60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0593 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0593  condensin subunit ScpA  100 
 
 		 339 aa  679    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1498  condensin subunit ScpA  50.62 
 
 		 285 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00138218  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1160  chromosome segregation and condensation protein ScpA  42.04 
 
 		 221 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0748  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35 
 
 		 238 aa  112  9e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0457996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1830  chromosome segregation and condensation protein ScpA  37.13 
 
 		 250 aa  110  3e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2588  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.81 
 
 		 405 aa  102  9e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.342818  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2184  chromosome segregation and condensation protein ScpA  37.07 
 
 		 255 aa  102  1e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2737  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.5 
 
 		 299 aa  102  1e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.577112  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0528  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.14 
 
 		 322 aa  99.8  6e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.769453  normal  0.399884 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1340  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.31 
 
 		 386 aa  93.2  6e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1011  condensin subunit ScpA  32.93 
 
 		 253 aa  90.9  2e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.685255 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0026  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.9 
 
 		 244 aa  85.5  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3001  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.38 
 
 		 364 aa  82.8  0.000000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.428168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3703  chromosome segregation and condensation protein ScpA  26.27 
 
 		 248 aa  76.6  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.971472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1382  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.45 
 
 		 285 aa  73.9  0.000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0547025  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0829  chromosome segregation and condensation protein ScpA  28.3 
 
 		 222 aa  68.9  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2403  putative segregation and condensation protein A  27.57 
 
 		 300 aa  67  0.0000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.389122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1154  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.95 
 
 		 222 aa  66.2  0.0000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.339133  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0018  chromosome segregation and condensation protein ScpA  27.6 
 
 		 202 aa  64.7  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0764  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.47 
 
 		 222 aa  64.3  0.000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.705704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0059  condensin subunit ScpA  28.5 
 
 		 222 aa  63.5  0.000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1974  condensin subunit ScpA  25.49 
 
 		 278 aa  63.2  0.000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.776999 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1510  chromosome segregation and condensation protein ScpA  25.1 
 
 		 256 aa  59.3  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000966979 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3421  condensin subunit ScpA  25.37 
 
 		 274 aa  57.8  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02231  hypothetical protein  27.6 
 
 		 297 aa  56.2  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0522  chromosome segregation and condensation protein ScpA  23.65 
 
 		 225 aa  55.5  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0290  putative segregation and condensation protein A  26.83 
 
 		 307 aa  55.8  0.000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0924  chromosome segregation and condensation protein ScpA  25.58 
 
 		 256 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01791  hypothetical protein  27.2 
 
 		 277 aa  54.7  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0951  chromosome segregation and condensation protein ScpA  25.58 
 
 		 256 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1517  hypothetical protein  27.2 
 
 		 297 aa  55.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01701  hypothetical protein  25 
 
 		 273 aa  54.3  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01671  hypothetical protein  27.09 
 
 		 296 aa  53.9  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1145  condensin subunit ScpA  24.05 
 
 		 284 aa  53.5  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0595963  hitchhiker  0.00600954 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2757  segregation and condensation protein A  32.5 
 
 		 248 aa  52.8  0.000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3887  segregation and condensation protein A  33.75 
 
 		 247 aa  52.4  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1022  chromosome segregation and condensation protein ScpA  41.54 
 
 		 251 aa  51.6  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4078  segregation and condensation protein A  33.75 
 
 		 247 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000932909 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3968  segregation and condensation protein A  33.75 
 
 		 247 aa  50.8  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4189  segregation and condensation protein A  33.75 
 
 		 247 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0914605  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4125  segregation and condensation protein A  33.75 
 
 		 247 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3799  segregation and condensation protein A  33.75 
 
 		 247 aa  50.8  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3814  segregation and condensation protein A  33.75 
 
 		 247 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4278  segregation and condensation protein A  33.75 
 
 		 247 aa  50.8  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4167  segregation and condensation protein A  33.75 
 
 		 247 aa  50.1  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0529217  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3204  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.38 
 
 		 204 aa  50.1  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1071  segregation and condensation protein A  33.75 
 
 		 247 aa  50.1  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1848  chromosome segregation and condensation protein ScpA  25.1 
 
 		 286 aa  49.7  0.00007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.448814  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1747  chromosome segregation and condensation protein ScpA  24.79 
 
 		 267 aa  47  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.789122  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2233  segregation and condensation protein A  34.78 
 
 		 254 aa  46.2  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.292577  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0391  segregation and condensation protein A  32.1 
 
 		 249 aa  46.6  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0325  chromosome segregation and condensation protein ScpA  21.62 
 
 		 202 aa  46.2  0.0008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01681  hypothetical protein  25.1 
 
 		 273 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.450973  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0886  hypothetical protein  34.72 
 
 		 247 aa  45.8  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.855762  hitchhiker  0.000000000000790722 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3425  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.26 
 
 		 261 aa  45.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1652  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.48 
 
 		 240 aa  45.1  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.681706 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1552  hypothetical protein  33.75 
 
 		 243 aa  43.9  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1583  hypothetical protein  33.75 
 
 		 243 aa  43.9  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0602  chromosomal segregation and condensation protein A  27.78 
 
 		 278 aa  43.1  0.006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0818988  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0153  hypothetical protein  25.52 
 
 		 273 aa  43.5  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>