64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1154 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1154  chromosome segregation and condensation protein ScpA  100 
 
 		 222 aa  437  9.999999999999999e-123  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.339133  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0059  condensin subunit ScpA  94.14 
 
 		 222 aa  378  1e-104  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0764  chromosome segregation and condensation protein ScpA  96.85 
 
 		 222 aa  373  1e-102  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.705704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0829  chromosome segregation and condensation protein ScpA  77.13 
 
 		 222 aa  338  2.9999999999999998e-92  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1022  chromosome segregation and condensation protein ScpA  48.91 
 
 		 251 aa  178  7e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0593  condensin subunit ScpA  31.88 
 
 		 339 aa  84  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1830  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.17 
 
 		 250 aa  65.5  0.0000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0026  chromosome segregation and condensation protein ScpA  25.33 
 
 		 244 aa  59.3  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0886  hypothetical protein  25.75 
 
 		 247 aa  54.7  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.855762  hitchhiker  0.000000000000790722 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1011  condensin subunit ScpA  22.22 
 
 		 253 aa  54.7  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.685255 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1498  condensin subunit ScpA  29.38 
 
 		 285 aa  53.9  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00138218  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2184  chromosome segregation and condensation protein ScpA  24.02 
 
 		 255 aa  53.5  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2757  segregation and condensation protein A  24.23 
 
 		 248 aa  51.2  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1652  chromosome segregation and condensation protein ScpA  25.21 
 
 		 240 aa  51.2  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.681706 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4189  segregation and condensation protein A  22.03 
 
 		 247 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0914605  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4167  segregation and condensation protein A  22.47 
 
 		 247 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0529217  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1071  segregation and condensation protein A  22.47 
 
 		 247 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4125  segregation and condensation protein A  22.03 
 
 		 247 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4078  segregation and condensation protein A  23.11 
 
 		 247 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000932909 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3968  segregation and condensation protein A  23.11 
 
 		 247 aa  49.3  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3799  segregation and condensation protein A  23.11 
 
 		 247 aa  49.7  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3814  segregation and condensation protein A  23.11 
 
 		 247 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0755  condensin subunit ScpA  24.9 
 
 		 263 aa  49.3  0.00004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000908175  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4278  segregation and condensation protein A  23.11 
 
 		 247 aa  49.3  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1160  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.48 
 
 		 221 aa  47.8  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1327  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.4 
 
 		 263 aa  47.8  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.583538  normal  0.373498 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0748  chromosome segregation and condensation protein ScpA  24.31 
 
 		 238 aa  47.8  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0457996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3887  segregation and condensation protein A  21.59 
 
 		 247 aa  48.1  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1382  chromosome segregation and condensation protein ScpA  24.34 
 
 		 285 aa  45.8  0.0005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0547025  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1747  chromosome segregation and condensation protein ScpA  24.48 
 
 		 267 aa  45.4  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.789122  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2233  segregation and condensation protein A  23.87 
 
 		 254 aa  45.4  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.292577  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2588  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.15 
 
 		 405 aa  44.3  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.342818  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2737  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35 
 
 		 299 aa  43.5  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.577112  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0522  chromosome segregation and condensation protein ScpA  20.9 
 
 		 225 aa  43.9  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1566  chromosome segregation and condensation protein ScpA  26.98 
 
 		 243 aa  44.3  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0721026  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0391  segregation and condensation protein A  24.24 
 
 		 249 aa  43.5  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3703  chromosome segregation and condensation protein ScpA  22.22 
 
 		 248 aa  43.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.971472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf010  segregation and condensation protein A  31.25 
 
 		 273 aa  43.1  0.003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1340  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36 
 
 		 386 aa  43.1  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09620  hypothetical protein  31.25 
 
 		 259 aa  43.1  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0183259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0645  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.33 
 
 		 287 aa  42.7  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0669  condensin subunit ScpA  33.96 
 
 		 296 aa  42.4  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0384  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.96 
 
 		 260 aa  42.7  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.268591 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0953  chromosome segregation and condensation protein ScpA  24.15 
 
 		 264 aa  42.4  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2196  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.85 
 
 		 290 aa  42.4  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0444422  normal  0.714691 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0290  putative segregation and condensation protein A  23.24 
 
 		 307 aa  42.4  0.006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3861  condensin subunit ScpA  28.79 
 
 		 282 aa  42.4  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.684068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2773  condensin subunit ScpA  32.84 
 
 		 301 aa  42  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.601165 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2488  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.85 
 
 		 290 aa  42  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.963803  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2441  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.85 
 
 		 290 aa  42  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3644  condensin subunit ScpA  32.08 
 
 		 262 aa  42  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1830  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.85 
 
 		 290 aa  42  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.592453  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2356  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.85 
 
 		 290 aa  42  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.489348  normal  0.226731 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2446  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.85 
 
 		 290 aa  42  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0805764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0853  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.85 
 
 		 290 aa  42  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2386  hypothetical protein  29.85 
 
 		 293 aa  42  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000700551 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5772  condensin subunit ScpA  29.85 
 
 		 290 aa  42  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.160847  normal  0.239961 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0687  condensin subunit ScpA  29.69 
 
 		 264 aa  41.6  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01701  hypothetical protein  21.31 
 
 		 273 aa  41.6  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0528  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.67 
 
 		 322 aa  41.6  0.01  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.769453  normal  0.399884 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1687  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.3 
 
 		 276 aa  41.6  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.331985  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3001  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.42 
 
 		 364 aa  41.6  0.01  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.428168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1211  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.33 
 
 		 291 aa  41.6  0.01  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000668122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1303  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.58 
 
 		 219 aa  41.6  0.01  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>