75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0748 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0748  chromosome segregation and condensation protein ScpA  100 
 
 		 238 aa  473  1e-133  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0457996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2184  chromosome segregation and condensation protein ScpA  52.61 
 
 		 255 aa  202  6e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1830  chromosome segregation and condensation protein ScpA  52.74 
 
 		 250 aa  195  7e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0026  chromosome segregation and condensation protein ScpA  45.92 
 
 		 244 aa  182  3e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1011  condensin subunit ScpA  50.43 
 
 		 253 aa  169  4e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.685255 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2737  chromosome segregation and condensation protein ScpA  39.13 
 
 		 299 aa  128  1.0000000000000001e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.577112  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3204  chromosome segregation and condensation protein ScpA  40.62 
 
 		 204 aa  119  3e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2588  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.98 
 
 		 405 aa  118  7e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.342818  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0593  condensin subunit ScpA  35 
 
 		 339 aa  112  5e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1340  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.05 
 
 		 386 aa  108  8.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1498  condensin subunit ScpA  35.71 
 
 		 285 aa  104  1e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00138218  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0528  chromosome segregation and condensation protein ScpA  37.2 
 
 		 322 aa  103  3e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.769453  normal  0.399884 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3703  chromosome segregation and condensation protein ScpA  28.57 
 
 		 248 aa  80.5  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.971472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3001  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.87 
 
 		 364 aa  78.6  0.00000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.428168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1974  condensin subunit ScpA  27.37 
 
 		 278 aa  75.9  0.0000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.776999 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1160  chromosome segregation and condensation protein ScpA  51.61 
 
 		 221 aa  72  0.000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0951  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.23 
 
 		 256 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0924  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.23 
 
 		 256 aa  67  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1510  chromosome segregation and condensation protein ScpA  27.27 
 
 		 256 aa  65.5  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000966979 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1848  chromosome segregation and condensation protein ScpA  27.52 
 
 		 286 aa  64.3  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.448814  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1145  condensin subunit ScpA  26.92 
 
 		 284 aa  62.8  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0595963  hitchhiker  0.00600954 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2403  putative segregation and condensation protein A  30.35 
 
 		 300 aa  62.4  0.000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.389122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0018  chromosome segregation and condensation protein ScpA  24.24 
 
 		 202 aa  62.4  0.000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02231  hypothetical protein  27.65 
 
 		 297 aa  58.5  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01701  hypothetical protein  26.82 
 
 		 273 aa  57.4  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01671  hypothetical protein  30.31 
 
 		 296 aa  56.2  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1517  hypothetical protein  27.59 
 
 		 297 aa  55.8  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0290  putative segregation and condensation protein A  32.17 
 
 		 307 aa  55.1  0.0000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3421  condensin subunit ScpA  25.95 
 
 		 274 aa  55.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0829  chromosome segregation and condensation protein ScpA  23.5 
 
 		 222 aa  53.5  0.000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01681  hypothetical protein  24.71 
 
 		 273 aa  52.4  0.000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.450973  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1382  chromosome segregation and condensation protein ScpA  26.43 
 
 		 285 aa  52.4  0.000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0547025  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01791  hypothetical protein  25.39 
 
 		 277 aa  50.8  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2757  segregation and condensation protein A  35.37 
 
 		 248 aa  50.1  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2297  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.18 
 
 		 285 aa  49.7  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0886  hypothetical protein  35.21 
 
 		 247 aa  49.3  0.00005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.855762  hitchhiker  0.000000000000790722 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1926  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.18 
 
 		 285 aa  49.3  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3887  segregation and condensation protein A  33.73 
 
 		 247 aa  48.9  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4189  segregation and condensation protein A  34.15 
 
 		 247 aa  48.5  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0914605  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4125  segregation and condensation protein A  34.15 
 
 		 247 aa  48.5  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4078  segregation and condensation protein A  34.15 
 
 		 247 aa  48.5  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000932909 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4278  segregation and condensation protein A  34.15 
 
 		 247 aa  48.5  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3968  segregation and condensation protein A  34.15 
 
 		 247 aa  48.5  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3799  segregation and condensation protein A  34.15 
 
 		 247 aa  48.5  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3814  segregation and condensation protein A  34.15 
 
 		 247 aa  48.5  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0764  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.67 
 
 		 222 aa  48.1  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.705704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0153  hypothetical protein  24.9 
 
 		 273 aa  48.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26721  hypothetical protein  32.27 
 
 		 300 aa  48.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06800  hypothetical protein  34.21 
 
 		 313 aa  47  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.147317  normal  0.465292 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1071  segregation and condensation protein A  32.93 
 
 		 247 aa  47  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4167  segregation and condensation protein A  32.93 
 
 		 247 aa  47  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0529217  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1154  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30 
 
 		 222 aa  46.6  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.339133  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0325  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.79 
 
 		 202 aa  46.6  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1327  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.93 
 
 		 263 aa  47  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.583538  normal  0.373498 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0059  condensin subunit ScpA  30 
 
 		 222 aa  46.2  0.0005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2758  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.25 
 
 		 248 aa  45.8  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0371635  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1022  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.05 
 
 		 251 aa  45.8  0.0006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3847  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.22 
 
 		 287 aa  45.8  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0132  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.87 
 
 		 242 aa  45.4  0.0008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.787222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1004  condensin subunit ScpA  30.65 
 
 		 254 aa  45.1  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1299  hypothetical protein  26.42 
 
 		 254 aa  45.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0391  segregation and condensation protein A  28.99 
 
 		 249 aa  44.3  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1832  hypothetical protein  31.51 
 
 		 245 aa  43.9  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.85577  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1959  condensin subunit ScpA  30.16 
 
 		 266 aa  43.9  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000817707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0307  segregation and condensation protein A  35 
 
 		 237 aa  43.9  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0687  condensin subunit ScpA  36.07 
 
 		 264 aa  43.9  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2249  chromosome segregation and condensation protein ScpA  28.79 
 
 		 273 aa  43.9  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0193462  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0111  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.94 
 
 		 245 aa  44.3  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.376959 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1883  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.67 
 
 		 273 aa  43.9  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0105417  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1996  putative segregation and condensation protein A  31.08 
 
 		 248 aa  43.5  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0522  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.77 
 
 		 225 aa  43.1  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09620  hypothetical protein  33.33 
 
 		 259 aa  42.7  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0183259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1652  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.33 
 
 		 240 aa  42.7  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.681706 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2233  segregation and condensation protein A  30.34 
 
 		 254 aa  42.4  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.292577  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1595  segregation and condensation protein A  33.33 
 
 		 235 aa  41.6  0.01  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>