More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0210 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0210  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  100 
 
 
134 aa  253  8e-67  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0212  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  91.04 
 
 
132 aa  202  1e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0583  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  51.75 
 
 
131 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1319  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  45.27 
 
 
147 aa  102  2e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1365  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  41.35 
 
 
125 aa  90.1  1e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0208474  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0555  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  41.36 
 
 
156 aa  86.7  1e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0799  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  36.23 
 
 
132 aa  86.7  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000233394  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0293  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  37.68 
 
 
133 aa  80.5  0.000000000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1155  biotin/lipoyl attachment  35.71 
 
 
128 aa  80.1  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.849643  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0202  oxaloacetate decarboxylase  35.88 
 
 
599 aa  78.2  0.00000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3623  oxaloacetate decarboxylase  35.38 
 
 
599 aa  77  0.00000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00192901  decreased coverage  0.000000118523 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0631  Conserved carboxylase region  32.62 
 
 
633 aa  75.1  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3012  oxaloacetate decarboxylase  37.21 
 
 
596 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.930079  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0980  pyruvate carboxylase  42.22 
 
 
1147 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.125957  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0639  oxaloacetate decarboxylase  36.84 
 
 
595 aa  74.3  0.0000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1491  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  31.69 
 
 
144 aa  73.9  0.0000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0157118 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1757  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  36.5 
 
 
134 aa  73.2  0.000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1852  pyruvate carboxylase  43.82 
 
 
1147 aa  73.6  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1620  biotin/lipoyl attachment  37.21 
 
 
609 aa  71.6  0.000000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4063  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  53.03 
 
 
165 aa  70.9  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02841  oxaloacetate decarboxylase  48.44 
 
 
604 aa  70.5  0.000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.698673  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1293  biotin/lipoyl attachment  36.76 
 
 
613 aa  70.5  0.000000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.352378  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1591  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  32.54 
 
 
131 aa  70.5  0.000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000447917  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0700  biotin/lipoyl attachment protein  33.82 
 
 
132 aa  70.5  0.000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1343  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  36.43 
 
 
142 aa  70.5  0.000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.166002 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3712  oxaloacetate decarboxylase  34.11 
 
 
590 aa  70.1  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0060  oxaloacetate decarboxylase  34.11 
 
 
590 aa  70.1  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.580433  normal  0.307421 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1220  oxaloacetate decarboxylase  33.83 
 
 
601 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0185712  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1250  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  44.59 
 
 
121 aa  70.1  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0085  oxaloacetate decarboxylase  34.59 
 
 
597 aa  70.1  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0260292  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0862  oxaloacetate decarboxylase  34.11 
 
 
590 aa  70.1  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0612  pyruvate carboxylase subunit B  50.7 
 
 
569 aa  69.3  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.86669  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3773  pyruvate carboxylase  40.7 
 
 
1148 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.333  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1733  pyruvate carboxylase subunit B  43.37 
 
 
567 aa  68.9  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3196  oxaloacetate decarboxylase  50 
 
 
594 aa  68.9  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.097101  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2480  oxaloacetate decarboxylase  34.85 
 
 
598 aa  68.2  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0943  allophanate hydrolase subunit 2  35.51 
 
 
1212 aa  68.6  0.00000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.648902  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3189  pyruvate carboxylase subunit B  35.34 
 
 
577 aa  68.2  0.00000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1341  pyruvate carboxylase subunit B  49.3 
 
 
569 aa  68.2  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.421509 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1454  oxaloacetate decarboxylase  48.48 
 
 
690 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.583175  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0831  oxaloacetate decarboxylase  32.56 
 
 
591 aa  67.8  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.977578  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3994  pyruvate carboxylase  39.53 
 
 
1148 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.882525  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3859  pyruvate carboxylase  39.53 
 
 
1148 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3690  pyruvate carboxylase  39.53 
 
 
1148 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3707  pyruvate carboxylase  39.53 
 
 
1148 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.863258  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1740  hypothetical protein  34.62 
 
 
596 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.407057 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4157  pyruvate carboxylase  39.53 
 
 
1148 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.820084  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4050  pyruvate carboxylase  39.53 
 
 
1148 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.898796  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4065  pyruvate carboxylase  39.53 
 
 
1148 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0164116  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3962  pyruvate carboxylase  39.53 
 
 
1148 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1190  pyruvate carboxylase  39.53 
 
 
1148 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2649  pyruvate carboxylase  39.53 
 
 
1148 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00733169  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1433  biotin carboxyl carrier protein  30.56 
 
 
139 aa  67.4  0.00000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1334  pyruvate carboxylase subunit B  49.3 
 
 
569 aa  67.4  0.00000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2669  pyruvate carboxylase  34.74 
 
 
1164 aa  67  0.00000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0529984  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1419  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  36.09 
 
 
166 aa  67  0.00000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.185754  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0964  biotin/lipoyl attachment  35.38 
 
 
602 aa  67  0.00000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0659271  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3376  oxaloacetate decarboxylase  49.23 
 
 
604 aa  67  0.00000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.709986  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1556  pyruvate carboxylase subunit B  29.93 
 
 
615 aa  66.6  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.944098  normal  0.0959021 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3068  oxaloacetate decarboxylase  31.01 
 
 
611 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.515821 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0052  biotin carboxylase  30.77 
 
 
662 aa  66.2  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2986  oxaloacetate decarboxylase  30.53 
 
 
611 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.657693 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1643  pyruvate carboxylase subunit B  50 
 
 
582 aa  66.2  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.667683  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0815  propionyl-CoA carboxylase, alpha subunit  36.26 
 
 
652 aa  65.1  0.0000000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.904428  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3925  pyruvate carboxylase subunit B  34.06 
 
 
602 aa  65.5  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.246664  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0803  oxaloacetate decarboxylase  32.56 
 
 
589 aa  65.5  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1066  oxaloacetate decarboxylase  28.03 
 
 
592 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2799  oxaloacetate decarboxylase  48.48 
 
 
690 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.29172 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2575  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP- binding  32.35 
 
 
613 aa  64.7  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6688  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  29.46 
 
 
169 aa  64.7  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1916  pyruvate carboxylase subunit B  29.79 
 
 
609 aa  64.3  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.566124  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3615  oxaloacetate decarboxylase  48.48 
 
 
589 aa  64.3  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.472152  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1199  oxaloacetate decarboxylase  29.85 
 
 
603 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.584656  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0913  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  42.47 
 
 
678 aa  64.3  0.0000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1025  oxaloacetate decarboxylase  27.48 
 
 
606 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0997  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  31.06 
 
 
131 aa  64.7  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0059  oxaloacetate decarboxylase  48.48 
 
 
591 aa  64.3  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.265333  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3543  oxaloacetate decarboxylase  48.48 
 
 
589 aa  63.9  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.549121  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0894  oxaloacetate decarboxylase  48.48 
 
 
589 aa  63.9  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0060  oxaloacetate decarboxylase  48.48 
 
 
591 aa  63.9  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.653336 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3544  oxaloacetate decarboxylase  48.48 
 
 
589 aa  63.9  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0730  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP- binding  46.97 
 
 
588 aa  63.9  0.0000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.858294  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0061  oxaloacetate decarboxylase  48.48 
 
 
589 aa  63.9  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4167  pyruvate carboxylase  46.88 
 
 
1154 aa  63.9  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1030  oxaloacetate decarboxylase  29.46 
 
 
608 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0062  oxaloacetate decarboxylase  48.48 
 
 
588 aa  63.9  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2390  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  46.97 
 
 
168 aa  63.5  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0158727  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3650  oxaloacetate decarboxylase  48.48 
 
 
594 aa  63.5  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0929  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  43.84 
 
 
678 aa  63.5  0.0000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3665  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  37.5 
 
 
650 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000243321  hitchhiker  0.000000000183935 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1049  oxaloacetate decarboxylase  30 
 
 
592 aa  63.2  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6118  pyruvate carboxylase  46.88 
 
 
1165 aa  63.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.410789 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1321  oxaloacetate decarboxylase  30.88 
 
 
604 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0140986 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3266  oxaloacetate decarboxylase  27.91 
 
 
607 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0475332 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3839  pyruvate carboxylase  46.88 
 
 
1154 aa  63.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3336  oxaloacetate decarboxylase  29.32 
 
 
602 aa  63.2  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000131691 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3023  biotin/lipoyl attachment  42.03 
 
 
135 aa  63.5  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.560245 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0337  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  33.33 
 
 
147 aa  63.2  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0139  pyruvate carboxylase subunit B  46.97 
 
 
616 aa  62  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0177448  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0693  oxaloacetate decarboxylase  34.11 
 
 
602 aa  62.4  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>