More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_26870 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_26870  pyruvate carboxylase  100 
 
 
72 aa  137  3.9999999999999997e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0185  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  64.62 
 
 
77 aa  80.9  0.000000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0549  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  47.89 
 
 
71 aa  70.1  0.000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13247  putative acetyl-CoA carboxylase biotin carboxyl carrier protein subunit  52.11 
 
 
79 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.478613 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3523  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  48.61 
 
 
73 aa  67.8  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0965  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  48.57 
 
 
72 aa  67.4  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.279556  normal  0.189514 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7733  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  48.57 
 
 
71 aa  67  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1839  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxyl carrier protein subunit  47.76 
 
 
70 aa  66.2  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.473895  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4093  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  47.14 
 
 
73 aa  64.7  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.607208  normal  0.0610793 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1410  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  52.31 
 
 
71 aa  64.7  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.501962  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2442  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxyl carrier protein subunit  46.97 
 
 
70 aa  64.7  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2917  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  49.25 
 
 
70 aa  64.3  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.332862  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1780  putative acetyl-CoA carboxylase biotin carboxyl carrier protein subunit  46.48 
 
 
71 aa  63.9  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.585255 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3765  biotin/lipoyl attachment  47.14 
 
 
76 aa  63.9  0.0000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.10009  normal  0.309816 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4687  putative acetyl-CoA carboxylase biotin carboxyl carrier protein subunit  49.3 
 
 
71 aa  63.5  0.0000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0133737  normal  0.0386884 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8317  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxyl carrier protein subunit  47.06 
 
 
70 aa  63.5  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1415  putative acetyl-CoA carboxylase biotin carboxyl carrier protein subunit  49.3 
 
 
71 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.979594  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1399  putative acetyl-CoA carboxylase biotin carboxyl carrier protein subunit  49.3 
 
 
71 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.46478  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1381  putative acetyl-CoA carboxylase biotin carboxyl carrier protein subunit  49.3 
 
 
71 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1804  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxyl carrier protein subunit  44.12 
 
 
71 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0211205  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3712  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  44.29 
 
 
121 aa  62  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4187  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  49.23 
 
 
72 aa  61.2  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1576  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  50 
 
 
70 aa  60.8  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.4086 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2513  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxyl carrier protein subunit  42.65 
 
 
71 aa  60.1  0.000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2810  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxyl carrier protein subunit  42.65 
 
 
71 aa  60.1  0.000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000978234 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2371  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxyl carrier protein subunit  42.65 
 
 
71 aa  59.7  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0520447  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2329  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxyl carrier protein subunit  42.65 
 
 
71 aa  59.7  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.258491  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2287  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxyl carrier protein subunit  42.65 
 
 
71 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.758262  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2605  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxyl carrier protein subunit  42.65 
 
 
71 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.313988  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2357  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxyl carrier protein subunit  42.65 
 
 
71 aa  59.7  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2562  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxyl carrier protein subunit  42.65 
 
 
71 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.57064e-19 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4108  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  43.66 
 
 
72 aa  58.9  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.888479  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2550  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxyl carrier protein subunit  43.08 
 
 
70 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.163207  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2549  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxyl carrier protein subunit  43.08 
 
 
70 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5183  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  44.29 
 
 
71 aa  57.8  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.95004 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1338  allophanate hydrolase subunit 2  45.59 
 
 
1210 aa  57.8  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0387482  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4243  urea amidolyase-related protein  43.48 
 
 
1226 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3977  Urea amidolyase-related protein  44.93 
 
 
1488 aa  57  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2054  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  53.85 
 
 
71 aa  56.6  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0198613  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1358  biotin carboxylation domain-containing protein  44.12 
 
 
1231 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.306676  normal  0.336229 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0703  urea amidolyase related protein  43.28 
 
 
1209 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3702  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  43.28 
 
 
70 aa  55.5  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.114959  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3979  urea carboxylase  45.31 
 
 
1203 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0730  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP- binding  50 
 
 
588 aa  53.9  0.0000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.858294  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1892  Urea carboxylase  46.67 
 
 
1205 aa  53.5  0.0000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.434507  normal  0.299649 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1792  allophanate hydrolase subunit 2  41.54 
 
 
1206 aa  52.8  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.73882  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1491  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  40.91 
 
 
144 aa  52.4  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0157118 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0766  urea carboxylase  38.71 
 
 
1201 aa  52.4  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3947  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  39.34 
 
 
73 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2188  allophanate hydrolase subunit 2  41.54 
 
 
1183 aa  51.2  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2540  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  47.06 
 
 
626 aa  51.6  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.391908 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1631  acetyl/propionyl-CoA carboxylase subunit alpha  43.94 
 
 
654 aa  51.6  0.000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2772  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  46.55 
 
 
671 aa  51.2  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.187116 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3623  oxaloacetate decarboxylase  41.18 
 
 
599 aa  51.2  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00192901  decreased coverage  0.000000118523 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1070  methylcrotonyl-CoA carboxylase biotin-containing subunit  38.24 
 
 
661 aa  50.8  0.000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0962  biotin carboxylase  38.24 
 
 
661 aa  50.8  0.000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1200  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  40.98 
 
 
609 aa  50.8  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.45293 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1306  oxaloacetate decarboxylase  40.3 
 
 
596 aa  50.8  0.000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00193568  normal  0.0412594 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1556  pyruvate carboxylase subunit B  43.08 
 
 
604 aa  50.4  0.000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.411533  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2502  propionyl-coenzyme A carboxylase alpha polypeptide  42.42 
 
 
1243 aa  50.4  0.000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0203  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  42.62 
 
 
133 aa  49.7  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0192452  normal  0.752214 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1638  pyruvate carboxylase  41.18 
 
 
1167 aa  49.7  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3196  oxaloacetate decarboxylase  37.88 
 
 
594 aa  50.1  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.097101  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0631  Conserved carboxylase region  39.39 
 
 
633 aa  50.1  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1199  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP binding domain protein  42.42 
 
 
637 aa  49.3  0.00002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000920632 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2502  urea carboxylase  35.82 
 
 
1204 aa  49.3  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0320  oxaloacetate decarboxylase  34.78 
 
 
605 aa  49.3  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1011  oxaloacetate decarboxylase, alpha subunit, putative  37.88 
 
 
599 aa  48.5  0.00003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0808  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  40 
 
 
611 aa  48.9  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.443377  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1063  biotin/lipoyl attachment  39.66 
 
 
69 aa  48.9  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2480  oxaloacetate decarboxylase  37.14 
 
 
598 aa  48.1  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5521  pyruvate carboxylase  40.58 
 
 
1173 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1267  oxaloacetate decarboxylase, alpha subunit  40 
 
 
615 aa  48.1  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2361  urea amidolyase related protein  39.13 
 
 
1200 aa  48.1  0.00004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0815  propionyl-CoA carboxylase, alpha subunit  37.31 
 
 
652 aa  48.1  0.00004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.904428  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1588  urea carboxylase  38.81 
 
 
1182 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4531  allophanate hydrolase subunit 2  38.24 
 
 
1183 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2748  urea carboxylase  37.88 
 
 
1204 aa  48.1  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1350  pyruvate carboxylase subunit B  39.39 
 
 
568 aa  48.1  0.00004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2163  urea carboxylase  35.82 
 
 
1204 aa  47.8  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.278684  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2799  oxaloacetate decarboxylase  38.24 
 
 
690 aa  47.8  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.29172 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0859  oxaloacetate decarboxylase, alpha subunit  41.67 
 
 
650 aa  47.8  0.00005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00177232  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05850  acetyl/propionyl-CoA carboxylase, alpha subunit  44.12 
 
 
591 aa  47.8  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.79631 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3292  biotin/lipoyl attachment  35.94 
 
 
69 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5754  pyruvate carboxylase  40.58 
 
 
1169 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345143  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0940  oxaloacetate decarboxylase, alpha subunit, putative  36.36 
 
 
599 aa  47.8  0.00005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1199  oxaloacetate decarboxylase  42.86 
 
 
603 aa  48.1  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.584656  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1250  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  38.57 
 
 
121 aa  47.8  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0765  pyruvate carboxylase  40.32 
 
 
1154 aa  47.8  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.531635  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2090  pyruvate carboxylase  40.32 
 
 
1154 aa  47.4  0.00006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7328  pyruvate carboxylase  41.18 
 
 
1172 aa  47.4  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.402433 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0402  pyruvate carboxylase  44.64 
 
 
1147 aa  47.4  0.00006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6223  pyruvate carboxylase subunit B  46.55 
 
 
607 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2889  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  45.76 
 
 
660 aa  47.4  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.894613  normal  0.421393 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71720  pyruvate carboxylase subunit B  46.55 
 
 
607 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6105  urea carboxylase  39.71 
 
 
1179 aa  47.4  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.164711  normal  0.417784 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4719  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  35.29 
 
 
667 aa  47  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0693  oxaloacetate decarboxylase  44.12 
 
 
602 aa  47.4  0.00008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5558  allophanate hydrolase subunit 2  39.13 
 
 
1205 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.453459  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5923  biotin carboxylation region  39.13 
 
 
1205 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.559652  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>