40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_2588 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_2588  chromosome segregation and condensation protein ScpA  100 
 
 
405 aa  795    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.342818  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1340  chromosome segregation and condensation protein ScpA  68.35 
 
 
386 aa  429  1e-119  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0528  chromosome segregation and condensation protein ScpA  57.62 
 
 
322 aa  315  9.999999999999999e-85  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.769453  normal  0.399884 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3001  chromosome segregation and condensation protein ScpA  51.72 
 
 
364 aa  305  7e-82  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.428168  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2737  chromosome segregation and condensation protein ScpA  59.77 
 
 
299 aa  285  8e-76  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.577112  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2184  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.57 
 
 
255 aa  132  1.0000000000000001e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1011  condensin subunit ScpA  38.11 
 
 
253 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.685255 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1498  condensin subunit ScpA  36.98 
 
 
285 aa  129  8.000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00138218  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1830  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.12 
 
 
250 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0748  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.71 
 
 
238 aa  124  4e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0457996  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0593  condensin subunit ScpA  31.94 
 
 
339 aa  113  5e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0026  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.07 
 
 
244 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1974  condensin subunit ScpA  25.86 
 
 
278 aa  81.6  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.776999 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1160  chromosome segregation and condensation protein ScpA  54.1 
 
 
221 aa  71.6  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3204  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.14 
 
 
204 aa  70.1  0.00000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3703  chromosome segregation and condensation protein ScpA  28.84 
 
 
248 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.971472  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1145  condensin subunit ScpA  23.02 
 
 
284 aa  62  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0595963  hitchhiker  0.00600954 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1510  chromosome segregation and condensation protein ScpA  24.38 
 
 
256 aa  60.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000966979 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0924  chromosome segregation and condensation protein ScpA  25.71 
 
 
256 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0951  chromosome segregation and condensation protein ScpA  25.71 
 
 
256 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01791  hypothetical protein  26.22 
 
 
277 aa  58.2  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1848  chromosome segregation and condensation protein ScpA  23.33 
 
 
286 aa  56.6  0.0000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.448814  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2403  putative segregation and condensation protein A  27.97 
 
 
300 aa  55.1  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.389122  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0018  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.71 
 
 
202 aa  54.3  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3421  condensin subunit ScpA  34.94 
 
 
274 aa  54.3  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01671  hypothetical protein  28.01 
 
 
296 aa  52.8  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1004  condensin subunit ScpA  37.14 
 
 
254 aa  50.4  0.00005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01701  hypothetical protein  24.73 
 
 
273 aa  49.7  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1832  hypothetical protein  24.91 
 
 
245 aa  47  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.85577  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02231  hypothetical protein  24.56 
 
 
297 aa  46.6  0.0007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0886  hypothetical protein  35.71 
 
 
247 aa  45.8  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.855762  hitchhiker  0.000000000000790722 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1517  hypothetical protein  23.93 
 
 
297 aa  46.2  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0290  putative segregation and condensation protein A  26.71 
 
 
307 aa  45.4  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0325  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.87 
 
 
202 aa  44.7  0.003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3847  chromosome segregation and condensation protein ScpA  25.9 
 
 
287 aa  44.3  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1154  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.15 
 
 
222 aa  43.9  0.005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.339133  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2233  segregation and condensation protein A  24.44 
 
 
254 aa  43.1  0.008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.292577  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1299  hypothetical protein  37.5 
 
 
254 aa  43.1  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0764  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.15 
 
 
222 aa  43.1  0.009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.705704  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01681  hypothetical protein  23.94 
 
 
273 aa  43.1  0.009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.450973  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>