209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6666 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011366  Rleg2_5759  pyridoxal phosphate-dependent enzyme  92.96 
 
 		 398 aa  759    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.646746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5094  L-seryl-tRNA(ser) selenium transferase  81.41 
 
 		 398 aa  649    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2990  pyridoxal phosphate-dependent enzyme, putative  85.93 
 
 		 398 aa  714    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.625674  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6666  L-seryl-tRNA selenium transferase  100 
 
 		 398 aa  809    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.184749  normal  0.0169225 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2704  pyridoxal phosphate-dependent enzyme  61.1 
 
 		 402 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.249088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0940  pyridoxal phosphate-dependent enzyme, putative  56.71 
 
 		 400 aa  433  1e-120  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3975  putative pyridoxal phosphate-dependent enzyme  39.84 
 
 		 369 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.133901  normal  0.976007 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4098  putative pyridoxal phosphate-dependent enzyme  39.56 
 
 		 369 aa  234  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3993  putative pyridoxal phosphate-dependent enzyme  39.29 
 
 		 369 aa  232  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4161  putative pyridoxal phosphate-dependent enzyme  39.29 
 
 		 369 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.60373  normal  0.579159 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4047  putative pyridoxal phosphate-dependent enzyme  39.01 
 
 		 369 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0548491 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4974  putative pyridoxal phosphate-dependent enzyme  37.7 
 
 		 367 aa  224  1e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4959  putative pyridoxal phosphate-dependent enzyme  37.7 
 
 		 367 aa  224  2e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3272  putative pyridoxal phosphate-dependent enzyme  38.98 
 
 		 369 aa  224  2e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4739  pyridoxal phosphate-dependent enzyme  37.7 
 
 		 367 aa  223  4e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5099  pyridoxal phosphate-dependent enzyme  37.7 
 
 		 367 aa  223  4e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4688  pyridoxal phosphate-dependent enzyme, putative  37.16 
 
 		 367 aa  223  4e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5002  pyridoxal phosphate-dependent enzyme, putative  37.7 
 
 		 367 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4579  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase; selenocysteine synthase  37.43 
 
 		 367 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4987  putative pyridoxal phosphate-dependent enzyme  37.43 
 
 		 367 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0261  putative pyridoxal phosphate-dependent enzyme  37.43 
 
 		 367 aa  223  6e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.262008  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4598  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase; selenocysteine synthase  37.7 
 
 		 367 aa  222  9e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0918  pyridoxal phosphate-dependent enzyme  35.07 
 
 		 372 aa  205  1e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0676  pyridoxal phosphate-dependent enzyme  36.9 
 
 		 365 aa  204  2e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3866  pyridoxal phosphate-dependent enzyme  36.9 
 
 		 365 aa  204  2e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.559786  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4375  pyridoxal phosphate-dependent enzyme, putative  36.44 
 
 		 372 aa  197  3e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.417275 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4826  hypothetical protein  33.42 
 
 		 372 aa  196  5.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4847  hypothetical protein  33.15 
 
 		 372 aa  195  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.601246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4697  hypothetical protein  33.15 
 
 		 372 aa  195  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.547246 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4728  hypothetical protein  33.15 
 
 		 372 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4792  hypothetical protein  33.15 
 
 		 372 aa  194  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0430  pyridoxal phosphate-dependent enzyme, putative  33.07 
 
 		 372 aa  190  4e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3153  pyridoxal phosphate-dependent enzyme  34.07 
 
 		 373 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0099  L-seryl-tRNA selenium transferase  33.99 
 
 		 406 aa  163  4.0000000000000004e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.789274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0105  hypothetical protein  31.55 
 
 		 348 aa  162  9e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0175  Pyridoxal phosphate-dependent transferase  33.86 
 
 		 411 aa  162  9e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3968  L-seryl-tRNA(ser) selenium transferase protein  31.36 
 
 		 406 aa  154  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.456181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1021  Pyridoxal phosphate-dependent transferase  31.68 
 
 		 407 aa  152  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.562756 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2440  selenocysteine synthase (seryl-tRNASer selenium transferase)-like protein  29.82 
 
 		 406 aa  152  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0244624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0481  selenocysteine synthase (seryl-tRNASer selenium transferase)-like protein  30.61 
 
 		 511 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.11487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3964  pyridoxal phosphate-dependent enzyme, putative  28.87 
 
 		 407 aa  139  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.741974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6463  selenocysteine synthase (seryl-tRNASer selenium transferase)-like protein  29.37 
 
 		 414 aa  133  3.9999999999999996e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1144  pyridoxal phosphate-dependent enzyme, putative  33.94 
 
 		 388 aa  122  9.999999999999999e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.46182  normal  0.521262 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1814  selenocysteine synthase  30.25 
 
 		 465 aa  91.7  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.071718 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3477  L-seryl-tRNA selenium transferase  25.6 
 
 		 473 aa  88.2  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.213454  normal  0.293917 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0101  selenocysteine synthase  30.11 
 
 		 473 aa  87.8  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0106  selenocysteine synthase  30.11 
 
 		 476 aa  87.4  4e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0873  selenocysteine synthase  29.02 
 
 		 468 aa  87  6e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0106  selenocysteine synthase  30.11 
 
 		 476 aa  86.3  8e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0105  selenocysteine synthase  30.5 
 
 		 473 aa  86.3  9e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6556  selenocysteine synthase  28.27 
 
 		 476 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0759041  decreased coverage  0.00101657 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2373  selenocysteine synthase  26.83 
 
 		 462 aa  84.7  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2085  selenocysteine synthase  26.83 
 
 		 462 aa  84.7  0.000000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0104  selenocysteine synthase  30.5 
 
 		 476 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0109  selenocysteine synthase  30.5 
 
 		 476 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2504  selenocysteine synthase  26.64 
 
 		 470 aa  83.6  0.000000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0196405  normal  0.0690834 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0301  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase  27.12 
 
 		 466 aa  82.8  0.000000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0108  selenocysteine synthase  30.5 
 
 		 476 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1162  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase  24.65 
 
 		 476 aa  82.4  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00103584 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3486  selenocysteine synthase  28.72 
 
 		 484 aa  82  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0801308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0672  selenocysteine synthase  26.09 
 
 		 462 aa  82  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0090  selenocysteine synthase  27.33 
 
 		 463 aa  81.6  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3060  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase  27.68 
 
 		 491 aa  82  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000814567  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2392  selenocysteine synthase  27.37 
 
 		 480 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.36039  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4157  selenocysteine synthase  25.18 
 
 		 478 aa  81.3  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.109282 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2867  selenocysteine synthase  27.72 
 
 		 465 aa  80.9  0.00000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.861059  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1678.1  selenocysteine synthase  27.01 
 
 		 480 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0726  selenocysteine synthase  27.01 
 
 		 480 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1696  selenocysteine synthase  27.01 
 
 		 480 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1903  selenocysteine synthase  27.01 
 
 		 480 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2255  selenocysteine synthase  27.01 
 
 		 480 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0575  selenocysteine synthase  27.01 
 
 		 480 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.81182  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3265  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase  27.57 
 
 		 474 aa  80.1  0.00000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.322866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0658  selenocysteine synthase  25.47 
 
 		 485 aa  79.7  0.00000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0487708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2561  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase  30.5 
 
 		 470 aa  79  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1093  selenocysteine synthase  28.24 
 
 		 473 aa  78.6  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3879  selenocysteine synthase  26.96 
 
 		 468 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.797755 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2186  selenocysteine synthase  26.64 
 
 		 475 aa  77.8  0.0000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000130274  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3988  selenocysteine synthase  25.96 
 
 		 479 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4522  selenocysteine synthase  27.4 
 
 		 478 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.843638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1740  selenocysteine synthase  25.87 
 
 		 475 aa  76.3  0.0000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.820555  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3540  selenocysteine synthase  25.96 
 
 		 479 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.607599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3059  selenocysteine synthase  24.91 
 
 		 483 aa  75.9  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00615002  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1311  selenocysteine synthase  27.18 
 
 		 506 aa  75.1  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000207864 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2208  L-seryl-tRNA selenium transferase  27.06 
 
 		 519 aa  74.7  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.223965 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3796  selenocysteine synthase  26.65 
 
 		 468 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.245945  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0441  selenocysteine synthase  25.06 
 
 		 491 aa  73.9  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0527  selenocysteine synthase  28.08 
 
 		 475 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.817809 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0442  selenocysteine synthase  29.27 
 
 		 496 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0493  selenocysteine synthase  28.08 
 
 		 475 aa  73.6  0.000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.568026 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0536  selenocysteine synthase  27.74 
 
 		 475 aa  73.6  0.000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1646  selenocysteine synthase  24.52 
 
 		 471 aa  73.2  0.000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000318162  unclonable  0.000000000338513 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0548  selenocysteine synthase  27.53 
 
 		 475 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.147839 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0482  selenocysteine synthase  25.52 
 
 		 489 aa  72.4  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.112411  hitchhiker  0.001297 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0140  selenocysteine synthase  27.9 
 
 		 463 aa  72.4  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25310  seryl-tRNA(Sec) selenium transferase  24.93 
 
 		 477 aa  72  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.362155 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0440  selenocysteine synthase  25.6 
 
 		 491 aa  72  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3766  selenocysteine synthase  24.73 
 
 		 462 aa  71.2  0.00000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0711  selenocysteine synthase  29.83 
 
 		 495 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3381  selenocysteine synthase  26.33 
 
 		 478 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>