More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_1491 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_1491  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  100 
 
 
144 aa  285  2e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0157118 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0631  Conserved carboxylase region  51.28 
 
 
633 aa  128  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0700  biotin/lipoyl attachment protein  46.9 
 
 
132 aa  107  6e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1365  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  44.37 
 
 
125 aa  95.5  2e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0208474  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0799  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  39.86 
 
 
132 aa  95.1  3e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000233394  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1319  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  40.13 
 
 
147 aa  85.5  2e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1343  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  37.76 
 
 
142 aa  84.7  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.166002 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3094  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding protein  37.76 
 
 
611 aa  84  6e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1155  biotin/lipoyl attachment  36.62 
 
 
128 aa  84  7e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.849643  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0583  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  37.93 
 
 
131 aa  80.9  0.000000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2540  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  37.5 
 
 
626 aa  80.1  0.000000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.391908 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2435  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  37.24 
 
 
134 aa  79.3  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00647679  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1005  pyruvate carboxylase subunit B  40 
 
 
567 aa  78.6  0.00000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1737  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  46.88 
 
 
122 aa  78.2  0.00000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1729  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP- binding protein  34.9 
 
 
610 aa  77.8  0.00000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0293  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  39.44 
 
 
133 aa  77.8  0.00000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02841  oxaloacetate decarboxylase  40 
 
 
604 aa  76.6  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.698673  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1620  biotin/lipoyl attachment  39.73 
 
 
609 aa  75.9  0.0000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0730  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP- binding  44.44 
 
 
588 aa  75.5  0.0000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.858294  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0320  oxaloacetate decarboxylase  46.91 
 
 
605 aa  75.1  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1757  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  36.43 
 
 
134 aa  74.3  0.0000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0693  oxaloacetate decarboxylase  55.07 
 
 
602 aa  73.9  0.0000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3012  oxaloacetate decarboxylase  34.29 
 
 
596 aa  74.3  0.0000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.930079  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1733  pyruvate carboxylase subunit B  47.44 
 
 
567 aa  74.3  0.0000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0210  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  31.69 
 
 
134 aa  73.9  0.0000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2986  oxaloacetate decarboxylase  35.71 
 
 
611 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.657693 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2575  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP- binding  32.39 
 
 
613 aa  73.2  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0862  oxaloacetate decarboxylase  48.65 
 
 
590 aa  72.4  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1609  methylmalonyl-CoA decarboxylase, gamma subunit  32.43 
 
 
144 aa  71.6  0.000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0997  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  34.75 
 
 
131 aa  71.6  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5538  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP- binding protein  39.36 
 
 
596 aa  72  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0551401 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0212  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  33.33 
 
 
132 aa  72  0.000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6688  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  52.17 
 
 
169 aa  72  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1433  biotin carboxyl carrier protein  34.21 
 
 
139 aa  71.6  0.000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0060  oxaloacetate decarboxylase  48.65 
 
 
590 aa  71.2  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.580433  normal  0.307421 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3712  oxaloacetate decarboxylase  48.65 
 
 
590 aa  71.2  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2480  oxaloacetate decarboxylase  51.47 
 
 
598 aa  70.9  0.000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3068  oxaloacetate decarboxylase  35.71 
 
 
611 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.515821 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2123  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding protein  51.43 
 
 
592 aa  70.5  0.000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0085  oxaloacetate decarboxylase  34.03 
 
 
597 aa  70.1  0.000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0260292  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1293  biotin/lipoyl attachment  38.73 
 
 
613 aa  68.9  0.00000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.352378  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1576  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  49.25 
 
 
70 aa  68.6  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.4086 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2537  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  41.49 
 
 
590 aa  68.6  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.232961  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1556  pyruvate carboxylase subunit B  32.37 
 
 
604 aa  68.2  0.00000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.411533  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0137  pyruvate carboxylase subunit B  45.68 
 
 
577 aa  67.8  0.00000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3623  oxaloacetate decarboxylase  41.49 
 
 
599 aa  67.4  0.00000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00192901  decreased coverage  0.000000118523 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0507  pyruvate carboxylase subunit B  34.48 
 
 
596 aa  67  0.00000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1321  oxaloacetate decarboxylase  34.53 
 
 
604 aa  67  0.00000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0140986 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1819  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  33.1 
 
 
133 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1318  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  38.14 
 
 
127 aa  66.2  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1220  oxaloacetate decarboxylase  46.48 
 
 
601 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0185712  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0531  pyruvate carboxylase subunit B  33.79 
 
 
596 aa  65.9  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05850  acetyl/propionyl-CoA carboxylase, alpha subunit  44.78 
 
 
591 aa  65.9  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.79631 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1512  pyruvate carboxylase subunit B  32.86 
 
 
617 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.841478  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0202  oxaloacetate decarboxylase  35 
 
 
599 aa  65.5  0.0000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1250  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  35.46 
 
 
121 aa  65.9  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3925  pyruvate carboxylase subunit B  31.51 
 
 
602 aa  65.5  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.246664  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2799  oxaloacetate decarboxylase  43.48 
 
 
690 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.29172 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0461  hypothetical protein  47.83 
 
 
661 aa  65.1  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00676863  normal  0.0747191 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1454  oxaloacetate decarboxylase  43.48 
 
 
690 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.583175  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0952  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  31.76 
 
 
151 aa  64.7  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.157223 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1030  oxaloacetate decarboxylase  31.43 
 
 
608 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3196  oxaloacetate decarboxylase  46.38 
 
 
594 aa  64.7  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.097101  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1358  biotin carboxylation domain-containing protein  44.87 
 
 
1231 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.306676  normal  0.336229 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2428  pyruvate carboxylase  37.37 
 
 
1148 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0297637  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0631  pyruvate carboxylase subunit B  46.84 
 
 
619 aa  64.3  0.0000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4478  pyruvate carboxylase subunit B  34.25 
 
 
602 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71720  pyruvate carboxylase subunit B  32.37 
 
 
607 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3165  oxaloacetate decarboxylase  33.8 
 
 
611 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.668035 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0062  oxaloacetate decarboxylase  46.38 
 
 
588 aa  64.3  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0887  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  30.97 
 
 
138 aa  64.3  0.0000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1916  pyruvate carboxylase subunit B  31.48 
 
 
609 aa  63.9  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.566124  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5639  pyruvate carboxylase subunit B  32.19 
 
 
602 aa  63.9  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.509278  normal  0.279946 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3543  oxaloacetate decarboxylase  46.97 
 
 
589 aa  63.9  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.549121  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6223  pyruvate carboxylase subunit B  32.37 
 
 
607 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3693  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  31.41 
 
 
153 aa  63.9  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.01136 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1052  oxaloacetate decarboxylase  32.14 
 
 
599 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0474655  normal  0.268345 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1049  oxaloacetate decarboxylase  45.45 
 
 
592 aa  63.9  0.0000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3544  oxaloacetate decarboxylase  46.97 
 
 
589 aa  63.9  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2549  pyruvate carboxylase  38.46 
 
 
1149 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.011252  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1839  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxyl carrier protein subunit  49.25 
 
 
70 aa  63.9  0.0000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.473895  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3266  oxaloacetate decarboxylase  30.71 
 
 
607 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0475332 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0803  oxaloacetate decarboxylase  46.97 
 
 
589 aa  63.9  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1832  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP- binding protein  41.76 
 
 
601 aa  63.9  0.0000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1011  oxaloacetate decarboxylase, alpha subunit, putative  35.71 
 
 
599 aa  63.5  0.0000000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0881  oxaloacetate decarboxylase, alpha subunit, putative  46.27 
 
 
599 aa  63.5  0.0000000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.178794  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0816  pyruvate carboxylase  35.19 
 
 
1148 aa  63.9  0.0000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.000000167673  hitchhiker  0.00000000644662 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0061  oxaloacetate decarboxylase  46.97 
 
 
589 aa  63.5  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1606  oxaloacetate decarboxylase alpha subunit  33.33 
 
 
608 aa  63.5  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0818232  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0894  oxaloacetate decarboxylase  46.97 
 
 
589 aa  63.5  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0060  oxaloacetate decarboxylase  46.97 
 
 
591 aa  63.5  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.653336 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0059  oxaloacetate decarboxylase  46.97 
 
 
591 aa  63.5  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.265333  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2907  pyruvate carboxylase  34.23 
 
 
1148 aa  63.5  0.0000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000167641  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02060  pyruvate carboxylase subunit B  30.99 
 
 
599 aa  63.5  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5060  pyruvate carboxylase subunit B  32.88 
 
 
602 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3336  oxaloacetate decarboxylase  31.69 
 
 
602 aa  63.2  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000131691 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3615  oxaloacetate decarboxylase  46.97 
 
 
589 aa  63.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.472152  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0831  oxaloacetate decarboxylase  46.97 
 
 
591 aa  63.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.977578  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1025  oxaloacetate decarboxylase  30.28 
 
 
606 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2442  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxyl carrier protein subunit  50.75 
 
 
70 aa  62.8  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>