63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0026 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_0026  chromosome segregation and condensation protein ScpA  100 
 
 
244 aa  503  9.999999999999999e-143  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3204  chromosome segregation and condensation protein ScpA  99.02 
 
 
204 aa  418  1e-116  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0748  chromosome segregation and condensation protein ScpA  48.07 
 
 
238 aa  201  8e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0457996  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2184  chromosome segregation and condensation protein ScpA  49.12 
 
 
255 aa  190  1e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1830  chromosome segregation and condensation protein ScpA  48.31 
 
 
250 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1011  condensin subunit ScpA  46.06 
 
 
253 aa  170  2e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.685255 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2737  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.23 
 
 
299 aa  122  7e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.577112  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2588  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.3 
 
 
405 aa  113  2.0000000000000002e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.342818  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1340  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.55 
 
 
386 aa  110  3e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0528  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.21 
 
 
322 aa  107  1e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.769453  normal  0.399884 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0593  condensin subunit ScpA  32.76 
 
 
339 aa  95.9  6e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1498  condensin subunit ScpA  31.54 
 
 
285 aa  95.1  9e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00138218  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1160  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.86 
 
 
221 aa  85.1  9e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3001  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.89 
 
 
364 aa  82  0.000000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.428168  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3703  chromosome segregation and condensation protein ScpA  28.34 
 
 
248 aa  72.8  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.971472  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0018  chromosome segregation and condensation protein ScpA  24.56 
 
 
202 aa  70.5  0.00000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1510  chromosome segregation and condensation protein ScpA  27.56 
 
 
256 aa  69.7  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000966979 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0829  chromosome segregation and condensation protein ScpA  27.27 
 
 
222 aa  67.8  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1974  condensin subunit ScpA  25 
 
 
278 aa  63.5  0.000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.776999 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0764  chromosome segregation and condensation protein ScpA  28.07 
 
 
222 aa  61.6  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.705704  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1145  condensin subunit ScpA  24.62 
 
 
284 aa  60.8  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0595963  hitchhiker  0.00600954 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0059  condensin subunit ScpA  26.75 
 
 
222 aa  61.2  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1154  chromosome segregation and condensation protein ScpA  26.75 
 
 
222 aa  60.1  0.00000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.339133  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3421  condensin subunit ScpA  25.97 
 
 
274 aa  56.6  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0951  chromosome segregation and condensation protein ScpA  25.1 
 
 
256 aa  55.8  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0924  chromosome segregation and condensation protein ScpA  25.1 
 
 
256 aa  55.5  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01671  hypothetical protein  25.64 
 
 
296 aa  54.7  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1517  hypothetical protein  26.82 
 
 
297 aa  54.3  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2403  putative segregation and condensation protein A  25.45 
 
 
300 aa  53.9  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.389122  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02231  hypothetical protein  27.02 
 
 
297 aa  52.4  0.000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01701  hypothetical protein  25.59 
 
 
273 aa  52.4  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01791  hypothetical protein  25.47 
 
 
277 aa  50.8  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0721  chromosome segregation and condensation protein ScpA  23.24 
 
 
304 aa  51.2  0.00002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00886352  normal  0.0253766 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1848  chromosome segregation and condensation protein ScpA  25.45 
 
 
286 aa  48.9  0.00006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.448814  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2757  segregation and condensation protein A  22.54 
 
 
248 aa  49.3  0.00006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0325  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.33 
 
 
202 aa  48.9  0.00008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3644  condensin subunit ScpA  20.9 
 
 
262 aa  48.5  0.00009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4125  segregation and condensation protein A  30.77 
 
 
247 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4189  segregation and condensation protein A  30.77 
 
 
247 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0914605  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3968  segregation and condensation protein A  30.77 
 
 
247 aa  48.1  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3799  segregation and condensation protein A  30.77 
 
 
247 aa  48.1  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3814  segregation and condensation protein A  30.77 
 
 
247 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4078  segregation and condensation protein A  30.77 
 
 
247 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000932909 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4278  segregation and condensation protein A  30.77 
 
 
247 aa  48.1  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2233  segregation and condensation protein A  31.52 
 
 
254 aa  48.1  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.292577  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0886  hypothetical protein  30 
 
 
247 aa  47.8  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.855762  hitchhiker  0.000000000000790722 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1382  chromosome segregation and condensation protein ScpA  22.94 
 
 
285 aa  47.8  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0547025  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1022  chromosome segregation and condensation protein ScpA  25.11 
 
 
251 aa  47.4  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1071  segregation and condensation protein A  29.67 
 
 
247 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3887  segregation and condensation protein A  29.67 
 
 
247 aa  46.6  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4167  segregation and condensation protein A  29.67 
 
 
247 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0529217  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0384  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.43 
 
 
260 aa  46.2  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.268591 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2297  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.34 
 
 
285 aa  45.4  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1652  chromosome segregation and condensation protein ScpA  21.14 
 
 
240 aa  45.1  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.681706 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1926  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.34 
 
 
285 aa  44.7  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1327  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.81 
 
 
263 aa  44.7  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.583538  normal  0.373498 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3425  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.79 
 
 
261 aa  43.9  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06800  hypothetical protein  34.43 
 
 
313 aa  43.9  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.147317  normal  0.465292 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2599  chromosome segregation and condensation protein ScpA  24.58 
 
 
293 aa  43.5  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.495238 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0391  segregation and condensation protein A  32.14 
 
 
249 aa  42.7  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0687  condensin subunit ScpA  34.43 
 
 
264 aa  42.7  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1747  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.08 
 
 
267 aa  42  0.009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.789122  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0290  putative segregation and condensation protein A  23 
 
 
307 aa  42  0.01  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>