75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1160 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_1160  chromosome segregation and condensation protein ScpA  100 
 
 		 221 aa  434  1e-121  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0593  condensin subunit ScpA  42.48 
 
 		 339 aa  160  2e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1498  condensin subunit ScpA  37.83 
 
 		 285 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00138218  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2737  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34 
 
 		 299 aa  108  9.000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.577112  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1340  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.65 
 
 		 386 aa  107  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0528  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.47 
 
 		 322 aa  105  4e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.769453  normal  0.399884 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2184  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.36 
 
 		 255 aa  105  4e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2588  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.98 
 
 		 405 aa  105  5e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.342818  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0026  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.22 
 
 		 244 aa  104  1e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1011  condensin subunit ScpA  33.46 
 
 		 253 aa  100  1e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.685255 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1830  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.47 
 
 		 250 aa  99  5e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3001  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.92 
 
 		 364 aa  91.7  9e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.428168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0748  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.06 
 
 		 238 aa  86.3  4e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0457996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1974  condensin subunit ScpA  29.15 
 
 		 278 aa  83.2  0.000000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.776999 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0018  chromosome segregation and condensation protein ScpA  25.59 
 
 		 202 aa  76.6  0.0000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1510  chromosome segregation and condensation protein ScpA  26.72 
 
 		 256 aa  75.1  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000966979 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3703  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.47 
 
 		 248 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.971472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3204  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.98 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3421  condensin subunit ScpA  24.71 
 
 		 274 aa  65.1  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01701  hypothetical protein  26.09 
 
 		 273 aa  65.1  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0924  chromosome segregation and condensation protein ScpA  26.86 
 
 		 256 aa  63.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0951  chromosome segregation and condensation protein ScpA  26.86 
 
 		 256 aa  63.2  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01791  hypothetical protein  26 
 
 		 277 aa  63.2  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2403  putative segregation and condensation protein A  26.64 
 
 		 300 aa  62.8  0.000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.389122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01681  hypothetical protein  25 
 
 		 273 aa  62.4  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.450973  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1517  hypothetical protein  26.09 
 
 		 297 aa  62  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0153  hypothetical protein  25 
 
 		 273 aa  61.6  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02231  hypothetical protein  25.3 
 
 		 297 aa  60.5  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1382  chromosome segregation and condensation protein ScpA  28.57 
 
 		 285 aa  60.1  0.00000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0547025  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1145  condensin subunit ScpA  25.19 
 
 		 284 aa  58.9  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0595963  hitchhiker  0.00600954 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0290  putative segregation and condensation protein A  27.13 
 
 		 307 aa  58.2  0.00000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01671  hypothetical protein  21.98 
 
 		 296 aa  57.4  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0829  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.86 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26721  hypothetical protein  26.61 
 
 		 300 aa  53.5  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1566  chromosome segregation and condensation protein ScpA  25 
 
 		 243 aa  53.1  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0721026  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2758  chromosome segregation and condensation protein ScpA  25.65 
 
 		 248 aa  51.6  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0371635  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2233  segregation and condensation protein A  22.75 
 
 		 254 aa  50.1  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.292577  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0325  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.09 
 
 		 202 aa  49.3  0.00004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2584  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.43 
 
 		 259 aa  49.7  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000515385  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0522  chromosome segregation and condensation protein ScpA  24.15 
 
 		 225 aa  48.9  0.00005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1747  chromosome segregation and condensation protein ScpA  24.08 
 
 		 267 aa  48.9  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.789122  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0059  condensin subunit ScpA  36.21 
 
 		 222 aa  48.5  0.00008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1154  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.48 
 
 		 222 aa  48.1  0.00009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.339133  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1058  segregation and condensation protein A  30.77 
 
 		 243 aa  48.1  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2757  segregation and condensation protein A  23.55 
 
 		 248 aa  47.8  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0764  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.48 
 
 		 222 aa  47.8  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.705704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3644  condensin subunit ScpA  34.38 
 
 		 262 aa  48.1  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1848  chromosome segregation and condensation protein ScpA  24.9 
 
 		 286 aa  47.4  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.448814  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1736  chromosome segregation and condensation protein ScpA  37.1 
 
 		 238 aa  47  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1926  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.75 
 
 		 285 aa  46.6  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4189  segregation and condensation protein A  22.4 
 
 		 247 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0914605  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3887  segregation and condensation protein A  30.88 
 
 		 247 aa  46.2  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0886  hypothetical protein  24.23 
 
 		 247 aa  45.8  0.0004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.855762  hitchhiker  0.000000000000790722 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1652  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.21 
 
 		 240 aa  45.8  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.681706 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3968  segregation and condensation protein A  22.8 
 
 		 247 aa  45.8  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4278  segregation and condensation protein A  22.8 
 
 		 247 aa  45.8  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2297  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.5 
 
 		 285 aa  45.4  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0391  segregation and condensation protein A  23.24 
 
 		 249 aa  45.1  0.0009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4125  segregation and condensation protein A  28.77 
 
 		 247 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3799  segregation and condensation protein A  22.4 
 
 		 247 aa  44.7  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3814  segregation and condensation protein A  22.4 
 
 		 247 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4078  segregation and condensation protein A  22.4 
 
 		 247 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000932909 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1071  segregation and condensation protein A  28.77 
 
 		 247 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4167  segregation and condensation protein A  28.77 
 
 		 247 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0529217  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1552  hypothetical protein  21.95 
 
 		 243 aa  43.9  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1583  hypothetical protein  21.95 
 
 		 243 aa  43.9  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1687  chromosome segregation and condensation protein ScpA  41.38 
 
 		 276 aa  44.3  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.331985  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1004  condensin subunit ScpA  32.1 
 
 		 254 aa  43.5  0.003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1223  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.31 
 
 		 261 aa  42.7  0.004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0979835  normal  0.2931 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0111  chromosome segregation and condensation protein ScpA  28.77 
 
 		 245 aa  42.7  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.376959 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0384  chromosome segregation and condensation protein ScpA  26.15 
 
 		 260 aa  42.4  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.268591 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1959  condensin subunit ScpA  29.51 
 
 		 266 aa  42.4  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000817707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1022  chromosome segregation and condensation protein ScpA  20.8 
 
 		 251 aa  42.4  0.006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2457  condensin subunit ScpA  32.76 
 
 		 283 aa  42  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.27105  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1595  segregation and condensation protein A  21.98 
 
 		 235 aa  42  0.008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>