More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0700 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_0700  biotin/lipoyl attachment protein  100 
 
 
132 aa  259  6.999999999999999e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0799  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  49.62 
 
 
132 aa  127  5.0000000000000004e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000233394  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2435  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  51.85 
 
 
134 aa  114  6e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00647679  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1491  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  47.22 
 
 
144 aa  113  6.9999999999999995e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0157118 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1737  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  50 
 
 
122 aa  100  6e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1365  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  44.03 
 
 
125 aa  100  1e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0208474  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1433  biotin carboxyl carrier protein  42.45 
 
 
139 aa  97.1  7e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1757  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  43.28 
 
 
134 aa  94  6e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0631  Conserved carboxylase region  40.28 
 
 
633 aa  93.2  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3094  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding protein  41.98 
 
 
611 aa  88.2  3e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2540  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  36.3 
 
 
626 aa  88.6  3e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.391908 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0293  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  47.33 
 
 
133 aa  88.2  3e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0583  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  37.59 
 
 
131 aa  87  7e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1319  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  40 
 
 
147 aa  87  7e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0085  oxaloacetate decarboxylase  40.15 
 
 
597 aa  82.4  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0260292  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1155  biotin/lipoyl attachment  37.59 
 
 
128 aa  82  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.849643  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1916  pyruvate carboxylase subunit B  37.88 
 
 
609 aa  82  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.566124  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1609  methylmalonyl-CoA decarboxylase, gamma subunit  38.06 
 
 
144 aa  80.5  0.000000000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0210  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  34.06 
 
 
134 aa  79  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0139  pyruvate carboxylase subunit B  40.6 
 
 
616 aa  78.6  0.00000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0177448  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1729  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP- binding protein  41.22 
 
 
610 aa  78.2  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0997  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  37.5 
 
 
131 aa  77.8  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1343  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  36.43 
 
 
142 aa  77  0.00000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.166002 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02060  pyruvate carboxylase subunit B  39.39 
 
 
599 aa  77  0.00000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4478  pyruvate carboxylase subunit B  33.83 
 
 
602 aa  76.6  0.00000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1293  biotin/lipoyl attachment  37.69 
 
 
613 aa  77  0.00000000000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.352378  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0381  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  40.77 
 
 
153 aa  76.3  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.391943  normal  0.769487 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4207  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  35.88 
 
 
588 aa  76.3  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1508  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase 2  38.17 
 
 
600 aa  76.6  0.0000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0631  pyruvate carboxylase subunit B  38.93 
 
 
619 aa  75.9  0.0000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1727  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  52.24 
 
 
667 aa  75.9  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.807685  normal  0.290764 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1606  oxaloacetate decarboxylase alpha subunit  41.18 
 
 
608 aa  75.5  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0818232  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2123  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding protein  52.78 
 
 
592 aa  75.5  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2390  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  59.09 
 
 
168 aa  75.1  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0158727  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6223  pyruvate carboxylase subunit B  34.09 
 
 
607 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1512  pyruvate carboxylase subunit B  36.3 
 
 
617 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.841478  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71720  pyruvate carboxylase subunit B  34.09 
 
 
607 aa  74.3  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0964  biotin/lipoyl attachment  36.43 
 
 
602 aa  74.3  0.0000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0659271  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0945  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  33.57 
 
 
139 aa  73.9  0.0000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1199  oxaloacetate decarboxylase  39.06 
 
 
603 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.584656  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1556  pyruvate carboxylase subunit B  33.33 
 
 
604 aa  73.9  0.0000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.411533  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1005  pyruvate carboxylase subunit B  34.65 
 
 
567 aa  73.9  0.0000000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0887  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  36.22 
 
 
138 aa  73.9  0.0000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1533  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  43.64 
 
 
612 aa  73.6  0.0000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.385954  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3196  oxaloacetate decarboxylase  51.43 
 
 
594 aa  73.6  0.0000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.097101  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2537  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  35.88 
 
 
590 aa  73.6  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.232961  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1011  oxaloacetate decarboxylase, alpha subunit, putative  33.85 
 
 
599 aa  73.2  0.000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5510  oxaloacetate decarboxylase, alpha subunit  34.59 
 
 
602 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5060  pyruvate carboxylase subunit B  35.34 
 
 
602 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5639  pyruvate carboxylase subunit B  33.83 
 
 
602 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.509278  normal  0.279946 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0060  oxaloacetate decarboxylase  42.86 
 
 
590 aa  72.4  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.580433  normal  0.307421 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0320  oxaloacetate decarboxylase  36.72 
 
 
605 aa  72.8  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1032  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP- binding  46.05 
 
 
646 aa  72  0.000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.485137  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3712  oxaloacetate decarboxylase  42.86 
 
 
590 aa  72.4  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3336  oxaloacetate decarboxylase  37.5 
 
 
602 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000131691 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0202  oxaloacetate decarboxylase  35.94 
 
 
599 aa  72  0.000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0461  hypothetical protein  38.52 
 
 
661 aa  72.8  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00676863  normal  0.0747191 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0940  oxaloacetate decarboxylase, alpha subunit, putative  33.08 
 
 
599 aa  72  0.000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1857  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP- binding protein  39.62 
 
 
700 aa  72  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.737896  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0862  oxaloacetate decarboxylase  42.06 
 
 
590 aa  71.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0137  pyruvate carboxylase subunit B  49.38 
 
 
577 aa  71.6  0.000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2163  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  45.24 
 
 
623 aa  72  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0578924  normal  0.656979 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1620  biotin/lipoyl attachment  35.94 
 
 
609 aa  71.6  0.000000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2997  pyruvate carboxylase., propionyl-CoA carboxylase  41.58 
 
 
1112 aa  71.6  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.717985  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0212  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  33.58 
 
 
132 aa  71.6  0.000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002525  oxaloacetate decarboxylase alpha chain  38.28 
 
 
594 aa  71.2  0.000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.450431  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1030  oxaloacetate decarboxylase  34.59 
 
 
608 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2799  oxaloacetate decarboxylase  44.12 
 
 
690 aa  70.9  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.29172 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2575  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP- binding  34.38 
 
 
613 aa  70.9  0.000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1321  oxaloacetate decarboxylase  36.09 
 
 
604 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0140986 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5124  pyruvate carboxylase subunit B  33.08 
 
 
602 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.588617 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1748  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  34.88 
 
 
669 aa  70.9  0.000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0501395 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1728  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP- binding  48.05 
 
 
626 aa  70.5  0.000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00036271  normal  0.117337 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0881  oxaloacetate decarboxylase, alpha subunit, putative  33.08 
 
 
599 aa  70.5  0.000000000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.178794  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1454  oxaloacetate decarboxylase  45.59 
 
 
690 aa  70.1  0.000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.583175  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0148  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  53.42 
 
 
634 aa  70.1  0.000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5346  pyruvate carboxylase subunit B  33.08 
 
 
602 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00544178 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1025  oxaloacetate decarboxylase  35.56 
 
 
606 aa  69.3  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11353  biotin carboxyl carrier protein  31.85 
 
 
164 aa  69.7  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0751825  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5538  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP- binding protein  40.51 
 
 
596 aa  69.7  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0551401 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5255  pyruvate carboxylase subunit B  33.08 
 
 
602 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.594563 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3068  oxaloacetate decarboxylase  35.16 
 
 
611 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.515821 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1066  oxaloacetate decarboxylase  37.12 
 
 
592 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3434  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  48.48 
 
 
626 aa  70.1  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3623  oxaloacetate decarboxylase  43.37 
 
 
599 aa  68.9  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00192901  decreased coverage  0.000000118523 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4535  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  54.69 
 
 
662 aa  69.3  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5395  pyruvate carboxylase subunit B  33.08 
 
 
602 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0145041 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3266  oxaloacetate decarboxylase  36.09 
 
 
607 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0475332 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2986  oxaloacetate decarboxylase  35.16 
 
 
611 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.657693 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1052  oxaloacetate decarboxylase  54.55 
 
 
599 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0474655  normal  0.268345 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2909  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  54.41 
 
 
164 aa  69.3  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4233  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP- binding  38.68 
 
 
594 aa  68.2  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.213527  normal  0.607428 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0531  pyruvate carboxylase subunit B  33.33 
 
 
596 aa  68.6  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0507  pyruvate carboxylase subunit B  33.33 
 
 
596 aa  68.6  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0639  oxaloacetate decarboxylase  40 
 
 
595 aa  68.6  0.00000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1250  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  40.2 
 
 
121 aa  68.2  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05850  acetyl/propionyl-CoA carboxylase, alpha subunit  43.42 
 
 
591 aa  68.6  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.79631 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2304  urea carboxylase  40 
 
 
1209 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.198231  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2883  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  52.94 
 
 
164 aa  67.8  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4063  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  46.05 
 
 
165 aa  67.8  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>