72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1011 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_1011  condensin subunit ScpA  100 
 
 
253 aa  501  1e-141  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.685255 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2184  chromosome segregation and condensation protein ScpA  51.81 
 
 
255 aa  187  2e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0748  chromosome segregation and condensation protein ScpA  50.43 
 
 
238 aa  183  3e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0457996  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1830  chromosome segregation and condensation protein ScpA  51.24 
 
 
250 aa  172  6.999999999999999e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0026  chromosome segregation and condensation protein ScpA  44.4 
 
 
244 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2737  chromosome segregation and condensation protein ScpA  41.18 
 
 
299 aa  148  9e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.577112  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1340  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.86 
 
 
386 aa  134  9e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2588  chromosome segregation and condensation protein ScpA  37.13 
 
 
405 aa  133  1.9999999999999998e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.342818  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0528  chromosome segregation and condensation protein ScpA  38.37 
 
 
322 aa  125  5e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.769453  normal  0.399884 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3204  chromosome segregation and condensation protein ScpA  41.29 
 
 
204 aa  113  3e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1498  condensin subunit ScpA  38.37 
 
 
285 aa  112  6e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00138218  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3001  chromosome segregation and condensation protein ScpA  39.02 
 
 
364 aa  103  2e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.428168  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0593  condensin subunit ScpA  33.33 
 
 
339 aa  100  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1160  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.16 
 
 
221 aa  89.4  5e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1510  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.31 
 
 
256 aa  88.6  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000966979 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3703  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.24 
 
 
248 aa  79.3  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.971472  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2403  putative segregation and condensation protein A  28.95 
 
 
300 aa  68.6  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.389122  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1974  condensin subunit ScpA  27.04 
 
 
278 aa  67.4  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.776999 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0924  chromosome segregation and condensation protein ScpA  28.02 
 
 
256 aa  66.2  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0951  chromosome segregation and condensation protein ScpA  28.02 
 
 
256 aa  66.2  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0829  chromosome segregation and condensation protein ScpA  25.32 
 
 
222 aa  65.5  0.0000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0018  chromosome segregation and condensation protein ScpA  23.5 
 
 
202 aa  63.9  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3421  condensin subunit ScpA  27.73 
 
 
274 aa  62  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1517  hypothetical protein  26.8 
 
 
297 aa  61.6  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02231  hypothetical protein  28.97 
 
 
297 aa  60.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1145  condensin subunit ScpA  27.98 
 
 
284 aa  59.7  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0595963  hitchhiker  0.00600954 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1382  chromosome segregation and condensation protein ScpA  24.62 
 
 
285 aa  58.5  0.00000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0547025  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1848  chromosome segregation and condensation protein ScpA  26.12 
 
 
286 aa  58.5  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.448814  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0290  putative segregation and condensation protein A  27.13 
 
 
307 aa  57  0.0000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01671  hypothetical protein  25.38 
 
 
296 aa  55.5  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0059  condensin subunit ScpA  24.58 
 
 
222 aa  53.5  0.000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2297  chromosome segregation and condensation protein ScpA  38.46 
 
 
285 aa  52.8  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1926  chromosome segregation and condensation protein ScpA  38.46 
 
 
285 aa  52.4  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1022  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.33 
 
 
251 aa  50.8  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26721  hypothetical protein  27.44 
 
 
300 aa  50.4  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1299  hypothetical protein  27.4 
 
 
254 aa  50.4  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2249  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.94 
 
 
273 aa  50.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0193462  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0764  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.87 
 
 
222 aa  49.7  0.00004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.705704  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1154  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.87 
 
 
222 aa  50.1  0.00004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.339133  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0886  hypothetical protein  36.9 
 
 
247 aa  48.5  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.855762  hitchhiker  0.000000000000790722 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3887  segregation and condensation protein A  34.38 
 
 
247 aa  47.4  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2757  segregation and condensation protein A  34.38 
 
 
248 aa  47.4  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3814  segregation and condensation protein A  34.38 
 
 
247 aa  47  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3799  segregation and condensation protein A  34.38 
 
 
247 aa  47  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3968  segregation and condensation protein A  34.38 
 
 
247 aa  47  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4078  segregation and condensation protein A  34.38 
 
 
247 aa  47  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000932909 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4125  segregation and condensation protein A  34.38 
 
 
247 aa  47  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4189  segregation and condensation protein A  34.38 
 
 
247 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0914605  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01701  hypothetical protein  26.06 
 
 
273 aa  46.6  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4278  segregation and condensation protein A  34.38 
 
 
247 aa  47  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0391  segregation and condensation protein A  31.17 
 
 
249 aa  46.6  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4167  segregation and condensation protein A  34.38 
 
 
247 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0529217  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1071  segregation and condensation protein A  34.38 
 
 
247 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1832  hypothetical protein  32.18 
 
 
245 aa  46.2  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.85577  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01791  hypothetical protein  26.46 
 
 
277 aa  46.2  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1996  putative segregation and condensation protein A  33.85 
 
 
248 aa  46.2  0.0005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0093  putative segregation and condensation protein A  33.85 
 
 
255 aa  46.2  0.0005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1883  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.38 
 
 
273 aa  45.8  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0105417  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06800  hypothetical protein  32.63 
 
 
313 aa  45.4  0.0008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.147317  normal  0.465292 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0132  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.47 
 
 
242 aa  44.7  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.787222  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1327  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.19 
 
 
263 aa  45.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.583538  normal  0.373498 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0111  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.33 
 
 
245 aa  45.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.376959 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2233  segregation and condensation protein A  29.76 
 
 
254 aa  43.9  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.292577  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1736  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.88 
 
 
238 aa  43.9  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1959  condensin subunit ScpA  31.25 
 
 
266 aa  43.9  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000817707  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01681  hypothetical protein  28.12 
 
 
273 aa  43.9  0.003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.450973  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1652  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30 
 
 
240 aa  43.5  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.681706 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3847  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.76 
 
 
287 aa  43.9  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0325  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.33 
 
 
202 aa  43.5  0.004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0522  chromosome segregation and condensation protein ScpA  23.01 
 
 
225 aa  42.7  0.005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07170  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.82 
 
 
243 aa  42.7  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000172776  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2120  chromosome segregation and condensation protein ScpA  37.36 
 
 
300 aa  42  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.781552  normal  0.053022 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>