92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1498 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_1498  condensin subunit ScpA  100 
 
 
285 aa  560  1e-158  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00138218  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0593  condensin subunit ScpA  50.62 
 
 
339 aa  223  3e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2588  chromosome segregation and condensation protein ScpA  37.93 
 
 
405 aa  131  1.0000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.342818  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2737  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.5 
 
 
299 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.577112  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1160  chromosome segregation and condensation protein ScpA  38.64 
 
 
221 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1830  chromosome segregation and condensation protein ScpA  41.7 
 
 
250 aa  125  8.000000000000001e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1340  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.38 
 
 
386 aa  123  4e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0748  chromosome segregation and condensation protein ScpA  38.24 
 
 
238 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0457996  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0528  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.12 
 
 
322 aa  119  6e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.769453  normal  0.399884 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1011  condensin subunit ScpA  38.78 
 
 
253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.685255 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2184  chromosome segregation and condensation protein ScpA  39.92 
 
 
255 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3001  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36 
 
 
364 aa  113  4.0000000000000004e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.428168  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0026  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.9 
 
 
244 aa  97.1  3e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1145  condensin subunit ScpA  26.92 
 
 
284 aa  83.2  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0595963  hitchhiker  0.00600954 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3421  condensin subunit ScpA  27.78 
 
 
274 aa  77.8  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1974  condensin subunit ScpA  27.2 
 
 
278 aa  75.1  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.776999 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1382  chromosome segregation and condensation protein ScpA  27.53 
 
 
285 aa  74.7  0.000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0547025  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0951  chromosome segregation and condensation protein ScpA  27.67 
 
 
256 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0829  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.88 
 
 
222 aa  73.9  0.000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0924  chromosome segregation and condensation protein ScpA  28.12 
 
 
256 aa  73.9  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1510  chromosome segregation and condensation protein ScpA  28.57 
 
 
256 aa  73.9  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000966979 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0018  chromosome segregation and condensation protein ScpA  24.55 
 
 
202 aa  73.2  0.000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01671  hypothetical protein  30.71 
 
 
296 aa  68.6  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2403  putative segregation and condensation protein A  29.55 
 
 
300 aa  67.8  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.389122  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01791  hypothetical protein  28.75 
 
 
277 aa  66.6  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3703  chromosome segregation and condensation protein ScpA  26.18 
 
 
248 aa  65.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.971472  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1848  chromosome segregation and condensation protein ScpA  26.12 
 
 
286 aa  65.1  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.448814  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2318  chromosome segregation and condensation protein ScpA  25.6 
 
 
303 aa  63.2  0.000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1517  hypothetical protein  30.61 
 
 
297 aa  63.2  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01701  hypothetical protein  26.78 
 
 
273 aa  62.4  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02231  hypothetical protein  30.33 
 
 
297 aa  62.4  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1154  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.33 
 
 
222 aa  60.1  0.00000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.339133  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0059  condensin subunit ScpA  30.81 
 
 
222 aa  60.1  0.00000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0764  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.13 
 
 
222 aa  57.8  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.705704  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3204  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.38 
 
 
204 aa  56.6  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01681  hypothetical protein  27.16 
 
 
273 aa  55.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.450973  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0153  hypothetical protein  27.2 
 
 
273 aa  54.3  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2758  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35 
 
 
248 aa  52.8  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0371635  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1223  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.26 
 
 
261 aa  52.4  0.000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0979835  normal  0.2931 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4189  segregation and condensation protein A  24.6 
 
 
247 aa  52.4  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0914605  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3968  segregation and condensation protein A  24.6 
 
 
247 aa  51.6  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0290  putative segregation and condensation protein A  29.55 
 
 
307 aa  52  0.00001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4278  segregation and condensation protein A  24.6 
 
 
247 aa  51.6  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3799  segregation and condensation protein A  24.6 
 
 
247 aa  51.6  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4078  segregation and condensation protein A  24.6 
 
 
247 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000932909 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4125  segregation and condensation protein A  24.6 
 
 
247 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3814  segregation and condensation protein A  24.6 
 
 
247 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1595  segregation and condensation protein A  34.88 
 
 
235 aa  49.7  0.00006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09620  hypothetical protein  24.7 
 
 
259 aa  48.5  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0183259  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1652  chromosome segregation and condensation protein ScpA  22.73 
 
 
240 aa  48.9  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.681706 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1022  chromosome segregation and condensation protein ScpA  41.67 
 
 
251 aa  48.5  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1004  condensin subunit ScpA  23.2 
 
 
254 aa  48.5  0.0001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2762  chromosome segregation and condensation protein ScpA  24.46 
 
 
303 aa  47.8  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.151501 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0307  segregation and condensation protein A  33.78 
 
 
237 aa  47.8  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1079  chromosome segregation and condensation protein ScpA  22.45 
 
 
276 aa  47.4  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0957  chromosome segregation and condensation protein ScpA  22.47 
 
 
283 aa  47  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1832  hypothetical protein  21.43 
 
 
245 aa  47  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.85577  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1299  hypothetical protein  32.58 
 
 
254 aa  46.6  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2757  segregation and condensation protein A  23.39 
 
 
248 aa  46.6  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2233  segregation and condensation protein A  22.48 
 
 
254 aa  46.2  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.292577  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0325  chromosome segregation and condensation protein ScpA  21.27 
 
 
202 aa  45.8  0.0007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26721  hypothetical protein  27.89 
 
 
300 aa  45.8  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1398  segregation and condensation protein A  24.68 
 
 
242 aa  45.8  0.0008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.331498  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2815  chromosome segregation and condensation protein ScpA  22.14 
 
 
286 aa  45.8  0.0009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.036308  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2195  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.79 
 
 
293 aa  45.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.156769 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2599  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.79 
 
 
293 aa  45.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.495238 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3492  condensin subunit ScpA  24.11 
 
 
286 aa  45.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.367211  normal  0.705468 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2386  hypothetical protein  29.49 
 
 
293 aa  45.4  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000700551 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0886  hypothetical protein  34.43 
 
 
247 aa  45.1  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.855762  hitchhiker  0.000000000000790722 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1959  condensin subunit ScpA  22.61 
 
 
266 aa  44.3  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000817707  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5641  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.33 
 
 
285 aa  44.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.720807 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1157  condensin subunit ScpA  23.49 
 
 
283 aa  44.7  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.995022 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07170  chromosome segregation and condensation protein ScpA  23.97 
 
 
243 aa  43.9  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000172776  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1725  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.58 
 
 
285 aa  43.5  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.932075 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2297  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.76 
 
 
285 aa  43.5  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0721  condensin subunit ScpA  21.95 
 
 
276 aa  43.5  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5772  condensin subunit ScpA  23.33 
 
 
290 aa  43.1  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.160847  normal  0.239961 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2773  condensin subunit ScpA  31.15 
 
 
301 aa  43.5  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.601165 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3839  condensin subunit ScpA  20.72 
 
 
283 aa  43.1  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.203132  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1926  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.76 
 
 
285 aa  42.7  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2488  chromosome segregation and condensation protein ScpA  23.33 
 
 
290 aa  43.1  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.963803  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2356  chromosome segregation and condensation protein ScpA  23.33 
 
 
290 aa  42.7  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.489348  normal  0.226731 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2196  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.15 
 
 
290 aa  42.7  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0444422  normal  0.714691 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0853  chromosome segregation and condensation protein ScpA  22.5 
 
 
290 aa  42.7  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1134  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.03 
 
 
251 aa  42.7  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0873  hypothetical protein  24.46 
 
 
258 aa  42.7  0.007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0366031  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0669  condensin subunit ScpA  28.21 
 
 
296 aa  42.7  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2446  chromosome segregation and condensation protein ScpA  22.5 
 
 
290 aa  42.4  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0805764  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0645  chromosome segregation and condensation protein ScpA  23.13 
 
 
287 aa  42.4  0.008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0687  condensin subunit ScpA  34.43 
 
 
264 aa  42.7  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1830  chromosome segregation and condensation protein ScpA  22.5 
 
 
290 aa  42.4  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.592453  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2441  chromosome segregation and condensation protein ScpA  22.5 
 
 
290 aa  42.4  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>