More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1385 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_1385  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
259 aa  525  1e-148  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3728  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.28 
 
 
241 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6401  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.81 
 
 
249 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.476786  normal  0.058074 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5653  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.42 
 
 
251 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.383425 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6443  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.68 
 
 
259 aa  116  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0150364  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6034  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.68 
 
 
249 aa  116  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.311099  normal  0.357873 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1386  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.68 
 
 
251 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1991  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.76 
 
 
251 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.371693  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1390  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.76 
 
 
251 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399104  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1302  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.76 
 
 
251 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3043  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.76 
 
 
251 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1014  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.76 
 
 
251 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2278  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.76 
 
 
251 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5439  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.68 
 
 
249 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.012898 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3172  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.76 
 
 
251 aa  113  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8333  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.35 
 
 
257 aa  103  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.319832  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0265  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  30.71 
 
 
248 aa  101  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.534726  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.76 
 
 
250 aa  99.4  5e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5514  cyclopentanol dehydrogenase  36.36 
 
 
264 aa  99  6e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1425  short chain dehydrogenase  34.91 
 
 
253 aa  99  7e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.857979  normal  0.357324 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0706  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.71 
 
 
242 aa  99  7e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00246779  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0180  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.08 
 
 
245 aa  97.8  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00307059  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2561  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.73 
 
 
241 aa  98.2  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00191799  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1794  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.96 
 
 
238 aa  96.3  5e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3817  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32 
 
 
247 aa  96.3  5e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000217117  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0734  putative short chain dehydrogenase  27.66 
 
 
242 aa  94.4  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.491859  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0630  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.55 
 
 
246 aa  94.4  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3623  short chain dehydrogenase  33.96 
 
 
253 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0211534  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05091  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  25.58 
 
 
249 aa  93.6  3e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.71 
 
 
246 aa  93.6  3e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0175  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.31 
 
 
247 aa  93.2  4e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0453  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  25.58 
 
 
249 aa  92.8  5e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.465318  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05161  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  25.58 
 
 
249 aa  92.4  6e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.426884  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.33 
 
 
252 aa  92.4  7e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2654  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.43 
 
 
254 aa  92  9e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4265  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.25 
 
 
250 aa  91.3  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0344  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  29.51 
 
 
258 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.04 
 
 
246 aa  91.7  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4325  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.25 
 
 
250 aa  91.3  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00118279  normal  0.0328571 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.71 
 
 
265 aa  91.3  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2507  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.02 
 
 
253 aa  91.7  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.024976  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04781  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  25.97 
 
 
249 aa  91.3  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.29 
 
 
246 aa  91.7  1e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6088  short chain dehydrogenase  31.78 
 
 
238 aa  91.3  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.54995  normal  0.605964 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.31 
 
 
252 aa  90.5  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2225  glucose 1-dehydrogenase, putative  32.27 
 
 
261 aa  90.1  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1879  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.27 
 
 
261 aa  90.1  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.828765 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.71 
 
 
262 aa  90.1  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30 
 
 
256 aa  90.1  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3650  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.48 
 
 
265 aa  90.1  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.59426 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.11 
 
 
256 aa  90.1  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.624972 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33490  short-chain alcohol dehydrogenase  30.77 
 
 
247 aa  89.7  4e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.343117  normal  0.392445 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2140  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.23 
 
 
254 aa  89.7  4e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0012  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.69 
 
 
248 aa  89  6e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4948  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.76 
 
 
270 aa  89  6e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.617034  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1963  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.58 
 
 
257 aa  89  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.922459 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2508  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.8 
 
 
250 aa  89  7e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.168106  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2536  short chain dehydrogenase  30.04 
 
 
241 aa  88.6  9e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6036  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.69 
 
 
254 aa  88.6  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0528417  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0924  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  31.69 
 
 
260 aa  87.8  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.171605  normal  0.571441 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1897  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.11 
 
 
247 aa  88.2  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100219 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.29 
 
 
250 aa  87.8  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.663428  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.34 
 
 
253 aa  88.2  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.901509  normal  0.0346671 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.11 
 
 
276 aa  88.6  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.185872  hitchhiker  0.0000125896 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1817  short chain dehydrogenase  32.55 
 
 
253 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2110  short chain dehydrogenase  30.77 
 
 
253 aa  87.4  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.94456 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.8 
 
 
248 aa  87.4  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.057049  hitchhiker  0.000702749 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1402  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.97 
 
 
286 aa  87.4  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.457155  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0777  2,5-dichloro-2,5-cyclohexadiene-1,4-diol dehydrogenase  30.84 
 
 
256 aa  87.4  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  unclonable  0.000000000602932 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3066  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.54 
 
 
273 aa  87.8  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.172953  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.26 
 
 
257 aa  87.8  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35 
 
 
257 aa  87.4  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0541  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.15 
 
 
251 aa  87.8  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1396  short chain dehydrogenase  32.55 
 
 
253 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4672  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.35 
 
 
253 aa  87  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.572467  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1368  short chain dehydrogenase  30.33 
 
 
261 aa  87  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0884  dehydrogenase  29.61 
 
 
257 aa  87  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0818  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.99 
 
 
252 aa  87  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.100065 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5663  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.37 
 
 
274 aa  87  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.686827  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2123  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  27.87 
 
 
246 aa  87  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1662  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.13 
 
 
245 aa  86.7  4e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3817  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.75 
 
 
252 aa  86.3  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.191751  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1137  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.91 
 
 
255 aa  86.3  5e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.420878 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7115  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.16 
 
 
253 aa  86.3  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.963222 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4406  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.11 
 
 
253 aa  86.3  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.410481  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1200  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.44 
 
 
287 aa  85.9  6e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5157  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.26 
 
 
271 aa  85.9  6e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5564  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.62 
 
 
250 aa  85.9  6e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0387947  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2810  short chain dehydrogenase  30.45 
 
 
238 aa  85.9  6e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0269  sorbitol dehydrogenase  34.6 
 
 
263 aa  85.9  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2428  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.28 
 
 
285 aa  85.5  7e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00441007 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5646  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.88 
 
 
256 aa  85.9  7e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000512545 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2677  short chain dehydrogenase  30.45 
 
 
238 aa  85.5  7e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2309  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.44 
 
 
267 aa  85.5  8e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3894  short chain dehydrogenase  32.08 
 
 
253 aa  85.5  8e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.933722  normal  0.0806905 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2445  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.35 
 
 
257 aa  85.5  8e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3070  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.21 
 
 
267 aa  85.5  8e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.49838  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.07 
 
 
246 aa  85.5  8e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.650868  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2079  short chain dehydrogenase  33.18 
 
 
255 aa  84.7  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5847  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.94 
 
 
281 aa  84.7  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>