89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_1169 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009635  Maeo_1169  L-seryl-tRNA selenium transferase  100 
 
 		 354 aa  717    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.497392  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0999  L-seryl-tRNA selenium transferase  63.61 
 
 		 354 aa  463  1e-129  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0947  L-seryl-tRNA selenium transferase  64.27 
 
 		 354 aa  463  1e-129  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1682  L-seryl-tRNA selenium transferase  63.69 
 
 		 354 aa  460  9.999999999999999e-129  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1219  L-seryl-tRNA selenium transferase  62.82 
 
 		 357 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.587199  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1320  Selenocysteine synthase (seryl-tRNASer selenium transferase)-like protein  24.02 
 
 		 412 aa  124  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.603065  normal  0.110167 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5759  pyridoxal phosphate-dependent enzyme  28.44 
 
 		 398 aa  52  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.646746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1814  selenocysteine synthase  25.85 
 
 		 465 aa  51.6  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.071718 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6666  L-seryl-tRNA selenium transferase  29.36 
 
 		 398 aa  51.6  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.184749  normal  0.0169225 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2373  selenocysteine synthase  30.51 
 
 		 462 aa  50.8  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25310  seryl-tRNA(Sec) selenium transferase  31.9 
 
 		 477 aa  50.8  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.362155 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0105  selenocysteine synthase  35.42 
 
 		 473 aa  50.1  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0575  selenocysteine synthase  33.33 
 
 		 480 aa  50.1  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.81182  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0726  selenocysteine synthase  33.33 
 
 		 480 aa  50.1  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2255  selenocysteine synthase  33.33 
 
 		 480 aa  50.1  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0106  selenocysteine synthase  28.39 
 
 		 476 aa  50.4  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5094  L-seryl-tRNA(ser) selenium transferase  32.26 
 
 		 398 aa  50.4  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1903  selenocysteine synthase  33.33 
 
 		 480 aa  50.1  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1696  selenocysteine synthase  33.33 
 
 		 480 aa  50.1  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1678.1  selenocysteine synthase  33.33 
 
 		 480 aa  50.1  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3738  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase  39.29 
 
 		 429 aa  50.1  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.241783  normal  0.0172698 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0101  selenocysteine synthase  28.39 
 
 		 473 aa  50.1  0.00006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0357  hypothetical protein  26.43 
 
 		 364 aa  49.7  0.00008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0106  selenocysteine synthase  35.42 
 
 		 476 aa  49.7  0.00008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0442  selenocysteine synthase  27.7 
 
 		 496 aa  48.9  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2392  selenocysteine synthase  32.35 
 
 		 480 aa  49.3  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.36039  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4267  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase  30.95 
 
 		 476 aa  48.9  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000207221  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2085  selenocysteine synthase  29.94 
 
 		 462 aa  48.9  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2990  pyridoxal phosphate-dependent enzyme, putative  25 
 
 		 398 aa  48.5  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.625674  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2549  selenocysteine synthase  35.29 
 
 		 476 aa  48.5  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.645361 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1608  selenocysteine synthase  33.33 
 
 		 435 aa  48.1  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0237465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0940  pyridoxal phosphate-dependent enzyme, putative  25.48 
 
 		 400 aa  48.5  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0711  selenocysteine synthase  33.33 
 
 		 495 aa  48.5  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1006  Arginine decarboxylase  27.43 
 
 		 445 aa  48.5  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3477  L-seryl-tRNA selenium transferase  23.62 
 
 		 473 aa  47.8  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.213454  normal  0.293917 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2965  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase  27.32 
 
 		 446 aa  47.8  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0158372  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4521  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase  32.67 
 
 		 472 aa  47.8  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2171  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  21.83 
 
 		 379 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.881952  normal  0.0135925 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0109  selenocysteine synthase  34.38 
 
 		 476 aa  47.4  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0104  selenocysteine synthase  34.38 
 
 		 476 aa  47.4  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0140  selenocysteine synthase  33.33 
 
 		 463 aa  47.4  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1311  selenocysteine synthase  25.93 
 
 		 506 aa  47  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000207864 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0301  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase  32.56 
 
 		 466 aa  46.6  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0117  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase  33.33 
 
 		 463 aa  46.6  0.0007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03397  hypothetical protein  33.33 
 
 		 463 aa  46.6  0.0007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0122  selenocysteine synthase  33.33 
 
 		 463 aa  46.6  0.0007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4962  selenocysteine synthase  33.33 
 
 		 463 aa  46.6  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.922888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4089  selenocysteine synthase  33.33 
 
 		 463 aa  46.6  0.0007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03446  selenocysteine synthase  33.33 
 
 		 463 aa  46.6  0.0007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3796  selenocysteine synthase  33.33 
 
 		 463 aa  46.6  0.0007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.915143  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3320  succinyldiaminopimelate transaminase  25 
 
 		 376 aa  46.2  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.399623  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3919  selenocysteine synthase  33.33 
 
 		 463 aa  46.2  0.0008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.419812 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4006  selenocysteine synthase  33.33 
 
 		 463 aa  46.2  0.0008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0090  selenocysteine synthase  25.66 
 
 		 463 aa  46.2  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0506  selenocysteine synthase  25.9 
 
 		 468 aa  45.8  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.487693  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4541  methionine gamma-lyase  35.37 
 
 		 398 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6556  selenocysteine synthase  33.33 
 
 		 476 aa  45.8  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0759041  decreased coverage  0.00101657 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4522  selenocysteine synthase  43.1 
 
 		 478 aa  45.8  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.843638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0482  selenocysteine synthase  24.44 
 
 		 489 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.112411  hitchhiker  0.001297 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2477  selenocysteine synthase  28.21 
 
 		 448 aa  44.7  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11390  seryl-tRNA(Sec) selenium transferase  32.11 
 
 		 508 aa  44.7  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.308467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2561  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase  27.01 
 
 		 470 aa  45.4  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4140  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  21.26 
 
 		 368 aa  45.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.867426  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0873  selenocysteine synthase  34.43 
 
 		 468 aa  44.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1162  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase  22.9 
 
 		 476 aa  45.1  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00103584 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4115  selenocysteine synthase  37.93 
 
 		 462 aa  44.3  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0492  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  22.56 
 
 		 370 aa  44.3  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.711349  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3766  selenocysteine synthase  37.93 
 
 		 462 aa  44.3  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3579  L-seryl-tRNA selenium transferase  40.62 
 
 		 439 aa  44.7  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.963562  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1093  selenocysteine synthase  23.87 
 
 		 473 aa  44.3  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0042  selenocysteine synthase  37.93 
 
 		 462 aa  44.3  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0915  methionine gamma-lyase  35.37 
 
 		 397 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.230127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5303  selenocysteine synthase  34.57 
 
 		 425 aa  43.9  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0108  selenocysteine synthase  34.38 
 
 		 476 aa  43.9  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4157  selenocysteine synthase  26.89 
 
 		 478 aa  43.9  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.109282 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5215  selenocysteine synthase  34.57 
 
 		 425 aa  43.9  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5595  selenocysteine synthase  34.57 
 
 		 425 aa  43.9  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.116536 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4593  selenocysteine synthase  41.38 
 
 		 500 aa  43.9  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.263518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3486  selenocysteine synthase  40.35 
 
 		 484 aa  43.9  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0801308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0061  selenocysteine synthase  28.85 
 
 		 462 aa  43.1  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09650  selenocysteine synthase  37.5 
 
 		 440 aa  43.1  0.007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.789382  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1569  selenocysteine synthase  29.71 
 
 		 440 aa  42.7  0.008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.339371  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2704  pyridoxal phosphate-dependent enzyme  26.56 
 
 		 402 aa  43.1  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.249088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0672  selenocysteine synthase  29 
 
 		 462 aa  43.1  0.008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63540  selenocysteine synthase  40.32 
 
 		 468 aa  42.7  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.219869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1692  L-seryl-tRNA selenium transferase  40.32 
 
 		 492 aa  42.7  0.01  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.624404  normal  0.735525 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2706  selenocysteine synthase  28.1 
 
 		 468 aa  42.7  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277049 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3381  selenocysteine synthase  32.35 
 
 		 478 aa  42.7  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3883  selenocysteine synthase  32.35 
 
 		 479 aa  42.7  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>