134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2184 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_2184  chromosome segregation and condensation protein ScpA  100 
 
 
255 aa  507  1e-143  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0748  chromosome segregation and condensation protein ScpA  52.61 
 
 
238 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0457996  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1830  chromosome segregation and condensation protein ScpA  54.51 
 
 
250 aa  202  4e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1011  condensin subunit ScpA  51.81 
 
 
253 aa  188  7e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.685255 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0026  chromosome segregation and condensation protein ScpA  49.12 
 
 
244 aa  188  9e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2588  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.94 
 
 
405 aa  131  1.0000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.342818  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3204  chromosome segregation and condensation protein ScpA  43.39 
 
 
204 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2737  chromosome segregation and condensation protein ScpA  38.25 
 
 
299 aa  124  2e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.577112  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1340  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.55 
 
 
386 aa  122  6e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1498  condensin subunit ScpA  39.15 
 
 
285 aa  110  3e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00138218  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0528  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.41 
 
 
322 aa  109  5e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.769453  normal  0.399884 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0593  condensin subunit ScpA  37.5 
 
 
339 aa  107  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1160  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.06 
 
 
221 aa  89.4  5e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3001  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.85 
 
 
364 aa  85.9  6e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.428168  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0951  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.07 
 
 
256 aa  81.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0924  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.07 
 
 
256 aa  81.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1510  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.86 
 
 
256 aa  80.5  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000966979 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0018  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.13 
 
 
202 aa  76.3  0.0000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1145  condensin subunit ScpA  26.98 
 
 
284 aa  75.9  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0595963  hitchhiker  0.00600954 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3703  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.44 
 
 
248 aa  73.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.971472  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2757  segregation and condensation protein A  39.02 
 
 
248 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3887  segregation and condensation protein A  38.27 
 
 
247 aa  62.4  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4125  segregation and condensation protein A  38.27 
 
 
247 aa  62  0.000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3799  segregation and condensation protein A  38.27 
 
 
247 aa  62  0.000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3814  segregation and condensation protein A  38.27 
 
 
247 aa  62  0.000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4078  segregation and condensation protein A  38.27 
 
 
247 aa  62  0.000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000932909 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4189  segregation and condensation protein A  38.27 
 
 
247 aa  62  0.000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0914605  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3968  segregation and condensation protein A  38.27 
 
 
247 aa  62  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4278  segregation and condensation protein A  38.27 
 
 
247 aa  62  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1974  condensin subunit ScpA  24.44 
 
 
278 aa  60.8  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.776999 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1071  segregation and condensation protein A  37.04 
 
 
247 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2297  chromosome segregation and condensation protein ScpA  42.47 
 
 
285 aa  60.5  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4167  segregation and condensation protein A  37.04 
 
 
247 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0529217  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2403  putative segregation and condensation protein A  28.16 
 
 
300 aa  59.7  0.00000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.389122  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1926  chromosome segregation and condensation protein ScpA  42.47 
 
 
285 aa  59.7  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1832  hypothetical protein  35 
 
 
245 aa  58.2  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.85577  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0829  chromosome segregation and condensation protein ScpA  26.36 
 
 
222 aa  58.5  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1652  chromosome segregation and condensation protein ScpA  40.91 
 
 
240 aa  58.5  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.681706 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3421  condensin subunit ScpA  26.49 
 
 
274 aa  57.4  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1848  chromosome segregation and condensation protein ScpA  25.38 
 
 
286 aa  56.2  0.0000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.448814  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01671  hypothetical protein  26.32 
 
 
296 aa  55.8  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0290  putative segregation and condensation protein A  27.38 
 
 
307 aa  55.5  0.0000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0886  hypothetical protein  37.88 
 
 
247 aa  53.9  0.000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.855762  hitchhiker  0.000000000000790722 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0093  putative segregation and condensation protein A  31.17 
 
 
255 aa  53.9  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01791  hypothetical protein  25.19 
 
 
277 aa  52.8  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1223  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.84 
 
 
261 aa  52.8  0.000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0979835  normal  0.2931 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2233  segregation and condensation protein A  35.63 
 
 
254 aa  52.4  0.000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.292577  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02231  hypothetical protein  28.57 
 
 
297 aa  51.6  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0687  condensin subunit ScpA  37.5 
 
 
264 aa  51.6  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2249  chromosome segregation and condensation protein ScpA  37.5 
 
 
273 aa  51.6  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0193462  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1327  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.46 
 
 
263 aa  51.6  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.583538  normal  0.373498 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1517  hypothetical protein  29.12 
 
 
297 aa  51.2  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0391  segregation and condensation protein A  31.76 
 
 
249 aa  50.8  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0384  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.33 
 
 
260 aa  51.2  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.268591 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1747  chromosome segregation and condensation protein ScpA  37.5 
 
 
267 aa  50.4  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.789122  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1299  hypothetical protein  37.7 
 
 
254 aa  50.4  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5641  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.67 
 
 
285 aa  50.4  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.720807 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1154  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35 
 
 
222 aa  50.1  0.00004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.339133  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01701  hypothetical protein  25.97 
 
 
273 aa  49.3  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0111  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.65 
 
 
245 aa  49.3  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.376959 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0307  segregation and condensation protein A  23.11 
 
 
237 aa  48.9  0.00007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4410  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.33 
 
 
282 aa  48.1  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.191831  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2584  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.51 
 
 
259 aa  48.5  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000515385  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2599  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.5 
 
 
293 aa  48.5  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.495238 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1996  putative segregation and condensation protein A  29.27 
 
 
248 aa  47.4  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1959  condensin subunit ScpA  32.81 
 
 
266 aa  47.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000817707  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1775  condensin subunit ScpA  30.59 
 
 
270 aa  47.8  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.208606  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3644  condensin subunit ScpA  32.91 
 
 
262 aa  47.4  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1022  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.86 
 
 
251 aa  47.8  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1883  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.94 
 
 
273 aa  47.4  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0105417  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3487  condensin subunit ScpA  30.86 
 
 
291 aa  47  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.779049 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2196  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.86 
 
 
290 aa  47  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0444422  normal  0.714691 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2386  hypothetical protein  31.25 
 
 
293 aa  46.6  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000700551 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0849  segregation and condensation protein A  30.86 
 
 
291 aa  46.6  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.692099  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01681  hypothetical protein  25.88 
 
 
273 aa  46.6  0.0004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.450973  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06800  hypothetical protein  33.85 
 
 
313 aa  46.6  0.0004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.147317  normal  0.465292 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1736  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.06 
 
 
238 aa  46.2  0.0005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2762  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.1 
 
 
303 aa  46.2  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.151501 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0097  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.87 
 
 
241 aa  46.2  0.0005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0377485  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1382  chromosome segregation and condensation protein ScpA  23.71 
 
 
285 aa  46.2  0.0006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0547025  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26721  hypothetical protein  30.61 
 
 
300 aa  46.2  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0325  chromosome segregation and condensation protein ScpA  20.09 
 
 
202 aa  45.8  0.0006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2511  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.96 
 
 
278 aa  45.4  0.0009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.328844 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2758  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.81 
 
 
248 aa  45.4  0.0009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0371635  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0703  segregation and condensation protein A  29.63 
 
 
291 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.100396  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1205  segregation and condensation protein A  29.63 
 
 
291 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.65899  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1510  condensin subunit ScpA  33.33 
 
 
270 aa  45.4  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.509233 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1830  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.63 
 
 
290 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.592453  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2060  segregation and condensation protein A  27.36 
 
 
248 aa  45.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.721203  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1774  segregation and condensation protein A  27.36 
 
 
248 aa  45.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2488  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.63 
 
 
290 aa  45.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.963803  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2441  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.63 
 
 
290 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2310  segregation and condensation protein A  29.63 
 
 
291 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0354296  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2976  segregation and condensation protein A  29.63 
 
 
291 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0309042  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1044  segregation and condensation protein A  29.63 
 
 
291 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1051  segregation and condensation protein A  29.63 
 
 
291 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1623  segregation and condensation protein A  29.63 
 
 
291 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.000113336  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2446  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.63 
 
 
290 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0805764  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2356  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.63 
 
 
290 aa  45.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.489348  normal  0.226731 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1011  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.63 
 
 
291 aa  45.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>