More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0212 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_0212  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  100 
 
 
132 aa  246  7e-65  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0210  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  91.04 
 
 
134 aa  222  1e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0583  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  52.82 
 
 
131 aa  122  2e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1319  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  44.9 
 
 
147 aa  103  5e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1365  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  41.98 
 
 
125 aa  98.6  2e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0208474  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0555  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  41.21 
 
 
156 aa  87.8  4e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0293  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  40.91 
 
 
133 aa  85.1  3e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0202  oxaloacetate decarboxylase  39.23 
 
 
599 aa  84  7e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0799  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  35.04 
 
 
132 aa  79.3  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000233394  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3623  oxaloacetate decarboxylase  37.8 
 
 
599 aa  77.8  0.00000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00192901  decreased coverage  0.000000118523 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3012  oxaloacetate decarboxylase  37.01 
 
 
596 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.930079  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0639  oxaloacetate decarboxylase  38.46 
 
 
595 aa  75.5  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1155  biotin/lipoyl attachment  35.25 
 
 
128 aa  75.9  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.849643  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02841  oxaloacetate decarboxylase  34.4 
 
 
604 aa  75.1  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.698673  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0803  oxaloacetate decarboxylase  33.86 
 
 
589 aa  73.9  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3925  pyruvate carboxylase subunit B  36.09 
 
 
602 aa  73.6  0.0000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.246664  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1620  biotin/lipoyl attachment  37.8 
 
 
609 aa  72.8  0.000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1491  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  34.03 
 
 
144 aa  73.2  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0157118 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0612  pyruvate carboxylase subunit B  52.05 
 
 
569 aa  73.2  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.86669  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1740  hypothetical protein  37.4 
 
 
596 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.407057 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0980  pyruvate carboxylase  43.33 
 
 
1147 aa  72.4  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.125957  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1341  pyruvate carboxylase subunit B  50.68 
 
 
569 aa  72  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.421509 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1852  pyruvate carboxylase  44.94 
 
 
1147 aa  71.6  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1293  biotin/lipoyl attachment  35.38 
 
 
613 aa  71.6  0.000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.352378  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1591  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  31.45 
 
 
131 aa  71.6  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000447917  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0631  Conserved carboxylase region  32.14 
 
 
633 aa  71.6  0.000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0060  oxaloacetate decarboxylase  35.66 
 
 
590 aa  70.9  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.580433  normal  0.307421 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1334  pyruvate carboxylase subunit B  50.68 
 
 
569 aa  70.9  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3712  oxaloacetate decarboxylase  35.66 
 
 
590 aa  70.9  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0862  oxaloacetate decarboxylase  35.66 
 
 
590 aa  70.5  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4063  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  53.03 
 
 
165 aa  70.5  0.000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3068  oxaloacetate decarboxylase  32.28 
 
 
611 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.515821 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0085  oxaloacetate decarboxylase  34.35 
 
 
597 aa  70.5  0.000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0260292  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1757  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  37.96 
 
 
134 aa  70.1  0.000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1419  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  36.43 
 
 
166 aa  70.5  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.185754  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3336  oxaloacetate decarboxylase  32.03 
 
 
602 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000131691 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0831  oxaloacetate decarboxylase  36.22 
 
 
591 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.977578  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1220  oxaloacetate decarboxylase  34.38 
 
 
601 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0185712  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3773  pyruvate carboxylase  43.02 
 
 
1148 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.333  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3543  oxaloacetate decarboxylase  33.86 
 
 
589 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.549121  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0061  oxaloacetate decarboxylase  33.86 
 
 
589 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1916  pyruvate carboxylase subunit B  32.65 
 
 
609 aa  68.9  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.566124  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3544  oxaloacetate decarboxylase  36.22 
 
 
589 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1454  oxaloacetate decarboxylase  48.48 
 
 
690 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.583175  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1250  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  40.96 
 
 
121 aa  68.9  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3994  pyruvate carboxylase  41.86 
 
 
1148 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.882525  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3859  pyruvate carboxylase  41.86 
 
 
1148 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3690  pyruvate carboxylase  41.86 
 
 
1148 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3707  pyruvate carboxylase  41.86 
 
 
1148 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.863258  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3962  pyruvate carboxylase  41.86 
 
 
1148 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2649  pyruvate carboxylase  41.86 
 
 
1148 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00733169  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1433  biotin carboxyl carrier protein  31.69 
 
 
139 aa  68.2  0.00000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4050  pyruvate carboxylase  41.86 
 
 
1148 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.898796  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4157  pyruvate carboxylase  41.86 
 
 
1148 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.820084  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3650  oxaloacetate decarboxylase  33.07 
 
 
594 aa  68.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4065  pyruvate carboxylase  41.86 
 
 
1148 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0164116  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1343  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  35.88 
 
 
142 aa  68.2  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.166002 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6223  pyruvate carboxylase subunit B  35.38 
 
 
607 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3615  oxaloacetate decarboxylase  35.43 
 
 
589 aa  67.8  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.472152  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71720  pyruvate carboxylase subunit B  35.38 
 
 
607 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3376  oxaloacetate decarboxylase  49.25 
 
 
604 aa  68.2  0.00000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.709986  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1190  pyruvate carboxylase  41.86 
 
 
1148 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1360  pyruvate carboxylase  34.71 
 
 
1147 aa  67.8  0.00000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0615601 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1643  pyruvate carboxylase subunit B  51.52 
 
 
582 aa  67.4  0.00000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.667683  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3189  pyruvate carboxylase subunit B  51.56 
 
 
577 aa  67.4  0.00000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2986  oxaloacetate decarboxylase  31.3 
 
 
611 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.657693 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0964  biotin/lipoyl attachment  34.38 
 
 
602 aa  67.4  0.00000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0659271  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4067  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase, putative  41.25 
 
 
650 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.544109  unclonable  0.000000957509 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0059  oxaloacetate decarboxylase  50 
 
 
591 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.265333  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3665  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  40 
 
 
650 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000243321  hitchhiker  0.000000000183935 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1199  oxaloacetate decarboxylase  33.59 
 
 
603 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.584656  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1809  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  40 
 
 
650 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.202229 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0060  oxaloacetate decarboxylase  50 
 
 
591 aa  66.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.653336 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3329  pyruvate carboxylase  44.87 
 
 
1158 aa  66.2  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0700  biotin/lipoyl attachment protein  32.82 
 
 
132 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0894  oxaloacetate decarboxylase  50 
 
 
589 aa  66.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3839  pyruvate carboxylase  50 
 
 
1154 aa  66.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3196  oxaloacetate decarboxylase  48.48 
 
 
594 aa  66.6  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.097101  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0062  oxaloacetate decarboxylase  50 
 
 
588 aa  66.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0337  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  37.18 
 
 
147 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2480  oxaloacetate decarboxylase  34.62 
 
 
598 aa  65.9  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2799  oxaloacetate decarboxylase  48.48 
 
 
690 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.29172 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1784  pyruvate carboxylase subunit B  38.46 
 
 
582 aa  65.5  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.803588  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0943  allophanate hydrolase subunit 2  44.12 
 
 
1212 aa  65.9  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.648902  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2390  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  34.35 
 
 
168 aa  65.5  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0158727  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6118  pyruvate carboxylase  50 
 
 
1165 aa  65.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.410789 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0693  oxaloacetate decarboxylase  33.86 
 
 
602 aa  66.2  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00271  biotin / lipoyl attachment:Acetyl-CoA biotin carboxyl carrier subunit  33.33 
 
 
169 aa  65.5  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0487976 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1774  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  40 
 
 
650 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00809985  hitchhiker  0.00202818 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1025  oxaloacetate decarboxylase  29.23 
 
 
606 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1030  oxaloacetate decarboxylase  33.07 
 
 
608 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0319  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  37.18 
 
 
131 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0730  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP- binding  48.48 
 
 
588 aa  64.7  0.0000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.858294  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6688  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  46.97 
 
 
169 aa  64.7  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0950  biotin carboxylase  41.46 
 
 
666 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.790249  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4597  pyruvate carboxylase  41.77 
 
 
1157 aa  64.3  0.0000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3165  oxaloacetate decarboxylase  33.07 
 
 
611 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.668035 
 
 
-
 
NC_004310  BR1781  pyruvate carboxylase  43.42 
 
 
1158 aa  64.3  0.0000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1716  pyruvate carboxylase  43.42 
 
 
1158 aa  64.3  0.0000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1733  pyruvate carboxylase subunit B  34.65 
 
 
567 aa  64.3  0.0000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>