More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4108 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_4108  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  100 
 
 
72 aa  140  5e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.888479  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4243  urea amidolyase-related protein  50 
 
 
1226 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3977  Urea amidolyase-related protein  50.75 
 
 
1488 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6105  urea carboxylase  53.03 
 
 
1179 aa  71.2  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.164711  normal  0.417784 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6517  urea carboxylase  54.55 
 
 
1179 aa  70.5  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0549  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  47.14 
 
 
71 aa  69.7  0.00000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1358  biotin carboxylation domain-containing protein  47.83 
 
 
1231 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.306676  normal  0.336229 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0703  urea amidolyase related protein  51.43 
 
 
1209 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3979  urea carboxylase  54.55 
 
 
1203 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1839  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxyl carrier protein subunit  47.06 
 
 
70 aa  67.4  0.00000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.473895  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4531  allophanate hydrolase subunit 2  49.25 
 
 
1183 aa  67  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3523  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  46.48 
 
 
73 aa  66.6  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2442  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxyl carrier protein subunit  46.97 
 
 
70 aa  65.9  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1338  allophanate hydrolase subunit 2  44.93 
 
 
1210 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0387482  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8317  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxyl carrier protein subunit  46.27 
 
 
70 aa  65.1  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1576  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  44.78 
 
 
70 aa  64.3  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.4086 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7733  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  46.48 
 
 
71 aa  63.5  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0202  oxaloacetate decarboxylase  46.27 
 
 
599 aa  63.5  0.0000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5183  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  44.29 
 
 
71 aa  63.5  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.95004 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3469  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  52.94 
 
 
670 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0185  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  52.31 
 
 
77 aa  63.2  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3702  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  44.78 
 
 
70 aa  62.4  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.114959  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1792  allophanate hydrolase subunit 2  41.54 
 
 
1206 aa  62.4  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.73882  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3792  urea amidolyase related protein  48.53 
 
 
1228 aa  61.6  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3089  urea carboxylase  46.97 
 
 
1204 aa  61.6  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.176139  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1892  Urea carboxylase  50 
 
 
1205 aa  61.6  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.434507  normal  0.299649 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2054  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  50 
 
 
71 aa  61.2  0.000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0198613  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2995  pyruvate carboxylase  50.75 
 
 
1149 aa  60.8  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1199  oxaloacetate decarboxylase  43.66 
 
 
603 aa  60.8  0.000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.584656  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1588  urea carboxylase  44.62 
 
 
1182 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0293  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  46.15 
 
 
133 aa  60.5  0.000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4449  urea carboxylase  48.53 
 
 
1238 aa  60.5  0.000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2502  propionyl-coenzyme A carboxylase alpha polypeptide  45.45 
 
 
1243 aa  60.5  0.000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3800  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  46.27 
 
 
70 aa  60.1  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0529751  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3743  biotin/lipoyl attachment protein  46.27 
 
 
70 aa  60.1  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.325325  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3884  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  46.27 
 
 
70 aa  60.1  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0180706  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0730  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP- binding  46.27 
 
 
588 aa  59.7  0.00000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.858294  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0766  urea carboxylase  43.55 
 
 
1201 aa  60.1  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1306  oxaloacetate decarboxylase  46.27 
 
 
596 aa  59.7  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00193568  normal  0.0412594 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1220  oxaloacetate decarboxylase  44.62 
 
 
601 aa  59.3  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0185712  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2371  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxyl carrier protein subunit  44.12 
 
 
71 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0520447  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2329  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxyl carrier protein subunit  44.12 
 
 
71 aa  58.9  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.258491  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2287  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxyl carrier protein subunit  44.12 
 
 
71 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.758262  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0805  putative acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  50 
 
 
664 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1200  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  46.27 
 
 
609 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.45293 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0468  biotin carboxylase subunit of acetyl-CoA carboxylase  49.28 
 
 
666 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2513  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxyl carrier protein subunit  44.12 
 
 
71 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26870  pyruvate carboxylase  43.66 
 
 
72 aa  58.9  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0651  putative acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  50 
 
 
664 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.547961  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3765  biotin/lipoyl attachment  43.06 
 
 
76 aa  58.9  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.10009  normal  0.309816 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1454  oxaloacetate decarboxylase  41.79 
 
 
690 aa  59.3  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.583175  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2188  allophanate hydrolase subunit 2  44.62 
 
 
1183 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2605  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxyl carrier protein subunit  44.12 
 
 
71 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.313988  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1956  putative acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  49.28 
 
 
664 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2357  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxyl carrier protein subunit  44.12 
 
 
71 aa  58.9  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1605  putative acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  50 
 
 
664 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.585456  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2562  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxyl carrier protein subunit  44.12 
 
 
71 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.57064e-19 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2810  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxyl carrier protein subunit  44.12 
 
 
71 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000978234 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0320  oxaloacetate decarboxylase  44.12 
 
 
605 aa  58.9  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0965  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  42.86 
 
 
72 aa  59.3  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.279556  normal  0.189514 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0539  putative acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  50 
 
 
664 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1126  oxaloacetate decarboxylase  40.85 
 
 
607 aa  58.9  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3712  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  40.85 
 
 
121 aa  58.2  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4597  pyruvate carboxylase  46.97 
 
 
1157 aa  58.5  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3266  oxaloacetate decarboxylase  40.85 
 
 
607 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0475332 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1259  pyruvate carboxylase/oxaloacetate decarboxylase beta subunit  41.18 
 
 
603 aa  58.5  0.00000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.911837  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1025  oxaloacetate decarboxylase  40.85 
 
 
606 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3015  pyruvate carboxylase  49.25 
 
 
1148 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.240304  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1092  oxaloacetate decarboxylase  40.85 
 
 
607 aa  58.9  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2917  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  43.28 
 
 
70 aa  58.2  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.332862  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1638  pyruvate carboxylase  45.45 
 
 
1167 aa  58.2  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1852  pyruvate carboxylase  40.58 
 
 
1147 aa  58.2  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2304  urea carboxylase  43.94 
 
 
1209 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.198231  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4187  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  41.79 
 
 
72 aa  57.8  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4093  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  39.44 
 
 
73 aa  57.8  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.607208  normal  0.0610793 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3329  pyruvate carboxylase  46.97 
 
 
1158 aa  57.8  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1804  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxyl carrier protein subunit  45.59 
 
 
71 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0211205  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2550  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxyl carrier protein subunit  44.62 
 
 
70 aa  57.8  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.163207  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3215  pyruvate carboxylase  47.76 
 
 
1148 aa  57.4  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2090  pyruvate carboxylase  45.45 
 
 
1154 aa  57.4  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7328  pyruvate carboxylase  45.45 
 
 
1172 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.402433 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2549  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxyl carrier protein subunit  44.62 
 
 
70 aa  57.8  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0765  pyruvate carboxylase  45.45 
 
 
1154 aa  57.4  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.531635  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2799  oxaloacetate decarboxylase  40.91 
 
 
690 aa  57.4  0.00000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.29172 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1030  oxaloacetate decarboxylase  41.43 
 
 
608 aa  57.4  0.00000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2053  putative acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  47.83 
 
 
666 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.698368  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3114  pyruvate carboxylase  46.27 
 
 
1148 aa  57  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.558705  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1556  pyruvate carboxylase subunit B  47.76 
 
 
604 aa  57  0.00000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.411533  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1410  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  44.78 
 
 
71 aa  57  0.00000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.501962  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1781  pyruvate carboxylase  45.59 
 
 
1158 aa  57  0.00000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4167  pyruvate carboxylase  46.27 
 
 
1154 aa  57  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0803  oxaloacetate decarboxylase  44.78 
 
 
589 aa  57  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1222  Urea carboxylase  43.94 
 
 
1180 aa  57  0.00000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26806  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1716  pyruvate carboxylase  45.59 
 
 
1158 aa  57  0.00000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2748  urea carboxylase  39.39 
 
 
1204 aa  56.6  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13247  putative acetyl-CoA carboxylase biotin carboxyl carrier protein subunit  38.03 
 
 
79 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.478613 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3336  oxaloacetate decarboxylase  40.85 
 
 
602 aa  56.2  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000131691 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0060  oxaloacetate decarboxylase  44.78 
 
 
591 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.653336 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0894  oxaloacetate decarboxylase  44.78 
 
 
589 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3543  oxaloacetate decarboxylase  44.78 
 
 
589 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.549121  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>