More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1740 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_02841  oxaloacetate decarboxylase  52.48 
 
 		 604 aa  643    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.698673  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1740  hypothetical protein  100 
 
 		 596 aa  1228    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.407057 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3336  oxaloacetate decarboxylase  54.79 
 
 		 602 aa  642    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000131691 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1199  oxaloacetate decarboxylase  53.63 
 
 		 603 aa  637    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.584656  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1321  oxaloacetate decarboxylase  54.47 
 
 		 604 aa  646    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0140986 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3012  oxaloacetate decarboxylase  54.44 
 
 		 596 aa  646    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.930079  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1220  oxaloacetate decarboxylase  55.48 
 
 		 601 aa  661    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0185712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0085  oxaloacetate decarboxylase  53.09 
 
 		 597 aa  633  1e-180  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0260292  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1049  oxaloacetate decarboxylase  53.27 
 
 		 592 aa  626  1e-178  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2893  oxaloacetate decarboxylase  54.36 
 
 		 592 aa  625  1e-178  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.345555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002525  oxaloacetate decarboxylase alpha chain  52.68 
 
 		 594 aa  622  1e-177  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.450431  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1066  oxaloacetate decarboxylase  53.49 
 
 		 592 aa  623  1e-177  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1030  oxaloacetate decarboxylase  53.24 
 
 		 608 aa  623  1e-177  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3623  oxaloacetate decarboxylase  53.63 
 
 		 599 aa  624  1e-177  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00192901  decreased coverage  0.000000118523 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3266  oxaloacetate decarboxylase  52.33 
 
 		 607 aa  617  1e-175  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0475332 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0639  oxaloacetate decarboxylase  51.92 
 
 		 595 aa  615  1e-175  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3068  oxaloacetate decarboxylase  52.55 
 
 		 611 aa  617  1e-175  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.515821 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1025  oxaloacetate decarboxylase  52.33 
 
 		 606 aa  617  1e-175  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2986  oxaloacetate decarboxylase  51.89 
 
 		 611 aa  614  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.657693 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03491  oxaloacetate decarboxylase  52.35 
 
 		 593 aa  614  9.999999999999999e-175  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1052  oxaloacetate decarboxylase  53 
 
 		 599 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0474655  normal  0.268345 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1126  oxaloacetate decarboxylase  52.42 
 
 		 607 aa  611  1e-173  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0971  oxaloacetate decarboxylase  51.68 
 
 		 595 aa  608  1e-173  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.195309  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3165  oxaloacetate decarboxylase  51.4 
 
 		 611 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.668035 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1092  oxaloacetate decarboxylase  52.42 
 
 		 607 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3376  oxaloacetate decarboxylase  52.42 
 
 		 604 aa  603  1.0000000000000001e-171  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.709986  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2480  oxaloacetate decarboxylase  50.33 
 
 		 598 aa  593  1e-168  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1306  oxaloacetate decarboxylase  51 
 
 		 596 aa  585  1e-166  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00193568  normal  0.0412594 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0693  oxaloacetate decarboxylase  51.49 
 
 		 602 aa  582  1.0000000000000001e-165  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0320  oxaloacetate decarboxylase  49.08 
 
 		 605 aa  573  1.0000000000000001e-162  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0202  oxaloacetate decarboxylase  48.99 
 
 		 599 aa  570  1e-161  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0862  oxaloacetate decarboxylase  49.58 
 
 		 590 aa  565  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0060  oxaloacetate decarboxylase  49.58 
 
 		 590 aa  564  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.580433  normal  0.307421 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3712  oxaloacetate decarboxylase  49.58 
 
 		 590 aa  564  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2799  oxaloacetate decarboxylase  48.65 
 
 		 690 aa  560  1e-158  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.29172 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0062  oxaloacetate decarboxylase  49.24 
 
 		 588 aa  556  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3196  oxaloacetate decarboxylase  49.24 
 
 		 594 aa  556  1e-157  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.097101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3543  oxaloacetate decarboxylase  49.41 
 
 		 589 aa  555  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.549121  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3615  oxaloacetate decarboxylase  49.07 
 
 		 589 aa  553  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.472152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0803  oxaloacetate decarboxylase  49.41 
 
 		 589 aa  553  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0060  oxaloacetate decarboxylase  49.41 
 
 		 591 aa  553  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.653336 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1454  oxaloacetate decarboxylase  48.15 
 
 		 690 aa  551  1e-155  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.583175  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3544  oxaloacetate decarboxylase  48.9 
 
 		 589 aa  550  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0059  oxaloacetate decarboxylase  49.24 
 
 		 591 aa  550  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.265333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0061  oxaloacetate decarboxylase  49.07 
 
 		 589 aa  549  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0831  oxaloacetate decarboxylase  49.07 
 
 		 591 aa  548  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.977578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3650  oxaloacetate decarboxylase  48.83 
 
 		 594 aa  546  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0894  oxaloacetate decarboxylase  49.24 
 
 		 589 aa  542  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02060  pyruvate carboxylase subunit B  43.61 
 
 		 599 aa  476  1e-133  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5346  pyruvate carboxylase subunit B  43.21 
 
 		 602 aa  473  1e-132  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544178 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5124  pyruvate carboxylase subunit B  43.3 
 
 		 602 aa  474  1e-132  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.588617 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5255  pyruvate carboxylase subunit B  43.21 
 
 		 602 aa  473  1e-132  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.594563 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5395  pyruvate carboxylase subunit B  43.21 
 
 		 602 aa  473  1e-132  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0145041 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5639  pyruvate carboxylase subunit B  42.67 
 
 		 602 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.509278  normal  0.279946 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1334  pyruvate carboxylase subunit B  43.36 
 
 		 569 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1512  pyruvate carboxylase subunit B  40.77 
 
 		 617 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.841478  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5510  oxaloacetate decarboxylase, alpha subunit  42.65 
 
 		 602 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1350  pyruvate carboxylase subunit B  43.03 
 
 		 568 aa  467  9.999999999999999e-131  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5060  pyruvate carboxylase subunit B  42.65 
 
 		 602 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6223  pyruvate carboxylase subunit B  42.27 
 
 		 607 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71720  pyruvate carboxylase subunit B  42.27 
 
 		 607 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1556  pyruvate carboxylase subunit B  41.42 
 
 		 615 aa  464  1e-129  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.944098  normal  0.0959021 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4478  pyruvate carboxylase subunit B  42.62 
 
 		 602 aa  464  1e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1916  pyruvate carboxylase subunit B  41.76 
 
 		 609 aa  463  1e-129  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.566124  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1341  pyruvate carboxylase subunit B  43.03 
 
 		 569 aa  462  1e-129  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.421509 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0612  pyruvate carboxylase subunit B  42.86 
 
 		 569 aa  462  9.999999999999999e-129  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.86669  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3925  pyruvate carboxylase subunit B  41.41 
 
 		 602 aa  458  1e-127  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.246664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1005  pyruvate carboxylase subunit B  40.83 
 
 		 567 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1556  pyruvate carboxylase subunit B  41.5 
 
 		 604 aa  436  1e-121  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.411533  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0250  pyruvate carboxylase subunit B  39.8 
 
 		 582 aa  433  1e-120  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1733  pyruvate carboxylase subunit B  40.84 
 
 		 567 aa  435  1e-120  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0531  pyruvate carboxylase subunit B  40.1 
 
 		 596 aa  429  1e-119  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0507  pyruvate carboxylase subunit B  40.1 
 
 		 596 aa  429  1e-119  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1586  pyruvate carboxylase subunit B  40.03 
 
 		 573 aa  431  1e-119  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.526056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_128  oxaloacetate decarboxylase, alpha subunit  40 
 
 		 587 aa  429  1e-119  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0119  pyruvate carboxylase subunit B  40.5 
 
 		 584 aa  427  1e-118  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.698581  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1582  oxaloacetate decarboxylase  47.69 
 
 		 465 aa  421  1e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2425  pyruvate carboxylase subunit B  39.59 
 
 		 571 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1606  oxaloacetate decarboxylase alpha subunit  39.42 
 
 		 608 aa  416  9.999999999999999e-116  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0818232  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0631  Conserved carboxylase region  37.11 
 
 		 633 aa  414  1e-114  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1736  oxaloacetate decarboxylase  45.32 
 
 		 510 aa  406  1.0000000000000001e-112  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1064  pyruvate carboxylase subunit B  35.36 
 
 		 634 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000214042  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1784  pyruvate carboxylase subunit B  38.33 
 
 		 582 aa  402  9.999999999999999e-111  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.803588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3189  pyruvate carboxylase subunit B  37.08 
 
 		 577 aa  396  1e-109  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1643  pyruvate carboxylase subunit B  38.67 
 
 		 582 aa  398  1e-109  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.667683  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2603  pyruvate carboxylase subunit B  35.23 
 
 		 624 aa  394  1e-108  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000143186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1010  pyruvate carboxylase subunit B  37.44 
 
 		 579 aa  391  1e-107  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.843574 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0701  oxaloacetate decarboxylase  43.92 
 
 		 465 aa  391  1e-107  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1015  pyruvate carboxylase subunit B  36.29 
 
 		 614 aa  387  1e-106  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.091976  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0137  pyruvate carboxylase subunit B  37.31 
 
 		 577 aa  388  1e-106  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0033  oxaloacetate decarboxylase  42.95 
 
 		 499 aa  383  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000614565  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3084  oxaloacetate decarboxylase  42.95 
 
 		 499 aa  383  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000401568  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1230  Conserved carboxylase region  41.67 
 
 		 475 aa  381  1e-104  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3026  oxaloacetate decarboxylase  39.96 
 
 		 520 aa  378  1e-103  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.444345 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0558  pyruvate carboxylase subunit B  34.59 
 
 		 636 aa  376  1e-103  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0745803  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0139  pyruvate carboxylase subunit B  35.77 
 
 		 616 aa  377  1e-103  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0177448  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1319  Conserved carboxylase region  41.51 
 
 		 463 aa  370  1e-101  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1284  pyruvate carboxylase subunit B  36.92 
 
 		 618 aa  371  1e-101  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.01303  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1525  pyruvate carboxylase subunit B  35.85 
 
 		 643 aa  369  1e-100  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000118935  normal  0.0137179 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1435  pyruvate carboxylase subunit B  33.87 
 
 		 638 aa  362  1e-98  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000897989  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>