192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0099 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0099  L-seryl-tRNA selenium transferase  100 
 
 		 406 aa  805    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.789274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1021  Pyridoxal phosphate-dependent transferase  43.22 
 
 		 407 aa  268  1e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.562756 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0175  Pyridoxal phosphate-dependent transferase  43.96 
 
 		 411 aa  243  3e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2440  selenocysteine synthase (seryl-tRNASer selenium transferase)-like protein  32.17 
 
 		 406 aa  203  5e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0244624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3968  L-seryl-tRNA(ser) selenium transferase protein  31.27 
 
 		 406 aa  199  1.0000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.456181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2990  pyridoxal phosphate-dependent enzyme, putative  34.07 
 
 		 398 aa  191  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.625674  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3964  pyridoxal phosphate-dependent enzyme, putative  30.64 
 
 		 407 aa  187  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.741974  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6666  L-seryl-tRNA selenium transferase  33.99 
 
 		 398 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.184749  normal  0.0169225 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6463  selenocysteine synthase (seryl-tRNASer selenium transferase)-like protein  31.69 
 
 		 414 aa  179  7e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1144  pyridoxal phosphate-dependent enzyme, putative  35.31 
 
 		 388 aa  179  8e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.46182  normal  0.521262 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5759  pyridoxal phosphate-dependent enzyme  37.77 
 
 		 398 aa  178  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.646746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5094  L-seryl-tRNA(ser) selenium transferase  33.25 
 
 		 398 aa  176  8e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4098  putative pyridoxal phosphate-dependent enzyme  31.76 
 
 		 369 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3975  putative pyridoxal phosphate-dependent enzyme  31.27 
 
 		 369 aa  160  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.133901  normal  0.976007 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3993  putative pyridoxal phosphate-dependent enzyme  31.02 
 
 		 369 aa  160  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0481  selenocysteine synthase (seryl-tRNASer selenium transferase)-like protein  31.44 
 
 		 511 aa  159  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.11487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4161  putative pyridoxal phosphate-dependent enzyme  30.77 
 
 		 369 aa  158  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.60373  normal  0.579159 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4047  putative pyridoxal phosphate-dependent enzyme  30.77 
 
 		 369 aa  155  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0548491 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3272  putative pyridoxal phosphate-dependent enzyme  31.27 
 
 		 369 aa  152  7e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2704  pyridoxal phosphate-dependent enzyme  36.86 
 
 		 402 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.249088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3866  pyridoxal phosphate-dependent enzyme  28.5 
 
 		 365 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.559786  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0676  pyridoxal phosphate-dependent enzyme  28.5 
 
 		 365 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0940  pyridoxal phosphate-dependent enzyme, putative  33.55 
 
 		 400 aa  139  1e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4375  pyridoxal phosphate-dependent enzyme, putative  27.49 
 
 		 372 aa  135  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.417275 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0430  pyridoxal phosphate-dependent enzyme, putative  28.71 
 
 		 372 aa  129  1.0000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4847  hypothetical protein  28.07 
 
 		 372 aa  127  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.601246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4728  hypothetical protein  28.07 
 
 		 372 aa  127  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4826  hypothetical protein  28.07 
 
 		 372 aa  126  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4697  hypothetical protein  28.07 
 
 		 372 aa  126  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.547246 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4792  hypothetical protein  28.07 
 
 		 372 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0918  pyridoxal phosphate-dependent enzyme  27.79 
 
 		 372 aa  125  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4739  pyridoxal phosphate-dependent enzyme  27.5 
 
 		 367 aa  123  7e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5099  pyridoxal phosphate-dependent enzyme  27.5 
 
 		 367 aa  123  7e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4959  putative pyridoxal phosphate-dependent enzyme  27.5 
 
 		 367 aa  122  8e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4987  putative pyridoxal phosphate-dependent enzyme  27.5 
 
 		 367 aa  122  8e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5002  pyridoxal phosphate-dependent enzyme, putative  27.5 
 
 		 367 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4579  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase; selenocysteine synthase  27.25 
 
 		 367 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4598  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase; selenocysteine synthase  27.5 
 
 		 367 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4688  pyridoxal phosphate-dependent enzyme, putative  27 
 
 		 367 aa  120  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0261  putative pyridoxal phosphate-dependent enzyme  27.25 
 
 		 367 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.262008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4974  putative pyridoxal phosphate-dependent enzyme  27 
 
 		 367 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3153  pyridoxal phosphate-dependent enzyme  27.9 
 
 		 373 aa  119  9.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0105  hypothetical protein  26.44 
 
 		 348 aa  109  8.000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0873  selenocysteine synthase  27.76 
 
 		 468 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0548  selenocysteine synthase  30.63 
 
 		 475 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.147839 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3486  selenocysteine synthase  30.08 
 
 		 484 aa  68.6  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0801308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1740  selenocysteine synthase  26.33 
 
 		 475 aa  68.2  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.820555  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3059  selenocysteine synthase  25.17 
 
 		 483 aa  67.8  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00615002  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2186  selenocysteine synthase  26.46 
 
 		 475 aa  68.2  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000130274  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0527  selenocysteine synthase  30.26 
 
 		 475 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.817809 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4157  selenocysteine synthase  29.24 
 
 		 478 aa  67.8  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.109282 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1646  selenocysteine synthase  26.64 
 
 		 471 aa  67  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000318162  unclonable  0.000000000338513 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0493  selenocysteine synthase  29.89 
 
 		 475 aa  67  0.0000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.568026 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2085  selenocysteine synthase  27.84 
 
 		 462 aa  67  0.0000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2373  selenocysteine synthase  28.36 
 
 		 462 aa  65.9  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0536  selenocysteine synthase  30.65 
 
 		 475 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0672  selenocysteine synthase  23.28 
 
 		 462 aa  65.5  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3265  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase  29.85 
 
 		 474 aa  64.7  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.322866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6556  selenocysteine synthase  30.08 
 
 		 476 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0759041  decreased coverage  0.00101657 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1162  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase  27.48 
 
 		 476 aa  63.5  0.000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00103584 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3879  selenocysteine synthase  27.2 
 
 		 468 aa  62.4  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.797755 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0812  L-seryl-tRNA selenium transferase  24.66 
 
 		 468 aa  61.6  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3477  L-seryl-tRNA selenium transferase  25.82 
 
 		 473 aa  61.6  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.213454  normal  0.293917 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0760  selenocysteine synthase  25.69 
 
 		 472 aa  61.6  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.306605  normal  0.694521 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2706  selenocysteine synthase  28.42 
 
 		 468 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277049 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3796  selenocysteine synthase  27.2 
 
 		 468 aa  61.6  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.245945  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1093  selenocysteine synthase  28.02 
 
 		 473 aa  60.8  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2561  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase  26.39 
 
 		 470 aa  58.9  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4162  selenocysteine synthase  26.79 
 
 		 462 aa  58.9  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0108  selenocysteine synthase  29.11 
 
 		 476 aa  58.5  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2477  selenocysteine synthase  26.24 
 
 		 448 aa  57.8  0.0000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0711  selenocysteine synthase  35.51 
 
 		 495 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0104  selenocysteine synthase  29.11 
 
 		 476 aa  56.6  0.0000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0109  selenocysteine synthase  29.11 
 
 		 476 aa  56.6  0.0000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1124  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  34.81 
 
 		 425 aa  56.2  0.0000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000369055  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25310  seryl-tRNA(Sec) selenium transferase  24.51 
 
 		 477 aa  55.1  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.362155 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2965  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase  27.91 
 
 		 446 aa  55.1  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0158372  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01610  cysteine desulfurase family protein, VC1184 subfamily  29.51 
 
 		 399 aa  54.7  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.129421  normal  0.129157 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4267  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase  24.9 
 
 		 476 aa  54.7  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000207221  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5527  selenocysteine synthase  28.74 
 
 		 468 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0482  selenocysteine synthase  25.39 
 
 		 489 aa  53.9  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.112411  hitchhiker  0.001297 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0105  selenocysteine synthase  29.11 
 
 		 473 aa  53.5  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0101  selenocysteine synthase  29.11 
 
 		 473 aa  53.5  0.000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0106  selenocysteine synthase  29.11 
 
 		 476 aa  53.1  0.000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63540  selenocysteine synthase  28.74 
 
 		 468 aa  53.1  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.219869  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1678.1  selenocysteine synthase  28.85 
 
 		 480 aa  52.8  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0726  selenocysteine synthase  28.85 
 
 		 480 aa  52.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1696  selenocysteine synthase  28.85 
 
 		 480 aa  52.8  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1903  selenocysteine synthase  28.85 
 
 		 480 aa  52.8  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2255  selenocysteine synthase  28.85 
 
 		 480 aa  52.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0575  selenocysteine synthase  28.85 
 
 		 480 aa  52.8  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.81182  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0045  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  44.71 
 
 		 430 aa  52.8  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0045  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  44.71 
 
 		 430 aa  52.8  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1814  selenocysteine synthase  24.85 
 
 		 465 aa  52  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.071718 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2392  selenocysteine synthase  28.46 
 
 		 480 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.36039  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1311  selenocysteine synthase  28.36 
 
 		 506 aa  52.4  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000207864 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0106  selenocysteine synthase  28.64 
 
 		 476 aa  51.2  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0061  selenocysteine synthase  27.04 
 
 		 462 aa  50.8  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0301  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase  28.5 
 
 		 466 aa  50.8  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2208  L-seryl-tRNA selenium transferase  25.75 
 
 		 519 aa  50.4  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.223965 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>