32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_01681 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008816  A9601_01681  hypothetical protein  100 
 
 
273 aa  548  1e-155  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.450973  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01701  hypothetical protein  95.6 
 
 
273 aa  533  1e-150  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0153  hypothetical protein  88.64 
 
 
273 aa  470  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01791  hypothetical protein  82.42 
 
 
277 aa  463  1e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01671  hypothetical protein  51.42 
 
 
296 aa  297  2e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2403  putative segregation and condensation protein A  50.36 
 
 
300 aa  289  3e-77  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.389122  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02231  hypothetical protein  51.58 
 
 
297 aa  288  5.0000000000000004e-77  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1517  hypothetical protein  51.93 
 
 
297 aa  287  1e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0290  putative segregation and condensation protein A  51.81 
 
 
307 aa  280  3e-74  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26721  hypothetical protein  51.43 
 
 
300 aa  261  6e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1974  condensin subunit ScpA  36.82 
 
 
278 aa  154  1e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.776999 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3703  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.1 
 
 
248 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.971472  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1510  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.65 
 
 
256 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000966979 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1145  condensin subunit ScpA  34.46 
 
 
284 aa  109  4.0000000000000004e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0595963  hitchhiker  0.00600954 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3421  condensin subunit ScpA  31.56 
 
 
274 aa  109  6e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0951  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.06 
 
 
256 aa  95.9  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0924  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.65 
 
 
256 aa  95.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1848  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.45 
 
 
286 aa  88.2  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.448814  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0748  chromosome segregation and condensation protein ScpA  26.15 
 
 
238 aa  58.9  0.00000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0457996  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0593  condensin subunit ScpA  25.83 
 
 
339 aa  57.4  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1830  chromosome segregation and condensation protein ScpA  24.54 
 
 
250 aa  54.7  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1498  condensin subunit ScpA  27.62 
 
 
285 aa  48.5  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00138218  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0528  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.71 
 
 
322 aa  46.2  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.769453  normal  0.399884 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3001  chromosome segregation and condensation protein ScpA  38.1 
 
 
364 aa  46.2  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.428168  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2184  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.2 
 
 
255 aa  45.8  0.0007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0018  chromosome segregation and condensation protein ScpA  24.28 
 
 
202 aa  45.1  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1011  condensin subunit ScpA  27.94 
 
 
253 aa  45.1  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.685255 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2588  chromosome segregation and condensation protein ScpA  23.67 
 
 
405 aa  45.4  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.342818  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0026  chromosome segregation and condensation protein ScpA  23.41 
 
 
244 aa  45.4  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1340  chromosome segregation and condensation protein ScpA  37.14 
 
 
386 aa  44.3  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2737  chromosome segregation and condensation protein ScpA  40.68 
 
 
299 aa  43.9  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.577112  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1160  chromosome segregation and condensation protein ScpA  23.41 
 
 
221 aa  43.1  0.005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>