74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1830 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1830  chromosome segregation and condensation protein ScpA  100 
 
 		 250 aa  496  1e-139  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0748  chromosome segregation and condensation protein ScpA  52.74 
 
 		 238 aa  215  4e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0457996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2184  chromosome segregation and condensation protein ScpA  54.51 
 
 		 255 aa  207  9e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1011  condensin subunit ScpA  51.24 
 
 		 253 aa  178  7e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.685255 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0026  chromosome segregation and condensation protein ScpA  48.31 
 
 		 244 aa  174  9e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2737  chromosome segregation and condensation protein ScpA  37.55 
 
 		 299 aa  133  1.9999999999999998e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.577112  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2588  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.36 
 
 		 405 aa  126  3e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.342818  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0593  condensin subunit ScpA  37.97 
 
 		 339 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1498  condensin subunit ScpA  41.2 
 
 		 285 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00138218  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3204  chromosome segregation and condensation protein ScpA  45.64 
 
 		 204 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1340  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.32 
 
 		 386 aa  112  5e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0528  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.12 
 
 		 322 aa  111  9e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.769453  normal  0.399884 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3001  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.1 
 
 		 364 aa  85.5  6e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.428168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1160  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.9 
 
 		 221 aa  84  0.000000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3703  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.25 
 
 		 248 aa  83.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.971472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1510  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.76 
 
 		 256 aa  78.6  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000966979 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1974  condensin subunit ScpA  27.11 
 
 		 278 aa  71.6  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.776999 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0018  chromosome segregation and condensation protein ScpA  23.18 
 
 		 202 aa  70.5  0.00000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2403  putative segregation and condensation protein A  27.57 
 
 		 300 aa  69.3  0.00000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.389122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0951  chromosome segregation and condensation protein ScpA  26.56 
 
 		 256 aa  67.8  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0924  chromosome segregation and condensation protein ScpA  25.49 
 
 		 256 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0829  chromosome segregation and condensation protein ScpA  25.42 
 
 		 222 aa  64.7  0.000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1145  condensin subunit ScpA  30.6 
 
 		 284 aa  63.9  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0595963  hitchhiker  0.00600954 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1517  hypothetical protein  26.98 
 
 		 297 aa  64.3  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02231  hypothetical protein  26.59 
 
 		 297 aa  63.5  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4189  segregation and condensation protein A  24.9 
 
 		 247 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0914605  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2757  segregation and condensation protein A  28.14 
 
 		 248 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3421  condensin subunit ScpA  26.64 
 
 		 274 aa  60.5  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1848  chromosome segregation and condensation protein ScpA  24.34 
 
 		 286 aa  60.1  0.00000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.448814  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01671  hypothetical protein  27.65 
 
 		 296 aa  59.7  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0290  putative segregation and condensation protein A  25.84 
 
 		 307 aa  59.3  0.00000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4125  segregation and condensation protein A  24.51 
 
 		 247 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1071  segregation and condensation protein A  24.9 
 
 		 247 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4167  segregation and condensation protein A  24.9 
 
 		 247 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0529217  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3799  segregation and condensation protein A  26.95 
 
 		 247 aa  56.6  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3814  segregation and condensation protein A  26.95 
 
 		 247 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4078  segregation and condensation protein A  26.95 
 
 		 247 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000932909 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3968  segregation and condensation protein A  28.69 
 
 		 247 aa  56.6  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4278  segregation and condensation protein A  28.69 
 
 		 247 aa  56.6  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3887  segregation and condensation protein A  23.9 
 
 		 247 aa  56.2  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0764  chromosome segregation and condensation protein ScpA  40.32 
 
 		 222 aa  54.7  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.705704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01701  hypothetical protein  25.93 
 
 		 273 aa  53.9  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0059  condensin subunit ScpA  28.45 
 
 		 222 aa  53.9  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1154  chromosome segregation and condensation protein ScpA  40 
 
 		 222 aa  53.9  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.339133  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1382  chromosome segregation and condensation protein ScpA  25 
 
 		 285 aa  53.1  0.000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0547025  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0886  hypothetical protein  34.21 
 
 		 247 aa  52.8  0.000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.855762  hitchhiker  0.000000000000790722 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2297  chromosome segregation and condensation protein ScpA  37.18 
 
 		 285 aa  52.4  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1004  condensin subunit ScpA  26.63 
 
 		 254 aa  50.4  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1926  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.9 
 
 		 285 aa  51.2  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1022  chromosome segregation and condensation protein ScpA  28.21 
 
 		 251 aa  48.9  0.00008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2249  chromosome segregation and condensation protein ScpA  38.1 
 
 		 273 aa  48.5  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0193462  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26721  hypothetical protein  27.31 
 
 		 300 aa  48.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01791  hypothetical protein  24.54 
 
 		 277 aa  48.5  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0153  hypothetical protein  25.28 
 
 		 273 aa  47  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01681  hypothetical protein  25.74 
 
 		 273 aa  47  0.0003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.450973  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1299  hypothetical protein  35 
 
 		 254 aa  47  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2233  segregation and condensation protein A  33.82 
 
 		 254 aa  46.6  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.292577  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0602  chromosomal segregation and condensation protein A  27.59 
 
 		 278 aa  46.2  0.0005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0818988  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0391  segregation and condensation protein A  32.88 
 
 		 249 aa  45.8  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0325  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.69 
 
 		 202 aa  44.7  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1652  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.48 
 
 		 240 aa  44.7  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.681706 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3425  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.79 
 
 		 261 aa  43.9  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1747  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.29 
 
 		 267 aa  44.7  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.789122  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5641  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.67 
 
 		 285 aa  43.9  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.720807 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0687  condensin subunit ScpA  34.43 
 
 		 264 aa  43.9  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06800  hypothetical protein  36.51 
 
 		 313 aa  43.1  0.004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.147317  normal  0.465292 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1959  condensin subunit ScpA  33.33 
 
 		 266 aa  43.1  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000817707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2758  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32 
 
 		 248 aa  42.7  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0371635  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1327  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.77 
 
 		 263 aa  42.7  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.583538  normal  0.373498 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2832  chromosome segregation and condensation protein ScpA  25.4 
 
 		 312 aa  42.7  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0391082  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0132  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.25 
 
 		 242 aa  42.4  0.007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.787222  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1832  hypothetical protein  30.56 
 
 		 245 aa  42  0.009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.85577  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09620  hypothetical protein  32.88 
 
 		 259 aa  42  0.01  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0183259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0384  chromosome segregation and condensation protein ScpA  28.57 
 
 		 260 aa  42  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.268591 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>