55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0764 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_0764  chromosome segregation and condensation protein ScpA  100 
 
 
222 aa  437  9.999999999999999e-123  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.705704  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1154  chromosome segregation and condensation protein ScpA  96.85 
 
 
222 aa  388  1e-107  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.339133  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0059  condensin subunit ScpA  93.24 
 
 
222 aa  372  1e-102  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0829  chromosome segregation and condensation protein ScpA  78.48 
 
 
222 aa  342  4e-93  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1022  chromosome segregation and condensation protein ScpA  50.22 
 
 
251 aa  180  2e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0593  condensin subunit ScpA  31.4 
 
 
339 aa  84.3  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1830  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.17 
 
 
250 aa  66.2  0.0000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0026  chromosome segregation and condensation protein ScpA  24.89 
 
 
244 aa  60.5  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0886  hypothetical protein  27.05 
 
 
247 aa  57.8  0.0000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.855762  hitchhiker  0.000000000000790722 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1498  condensin subunit ScpA  29.86 
 
 
285 aa  54.7  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00138218  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1011  condensin subunit ScpA  21.83 
 
 
253 aa  54.3  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.685255 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2184  chromosome segregation and condensation protein ScpA  24.02 
 
 
255 aa  53.5  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3814  segregation and condensation protein A  22.69 
 
 
247 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3799  segregation and condensation protein A  22.69 
 
 
247 aa  53.1  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4078  segregation and condensation protein A  22.69 
 
 
247 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000932909 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2757  segregation and condensation protein A  23.5 
 
 
248 aa  52.8  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3968  segregation and condensation protein A  22.69 
 
 
247 aa  52.8  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4278  segregation and condensation protein A  22.69 
 
 
247 aa  52.8  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4189  segregation and condensation protein A  21.94 
 
 
247 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0914605  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1652  chromosome segregation and condensation protein ScpA  25.41 
 
 
240 aa  52.4  0.000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.681706 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4125  segregation and condensation protein A  21.94 
 
 
247 aa  52  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1071  segregation and condensation protein A  24.79 
 
 
247 aa  52  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4167  segregation and condensation protein A  24.79 
 
 
247 aa  52  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0529217  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0755  condensin subunit ScpA  24.9 
 
 
263 aa  51.2  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000908175  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0748  chromosome segregation and condensation protein ScpA  25.69 
 
 
238 aa  50.1  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0457996  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1747  chromosome segregation and condensation protein ScpA  25.31 
 
 
267 aa  48.5  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.789122  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1382  chromosome segregation and condensation protein ScpA  24.22 
 
 
285 aa  48.5  0.00008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0547025  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1327  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.4 
 
 
263 aa  47  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.583538  normal  0.373498 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1160  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.48 
 
 
221 aa  47  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3887  segregation and condensation protein A  21.59 
 
 
247 aa  46.6  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0018  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.33 
 
 
202 aa  45.4  0.0007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09620  hypothetical protein  34.38 
 
 
259 aa  45.1  0.0008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0183259  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1566  chromosome segregation and condensation protein ScpA  26.91 
 
 
243 aa  44.3  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0721026  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf010  segregation and condensation protein A  32.81 
 
 
273 aa  44.3  0.001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02231  hypothetical protein  23.26 
 
 
297 aa  44.3  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3703  chromosome segregation and condensation protein ScpA  22.22 
 
 
248 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.971472  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2588  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.15 
 
 
405 aa  43.9  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.342818  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1303  chromosome segregation and condensation protein ScpA  27.49 
 
 
219 aa  44.3  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01701  hypothetical protein  22.45 
 
 
273 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1517  hypothetical protein  22.48 
 
 
297 aa  43.1  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0721  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.81 
 
 
304 aa  43.1  0.003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00886352  normal  0.0253766 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2737  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35 
 
 
299 aa  42.7  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.577112  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl550  chromosomal segregation/condensation protein  32.39 
 
 
277 aa  42.7  0.004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000452065  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0391  segregation and condensation protein A  23.21 
 
 
249 aa  43.1  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0687  condensin subunit ScpA  31.25 
 
 
264 aa  42.7  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3861  condensin subunit ScpA  28.79 
 
 
282 aa  42.4  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.684068  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06800  hypothetical protein  31.25 
 
 
313 aa  42.7  0.005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.147317  normal  0.465292 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2196  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.08 
 
 
290 aa  42.7  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0444422  normal  0.714691 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1340  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36 
 
 
386 aa  42.4  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0953  chromosome segregation and condensation protein ScpA  23.83 
 
 
264 aa  42.4  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3644  condensin subunit ScpA  33.96 
 
 
262 aa  42.4  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2233  segregation and condensation protein A  23.42 
 
 
254 aa  42.4  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.292577  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0384  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.96 
 
 
260 aa  42.4  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.268591 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1489  condensin subunit ScpA  21.15 
 
 
272 aa  41.6  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.310818  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1736  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.82 
 
 
238 aa  41.6  0.01  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>