More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B0080 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B0080  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 254 aa  508  1e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.104238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5440  short chain dehydrogenase  88.93 
 
 		 254 aa  456  1e-127  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0792659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4890  short chain dehydrogenase  87.35 
 
 		 254 aa  449  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0244727 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5248  short chain dehydrogenase  86.61 
 
 		 253 aa  425  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5611  short chain dehydrogenase  86.61 
 
 		 253 aa  425  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.637794  normal  0.281069 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4617  short chain dehydrogenase  85.43 
 
 		 253 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.891469  hitchhiker  0.00163121 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3230  short chain dehydrogenase  82.54 
 
 		 254 aa  414  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.272744 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0946  short chain dehydrogenase  72.4 
 
 		 253 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1234  short chain dehydrogenase  72.4 
 
 		 279 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.446635  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0309  short chain dehydrogenase  73.36 
 
 		 246 aa  355  5e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1931  short chain dehydrogenase  73.36 
 
 		 246 aa  355  5e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2209  short chain dehydrogenase  73.36 
 
 		 246 aa  355  5e-97  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1673  short chain dehydrogenase  73.36 
 
 		 246 aa  355  5e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0219  short chain dehydrogenase  72.95 
 
 		 246 aa  353  1e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0225  short chain dehydrogenase  71.6 
 
 		 311 aa  339  2e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4245  short chain dehydrogenase  64.52 
 
 		 249 aa  325  5e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3005  short chain dehydrogenase  65.73 
 
 		 252 aa  304  7e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.702214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6980  short chain dehydrogenase  64.11 
 
 		 252 aa  295  3e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3544  short chain dehydrogenase  53.72 
 
 		 246 aa  225  5.0000000000000005e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.16365  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1275  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.87 
 
 		 251 aa  156  3e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.805935  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5003  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.91 
 
 		 256 aa  155  6e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0899775  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1035  short chain dehydrogenase  38.87 
 
 		 256 aa  154  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.158204 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4337  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.6 
 
 		 258 aa  149  4e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0532431 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1071  short chain dehydrogenase  38.87 
 
 		 272 aa  137  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3151  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.2 
 
 		 270 aa  137  2e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.11649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1932  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.02 
 
 		 260 aa  135  7.000000000000001e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.125802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1735  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.02 
 
 		 260 aa  135  7.000000000000001e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.355166  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0894  short chain dehydrogenase  36.21 
 
 		 246 aa  132  5e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.211983  normal  0.0749879 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3250  short chain dehydrogenase  32.2 
 
 		 249 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0558976  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0959  short chain dehydrogenase  36.21 
 
 		 246 aa  129  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0597094 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3256  short chain dehydrogenase  32.44 
 
 		 249 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3561  short chain dehydrogenase  32.14 
 
 		 249 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2223  short chain dehydrogenase  30.64 
 
 		 249 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.637126  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3341  short chain dehydrogenase  31.7 
 
 		 249 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.431422  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3306  short chain dehydrogenase  31.7 
 
 		 249 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3602  short chain dehydrogenase  31.7 
 
 		 249 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0750697  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3555  short chain dehydrogenase  31.7 
 
 		 249 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000931047 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3565  short chain dehydrogenase  31.06 
 
 		 249 aa  125  6e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.578221  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3655  short chain dehydrogenase  31.7 
 
 		 249 aa  125  7e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1662  short chain dehydrogenase  31.25 
 
 		 249 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.637972  hitchhiker  0.000000702398 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1029  short chain dehydrogenase  38.27 
 
 		 246 aa  124  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.264626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2989  short-chain alcohol dehydrogenase/reductase  34.06 
 
 		 243 aa  121  8e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3334  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.41 
 
 		 258 aa  119  3.9999999999999996e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1401  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.52 
 
 		 260 aa  115  6e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.278227  normal  0.338656 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5381  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.19 
 
 		 251 aa  111  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.000130997  normal  0.577572 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0009  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.4 
 
 		 257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.247011  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0120  hypothetical protein  32.76 
 
 		 265 aa  93.6  3e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2637  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.43 
 
 		 249 aa  85.1  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3795  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.92 
 
 		 252 aa  84  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.586754  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3071  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.15 
 
 		 241 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.362756  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1811  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.17 
 
 		 240 aa  80.5  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.300255  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61312  predicted protein  31.65 
 
 		 253 aa  80.1  0.00000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.243713  normal  0.492851 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46579  predicted protein  30.25 
 
 		 308 aa  80.1  0.00000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00332  FAD linked oxidase, N-terminal  27.5 
 
 		 705 aa  79.7  0.00000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09357  short-chain dehydrogenase/reductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G02370)  32.59 
 
 		 258 aa  78.6  0.00000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00364064 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0577  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.42 
 
 		 241 aa  78.2  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.52827  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2999  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.17 
 
 		 250 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.109628  normal  0.14985 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3904  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.1 
 
 		 228 aa  77.4  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164626 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4772  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.18 
 
 		 239 aa  75.9  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00775431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0994  3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase  28.8 
 
 		 243 aa  75.9  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.840356  normal  0.274345 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2697  putative short-chain type dehydrogenase/reductase  34.41 
 
 		 247 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0979  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  29.44 
 
 		 232 aa  74.7  0.000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1086  short chain dehydrogenase  29.44 
 
 		 232 aa  75.1  0.000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5053  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.8 
 
 		 247 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.607642  normal  0.406832 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1097  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.63 
 
 		 243 aa  74.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4592  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.8 
 
 		 247 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.278018 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3247  sorbitol dehydrogenase  33.17 
 
 		 260 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0320221  normal  0.626785 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1113  sorbitol dehydrogenase  32.58 
 
 		 262 aa  72.8  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4264  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30 
 
 		 252 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.281349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2560  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.78 
 
 		 240 aa  71.6  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.008135 
 
 
-
 
NC_003296  RS05466  dehydrogenase oxidoreductase protein  31.78 
 
 		 255 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.968817  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0914  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.18 
 
 		 250 aa  71.2  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.66283  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7589  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.71 
 
 		 258 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0719  sorbitol dehydrogenase  32.21 
 
 		 260 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000035805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5077  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.42 
 
 		 243 aa  70.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.453828  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2573  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.18 
 
 		 250 aa  71.2  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.331162 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4318  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.69 
 
 		 264 aa  70.9  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.319531  normal  0.0832513 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0275  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.27 
 
 		 243 aa  71.2  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000379715  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2597  dehydrogenase/reductase oxidoreductase protein  31.12 
 
 		 252 aa  70.1  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.53 
 
 		 252 aa  70.1  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.673149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3635  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.8 
 
 		 223 aa  70.1  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2374  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.39 
 
 		 256 aa  70.1  0.00000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0247  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.49 
 
 		 223 aa  70.1  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0747  hypothetical protein  33.11 
 
 		 253 aa  69.7  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1561  short chain dehydrogenase  30.37 
 
 		 516 aa  69.7  0.00000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.636243  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1614  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.6 
 
 		 253 aa  69.3  0.00000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0547221  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0765  hypothetical protein  33.11 
 
 		 253 aa  68.9  0.00000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3078  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.34 
 
 		 255 aa  68.9  0.00000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.485877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1596  short chain dehydrogenase  30.69 
 
 		 245 aa  68.6  0.00000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.184756 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0067  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.73 
 
 		 247 aa  67.8  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30 
 
 		 239 aa  68.6  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.640458 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1462  short chain dehydrogenase  30.77 
 
 		 259 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780505  normal  0.472933 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5197  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.58 
 
 		 251 aa  68.2  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.71 
 
 		 223 aa  68.2  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.209414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0066  dehydrogenase/reductase  36.52 
 
 		 252 aa  68.2  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000301861 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0026  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.21 
 
 		 269 aa  68.2  0.0000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0489  sorbitol dehydrogenase  33.01 
 
 		 260 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0000937678  hitchhiker  0.00159634 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0363  sorbitol dehydrogenase  29.35 
 
 		 257 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3073  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  31.63 
 
 		 252 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.175378  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1925  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.1 
 
 		 275 aa  67.8  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>