More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1735 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1735  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 260 aa  525  1e-148  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.355166  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1932  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  97.31 
 
 		 260 aa  513  1e-144  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.125802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4337  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  67.58 
 
 		 258 aa  328  5.0000000000000004e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0532431 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3151  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  70.82 
 
 		 270 aa  320  9.999999999999999e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.11649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1275  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65 
 
 		 251 aa  317  1e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.805935  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5003  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.15 
 
 		 256 aa  263  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0899775  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3334  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.1 
 
 		 258 aa  236  2e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1071  short chain dehydrogenase  41.7 
 
 		 272 aa  165  9e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1662  short chain dehydrogenase  34.65 
 
 		 249 aa  162  3e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.637972  hitchhiker  0.000000702398 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3256  short chain dehydrogenase  34.25 
 
 		 249 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3655  short chain dehydrogenase  34.25 
 
 		 249 aa  162  7e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0894  short chain dehydrogenase  42.19 
 
 		 246 aa  159  6e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.211983  normal  0.0749879 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3565  short chain dehydrogenase  34.65 
 
 		 249 aa  158  7e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.578221  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3561  short chain dehydrogenase  33.86 
 
 		 249 aa  157  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1035  short chain dehydrogenase  40.46 
 
 		 256 aa  157  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.158204 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3555  short chain dehydrogenase  33.46 
 
 		 249 aa  156  3e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000931047 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3341  short chain dehydrogenase  33.46 
 
 		 249 aa  156  3e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.431422  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3306  short chain dehydrogenase  33.46 
 
 		 249 aa  156  3e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3602  short chain dehydrogenase  33.46 
 
 		 249 aa  156  3e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0750697  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0959  short chain dehydrogenase  42.58 
 
 		 246 aa  155  4e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0597094 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3250  short chain dehydrogenase  33.07 
 
 		 249 aa  155  7e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0558976  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2223  short chain dehydrogenase  35.04 
 
 		 249 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.637126  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4245  short chain dehydrogenase  35.41 
 
 		 249 aa  149  4e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0309  short chain dehydrogenase  34.63 
 
 		 246 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0946  short chain dehydrogenase  34.63 
 
 		 253 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1931  short chain dehydrogenase  34.63 
 
 		 246 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1673  short chain dehydrogenase  34.63 
 
 		 246 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0219  short chain dehydrogenase  34.63 
 
 		 246 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2209  short chain dehydrogenase  34.63 
 
 		 246 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1234  short chain dehydrogenase  34.63 
 
 		 279 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.446635  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3005  short chain dehydrogenase  38.91 
 
 		 252 aa  142  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.702214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4890  short chain dehydrogenase  36.72 
 
 		 254 aa  139  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0244727 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5440  short chain dehydrogenase  36.33 
 
 		 254 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0792659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0080  short chain dehydrogenase  35.02 
 
 		 254 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.104238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3230  short chain dehydrogenase  35.8 
 
 		 254 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.272744 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6980  short chain dehydrogenase  36.96 
 
 		 252 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0225  short chain dehydrogenase  37.35 
 
 		 311 aa  131  7.999999999999999e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4617  short chain dehydrogenase  34.88 
 
 		 253 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.891469  hitchhiker  0.00163121 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1029  short chain dehydrogenase  39.92 
 
 		 246 aa  130  3e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.264626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5248  short chain dehydrogenase  34.88 
 
 		 253 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5611  short chain dehydrogenase  34.88 
 
 		 253 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.637794  normal  0.281069 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3544  short chain dehydrogenase  37.21 
 
 		 246 aa  107  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.16365  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0009  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.96 
 
 		 257 aa  95.1  9e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.247011  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0422  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.05 
 
 		 259 aa  87.8  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2989  short-chain alcohol dehydrogenase/reductase  30.8 
 
 		 243 aa  87.8  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3904  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.86 
 
 		 228 aa  86.3  4e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164626 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5381  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.86 
 
 		 251 aa  79.3  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.000130997  normal  0.577572 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1401  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.29 
 
 		 260 aa  77  0.0000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.278227  normal  0.338656 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1333  acetoacetyl-CoA reductase  31.7 
 
 		 248 aa  76.6  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.58717  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0348  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.78 
 
 		 244 aa  75.1  0.000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.708158  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0911  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.88 
 
 		 246 aa  75.1  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.411552  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0433  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.7 
 
 		 244 aa  73.9  0.000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00087459  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3449  acetoacetyl-CoA reductase  28.63 
 
 		 248 aa  71.6  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0871838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4780  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.52 
 
 		 227 aa  71.6  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.18592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3992  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.25 
 
 		 226 aa  71.2  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.280022  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1025  acetoacetyl-CoA reductase  30.8 
 
 		 248 aa  70.9  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1561  short chain dehydrogenase  29.81 
 
 		 516 aa  70.5  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.636243  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4319  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.81 
 
 		 239 aa  70.9  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2415  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.52 
 
 		 281 aa  70.5  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.013763 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1867  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.65 
 
 		 247 aa  70.5  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0330312  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4279  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.51 
 
 		 241 aa  69.3  0.00000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.57822  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2132  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.06 
 
 		 244 aa  68.9  0.00000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000343702  normal  0.0291609 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1310  acetoacetyl-CoA reductase  29.44 
 
 		 248 aa  68.9  0.00000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.331099  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2999  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.91 
 
 		 250 aa  68.2  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.109628  normal  0.14985 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4264  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.64 
 
 		 252 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.281349  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1522  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.05 
 
 		 254 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0490038  normal  0.520511 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0997  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.52 
 
 		 260 aa  66.6  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3915  acetoacetyl-CoA reductase  27.38 
 
 		 252 aa  66.6  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4127  acetoacetyl-CoA reductase  28.46 
 
 		 247 aa  66.2  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4004  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.92 
 
 		 259 aa  66.2  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.132038  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2667  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  27.41 
 
 		 249 aa  66.2  0.0000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000680764  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3123  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  27.91 
 
 		 251 aa  66.2  0.0000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0932491  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1914  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.98 
 
 		 225 aa  66.2  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02810  hypothetical protein  31.31 
 
 		 247 aa  65.9  0.0000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2001  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.58 
 
 		 245 aa  65.5  0.0000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1086  short chain dehydrogenase  29.27 
 
 		 232 aa  65.5  0.0000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1583  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.52 
 
 		 249 aa  65.5  0.0000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.466819  normal  0.043655 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2241  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.5 
 
 		 245 aa  65.5  0.0000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000319418  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1908  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.52 
 
 		 249 aa  65.5  0.0000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.193412  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3357  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.17 
 
 		 255 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3917  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.64 
 
 		 252 aa  64.7  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.139666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.24 
 
 		 257 aa  64.7  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.125705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0979  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  29.27 
 
 		 232 aa  65.1  0.000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6694  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.66 
 
 		 242 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.140342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.47 
 
 		 225 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.31851  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1999  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.47 
 
 		 225 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.570082  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4446  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.34 
 
 		 254 aa  64.7  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.287432  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23650  Acetoacetl-CoA reductase in PHB biosynthesis  30.68 
 
 		 247 aa  64.7  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6725  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.8 
 
 		 241 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.198108  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3166  sorbitol dehydrogenase  33.33 
 
 		 269 aa  64.3  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0138901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0542  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.78 
 
 		 244 aa  64.3  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1097  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.78 
 
 		 247 aa  64.3  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000264481  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2031  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.24 
 
 		 245 aa  64.3  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0664  cylG protein  27.59 
 
 		 240 aa  63.9  0.000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0372  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34 
 
 		 250 aa  63.5  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0528215 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0580  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.25 
 
 		 255 aa  63.9  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0577  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.44 
 
 		 241 aa  63.5  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.52827  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1531  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.59 
 
 		 268 aa  63.5  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.50523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2085  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  27.99 
 
 		 245 aa  63.5  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.514176 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1990  oxidoreductase  27.78 
 
 		 254 aa  63.5  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.207247 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>