57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0059 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0059  condensin subunit ScpA  100 
 
 
222 aa  437  9.999999999999999e-123  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1154  chromosome segregation and condensation protein ScpA  94.14 
 
 
222 aa  378  1e-104  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.339133  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0764  chromosome segregation and condensation protein ScpA  93.24 
 
 
222 aa  358  3e-98  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.705704  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0829  chromosome segregation and condensation protein ScpA  75.88 
 
 
222 aa  333  1e-90  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1022  chromosome segregation and condensation protein ScpA  48.91 
 
 
251 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0593  condensin subunit ScpA  30.43 
 
 
339 aa  81.3  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1830  chromosome segregation and condensation protein ScpA  26.92 
 
 
250 aa  63.5  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0026  chromosome segregation and condensation protein ScpA  27.43 
 
 
244 aa  60.8  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1011  condensin subunit ScpA  25.42 
 
 
253 aa  57.8  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.685255 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0886  hypothetical protein  26.61 
 
 
247 aa  53.9  0.000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.855762  hitchhiker  0.000000000000790722 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1498  condensin subunit ScpA  28.91 
 
 
285 aa  53.5  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00138218  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2184  chromosome segregation and condensation protein ScpA  23.14 
 
 
255 aa  52.4  0.000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4189  segregation and condensation protein A  21.94 
 
 
247 aa  52  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0914605  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2757  segregation and condensation protein A  22.32 
 
 
248 aa  52  0.000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0748  chromosome segregation and condensation protein ScpA  22.27 
 
 
238 aa  51.6  0.000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0457996  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4125  segregation and condensation protein A  21.94 
 
 
247 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4167  segregation and condensation protein A  21.94 
 
 
247 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0529217  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1071  segregation and condensation protein A  21.94 
 
 
247 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4278  segregation and condensation protein A  21.94 
 
 
247 aa  50.4  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3968  segregation and condensation protein A  21.94 
 
 
247 aa  50.4  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3799  segregation and condensation protein A  21.94 
 
 
247 aa  50.8  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3814  segregation and condensation protein A  21.94 
 
 
247 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4078  segregation and condensation protein A  21.94 
 
 
247 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000932909 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1382  chromosome segregation and condensation protein ScpA  23.71 
 
 
285 aa  48.5  0.00008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0547025  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1160  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.21 
 
 
221 aa  48.1  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1652  chromosome segregation and condensation protein ScpA  24.79 
 
 
240 aa  47.8  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.681706 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3887  segregation and condensation protein A  20.68 
 
 
247 aa  46.2  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0018  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35 
 
 
202 aa  46.2  0.0004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1489  condensin subunit ScpA  23.35 
 
 
272 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.310818  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0755  condensin subunit ScpA  23.21 
 
 
263 aa  45.8  0.0005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000908175  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0953  chromosome segregation and condensation protein ScpA  24.46 
 
 
264 aa  45.4  0.0007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1327  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.23 
 
 
263 aa  45.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.583538  normal  0.373498 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3703  chromosome segregation and condensation protein ScpA  21.78 
 
 
248 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.971472  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf010  segregation and condensation protein A  32.81 
 
 
273 aa  44.3  0.002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2233  segregation and condensation protein A  23.42 
 
 
254 aa  43.5  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.292577  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2196  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.08 
 
 
290 aa  43.1  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0444422  normal  0.714691 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06800  hypothetical protein  31.25 
 
 
313 aa  43.5  0.003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.147317  normal  0.465292 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3584  hypothetical protein  22.57 
 
 
272 aa  43.1  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.169624 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0793  chromosome segregation and condensation protein ScpA  24.03 
 
 
236 aa  42.7  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.148291  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09620  hypothetical protein  32.81 
 
 
259 aa  43.1  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0183259  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1812  hypothetical protein  22.57 
 
 
272 aa  42.4  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0522  chromosome segregation and condensation protein ScpA  21.89 
 
 
225 aa  42.4  0.005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3861  condensin subunit ScpA  28.79 
 
 
282 aa  42.4  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.684068  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1736  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.33 
 
 
238 aa  42.4  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1747  chromosome segregation and condensation protein ScpA  21.22 
 
 
267 aa  42  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.789122  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0645  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.84 
 
 
287 aa  42  0.007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1299  hypothetical protein  22.41 
 
 
254 aa  42  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2588  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.51 
 
 
405 aa  41.6  0.009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.342818  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1623  segregation and condensation protein A  32.08 
 
 
291 aa  41.6  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.000113336  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0703  segregation and condensation protein A  32.08 
 
 
291 aa  41.6  0.009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.100396  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1205  segregation and condensation protein A  32.08 
 
 
291 aa  41.6  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.65899  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0849  segregation and condensation protein A  29.85 
 
 
291 aa  41.6  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.692099  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2310  segregation and condensation protein A  32.08 
 
 
291 aa  41.6  0.009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0354296  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2976  segregation and condensation protein A  32.08 
 
 
291 aa  41.6  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0309042  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1044  segregation and condensation protein A  32.08 
 
 
291 aa  41.6  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1051  segregation and condensation protein A  32.08 
 
 
291 aa  41.6  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0669  condensin subunit ScpA  32.08 
 
 
296 aa  41.6  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>