More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0859 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_0916  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  72.31 
 
 		 610 aa  956    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.345122 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0808  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  72.46 
 
 		 611 aa  931    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.443377  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1267  oxaloacetate decarboxylase, alpha subunit  73.23 
 
 		 615 aa  956    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0859  oxaloacetate decarboxylase, alpha subunit  100 
 
 		 650 aa  1346    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00177232  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1568  Oxaloacetate decarboxylase  80.46 
 
 		 641 aa  1098    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00759156  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1200  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  72.11 
 
 		 609 aa  939    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.45293 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1192  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  76.92 
 
 		 634 aa  1035    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.345988  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1620  biotin/lipoyl attachment  51.61 
 
 		 609 aa  625  1e-178  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0964  biotin/lipoyl attachment  50.31 
 
 		 602 aa  620  1e-176  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0659271  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1508  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase 2  50.85 
 
 		 600 aa  620  1e-176  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0604  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  49.16 
 
 		 601 aa  604  1.0000000000000001e-171  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.984732  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1197  pyruvate carboxylase, subunit B  49.39 
 
 		 592 aa  598  1e-169  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.278458  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1293  biotin/lipoyl attachment  48.02 
 
 		 613 aa  591  1e-167  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.352378  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0063  Pyruvate carboxylase  50 
 
 		 603 aa  591  1e-167  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000388454  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0940  oxaloacetate decarboxylase, alpha subunit, putative  50.33 
 
 		 599 aa  573  1.0000000000000001e-162  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0881  oxaloacetate decarboxylase, alpha subunit, putative  50.08 
 
 		 599 aa  572  1.0000000000000001e-162  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.178794  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1011  oxaloacetate decarboxylase, alpha subunit, putative  50 
 
 		 599 aa  571  1e-161  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1259  pyruvate carboxylase/oxaloacetate decarboxylase beta subunit  48.33 
 
 		 603 aa  559  1e-158  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.911837  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6223  pyruvate carboxylase subunit B  29.22 
 
 		 607 aa  228  2e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4478  pyruvate carboxylase subunit B  28.4 
 
 		 602 aa  226  1e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71720  pyruvate carboxylase subunit B  29.07 
 
 		 607 aa  226  1e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5510  oxaloacetate decarboxylase, alpha subunit  28.87 
 
 		 602 aa  218  2e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5060  pyruvate carboxylase subunit B  28.72 
 
 		 602 aa  218  2e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1341  pyruvate carboxylase subunit B  27.79 
 
 		 569 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.421509 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3925  pyruvate carboxylase subunit B  28.79 
 
 		 602 aa  218  2.9999999999999998e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.246664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0612  pyruvate carboxylase subunit B  27.48 
 
 		 569 aa  218  4e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.86669  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5124  pyruvate carboxylase subunit B  28.46 
 
 		 602 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.588617 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5346  pyruvate carboxylase subunit B  28.57 
 
 		 602 aa  215  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544178 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5255  pyruvate carboxylase subunit B  28.57 
 
 		 602 aa  215  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.594563 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5639  pyruvate carboxylase subunit B  28.36 
 
 		 602 aa  214  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.509278  normal  0.279946 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5395  pyruvate carboxylase subunit B  28.21 
 
 		 602 aa  213  9e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0145041 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1916  pyruvate carboxylase subunit B  28.38 
 
 		 609 aa  212  1e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.566124  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1005  pyruvate carboxylase subunit B  27.8 
 
 		 567 aa  213  1e-53  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_128  oxaloacetate decarboxylase, alpha subunit  29.94 
 
 		 587 aa  209  1e-52  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02060  pyruvate carboxylase subunit B  27.99 
 
 		 599 aa  208  2e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3623  oxaloacetate decarboxylase  28.07 
 
 		 599 aa  207  4e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00192901  decreased coverage  0.000000118523 
 
 
-
 
NC_002936  DET0119  pyruvate carboxylase subunit B  29.03 
 
 		 584 aa  207  5e-52  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.698581  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1556  pyruvate carboxylase subunit B  27.57 
 
 		 604 aa  206  9e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.411533  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1435  pyruvate carboxylase subunit B  27.98 
 
 		 638 aa  206  1e-51  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000897989  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0631  Conserved carboxylase region  26.71 
 
 		 633 aa  206  1e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0250  pyruvate carboxylase subunit B  28.27 
 
 		 582 aa  205  2e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0819  oxaloacetate decarboxylase  31.32 
 
 		 462 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0202  oxaloacetate decarboxylase  26.98 
 
 		 599 aa  202  1.9999999999999998e-50  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1512  pyruvate carboxylase subunit B  27.84 
 
 		 617 aa  201  3e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.841478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1556  pyruvate carboxylase subunit B  27.25 
 
 		 615 aa  201  3.9999999999999996e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.944098  normal  0.0959021 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0796  oxaloacetate decarboxylase  31.89 
 
 		 462 aa  200  6e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0631  pyruvate carboxylase subunit B  26.1 
 
 		 619 aa  197  4.0000000000000005e-49  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0803  oxaloacetate decarboxylase  28.4 
 
 		 589 aa  196  8.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0862  oxaloacetate decarboxylase  27.3 
 
 		 590 aa  196  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3543  oxaloacetate decarboxylase  28.4 
 
 		 589 aa  196  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.549121  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1350  pyruvate carboxylase subunit B  26.95 
 
 		 568 aa  194  6e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3712  oxaloacetate decarboxylase  27.15 
 
 		 590 aa  193  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1586  pyruvate carboxylase subunit B  26.88 
 
 		 573 aa  193  1e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.526056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0060  oxaloacetate decarboxylase  27.15 
 
 		 590 aa  193  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.580433  normal  0.307421 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1321  oxaloacetate decarboxylase  26.4 
 
 		 604 aa  192  1e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0140986 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0085  oxaloacetate decarboxylase  26.89 
 
 		 597 aa  190  5.999999999999999e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0260292  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0075  hypothetical protein  27.86 
 
 		 681 aa  189  2e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.273109  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1064  pyruvate carboxylase subunit B  26.51 
 
 		 634 aa  187  4e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000214042  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2603  pyruvate carboxylase subunit B  26.72 
 
 		 624 aa  187  4e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000143186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3336  oxaloacetate decarboxylase  26.15 
 
 		 602 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000131691 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1284  pyruvate carboxylase subunit B  26.52 
 
 		 618 aa  185  2.0000000000000003e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.01303  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02841  oxaloacetate decarboxylase  25.9 
 
 		 604 aa  184  3e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.698673  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1582  oxaloacetate decarboxylase  31.06 
 
 		 465 aa  184  4.0000000000000006e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2034  Methylmalonyl-CoA carboxytransferase  29.59 
 
 		 507 aa  184  4.0000000000000006e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00118828  decreased coverage  0.000000727606 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2986  oxaloacetate decarboxylase  26.45 
 
 		 611 aa  184  7e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.657693 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3068  oxaloacetate decarboxylase  26.29 
 
 		 611 aa  183  7e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.515821 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1220  oxaloacetate decarboxylase  26.36 
 
 		 601 aa  183  9.000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0185712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1015  pyruvate carboxylase subunit B  30.65 
 
 		 614 aa  182  2e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.091976  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0639  oxaloacetate decarboxylase  26.4 
 
 		 595 aa  182  2e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0971  oxaloacetate decarboxylase  27.68 
 
 		 595 aa  181  2.9999999999999997e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.195309  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3508  pyruvate carboxylase subunit B  26.36 
 
 		 621 aa  181  4e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000543633  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1334  pyruvate carboxylase subunit B  28.43 
 
 		 569 aa  181  4.999999999999999e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3165  oxaloacetate decarboxylase  25.9 
 
 		 611 aa  181  4.999999999999999e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.668035 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002525  oxaloacetate decarboxylase alpha chain  27.2 
 
 		 594 aa  181  4.999999999999999e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.450431  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1025  oxaloacetate decarboxylase  27.37 
 
 		 606 aa  181  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1030  oxaloacetate decarboxylase  26.02 
 
 		 608 aa  180  7e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0461  hypothetical protein  26.88 
 
 		 661 aa  180  8e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00676863  normal  0.0747191 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3266  oxaloacetate decarboxylase  27.18 
 
 		 607 aa  179  1e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0475332 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1092  oxaloacetate decarboxylase  25.93 
 
 		 607 aa  174  5e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0558  pyruvate carboxylase subunit B  26.38 
 
 		 636 aa  174  5e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0745803  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0033  oxaloacetate decarboxylase  28.57 
 
 		 499 aa  174  5e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000614565  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3084  oxaloacetate decarboxylase  28.57 
 
 		 499 aa  174  5e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000401568  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1049  oxaloacetate decarboxylase  26.37 
 
 		 592 aa  174  5.999999999999999e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1010  pyruvate carboxylase subunit B  25.23 
 
 		 579 aa  174  5.999999999999999e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.843574 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1435  Pyruvate carboxylase  29.32 
 
 		 507 aa  174  6.999999999999999e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1126  oxaloacetate decarboxylase  26.84 
 
 		 607 aa  173  9e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1230  Conserved carboxylase region  29.9 
 
 		 475 aa  173  1e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1052  oxaloacetate decarboxylase  26.59 
 
 		 599 aa  172  1e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0474655  normal  0.268345 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1733  pyruvate carboxylase subunit B  27.29 
 
 		 567 aa  171  4e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0137  pyruvate carboxylase subunit B  25.08 
 
 		 577 aa  170  9e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1864  oxaloacetate decarboxylase  27.85 
 
 		 458 aa  169  1e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00728685  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0316  oxaloacetate decarboxylase  27.7 
 
 		 501 aa  169  1e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1755  oxaloacetate decarboxylase  27.96 
 
 		 461 aa  169  2e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0334  oxaloacetate decarboxylase  27.7 
 
 		 501 aa  169  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.849727  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0320  oxaloacetate decarboxylase  28.79 
 
 		 605 aa  168  2.9999999999999998e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2480  oxaloacetate decarboxylase  27.14 
 
 		 598 aa  168  4e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1439  oxaloacetate decarboxylase  27.1 
 
 		 462 aa  166  1.0000000000000001e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00378235  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1736  oxaloacetate decarboxylase  28.57 
 
 		 510 aa  165  3e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1643  pyruvate carboxylase subunit B  25.49 
 
 		 582 aa  164  7e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.667683  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1594  oxaloacetate decarboxylase  28.84 
 
 		 480 aa  164  7e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.244683  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>