aa  74.3  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.52827  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5077  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.25 
 
 		 243 aa  73.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.453828  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0452  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  28.74 
 
 		 255 aa  73.6  0.000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1259  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.99 
 
 		 245 aa  72.8  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0445  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  29.31 
 
 		 246 aa  72.8  0.000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0066  dehydrogenase/reductase  36.44 
 
 		 252 aa  72.8  0.000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000301861 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0013  2,3-dihydroxybenzoate-2,3-dehydrogenase  31.58 
 
 		 258 aa  72.4  0.000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0026  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.63 
 
 		 269 aa  72.4  0.000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0010  2,3-dihydroxybenzoate-2,3-dehydrogenase  31.58 
 
 		 258 aa  72.4  0.000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6526  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.39 
 
 		 241 aa  72.4  0.000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.699599  normal  0.026116 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3370  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.64 
 
 		 248 aa  72.4  0.000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1629  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  30.42 
 
 		 247 aa  72  0.000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000722378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2462  short-chain dehydrogenase  29.92 
 
 		 251 aa  72  0.000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0920  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  26.77 
 
 		 249 aa  71.6  0.00000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1135  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.46 
 
 		 262 aa  71.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.768597 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1081  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.85 
 
 		 250 aa  71.2  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3542  short chain dehydrogenase  33.85 
 
 		 239 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.71416 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1181  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  26.26 
 
 		 249 aa  70.5  0.00000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1388  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.81 
 
 		 258 aa  70.1  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2585  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 		 239 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0706  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.05 
 
 		 225 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0850  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  25.76 
 
 		 249 aa  69.7  0.00000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4264  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30 
 
 		 252 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.281349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53846  1-Acyl dihydroxyacetone phosphate reductase ribitol 2-dehydrogenase  28.75 
 
 		 291 aa  69.3  0.00000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1204  Short-chain dehydrogenase/reductase  29.79 
 
 		 258 aa  69.7  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1614  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.37 
 
 		 253 aa  68.9  0.00000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0547221  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4824  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.53 
 
 		 254 aa  68.9  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1604  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.86 
 
 		 248 aa  68.9  0.00000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3747  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.53 
 
 		 254 aa  68.9  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.191543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0559  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.53 
 
 		 246 aa  68.6  0.00000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0765  hypothetical protein  30.51 
 
 		 253 aa  68.2  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0747  hypothetical protein  30.4 
 
 		 253 aa  68.6  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1315  2,3-dihydroxybenzoate-2,3-dehydrogenase  32.26 
 
 		 252 aa  68.2  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.989266  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1867  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.44 
 
 		 247 aa  68.2  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0330312  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>