56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0004 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0004  protein of unknown function DUF721  100 
 
 		 171 aa  333  7e-91  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00476655  normal  0.0907524 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0005  protein of unknown function DUF721  50 
 
 		 171 aa  118  3.9999999999999996e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0005  hypothetical protein  43.03 
 
 		 185 aa  115  3e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.342856  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0005  protein of unknown function DUF721  42.31 
 
 		 185 aa  115  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000106889 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00050  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  42.21 
 
 		 196 aa  114  6.9999999999999995e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00050  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  43.03 
 
 		 196 aa  108  3e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0005  hypothetical protein  43.84 
 
 		 188 aa  106  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0005  protein of unknown function DUF721  47.86 
 
 		 173 aa  105  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0823  hypothetical protein  39.89 
 
 		 188 aa  105  4e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0005  hypothetical protein  46.67 
 
 		 190 aa  103  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0013  hypothetical protein  46.67 
 
 		 190 aa  103  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.104942 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0005  hypothetical protein  46.67 
 
 		 190 aa  103  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.935209  normal  0.0649143 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0005  hypothetical protein  40.8 
 
 		 185 aa  102  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.731239  normal  0.310544 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0005  hypothetical protein  41.26 
 
 		 183 aa  100  7e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0232127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0006  Zn-ribbon-containing possibly RNA-binding protein and truncated derivatives-like protein  45.45 
 
 		 206 aa  99.4  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.358663  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00040  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  45.95 
 
 		 187 aa  98.2  4e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10004  hypothetical protein  45.31 
 
 		 187 aa  97.8  7e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0005  protein of unknown function DUF721  42.19 
 
 		 172 aa  97.4  9e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.44696  normal  0.799003 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0005  protein of unknown function DUF721  44.92 
 
 		 217 aa  97.1  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00382214 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0005  hypothetical protein  44.44 
 
 		 134 aa  94.7  6e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.918474  normal  0.25905 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0008  protein of unknown function DUF721  42.5 
 
 		 180 aa  93.2  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0004  protein of unknown function DUF721  42.42 
 
 		 184 aa  92  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0005  protein of unknown function DUF721  43.33 
 
 		 207 aa  92  4e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0005  protein of unknown function DUF721  45.54 
 
 		 166 aa  90.5  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0005  hypothetical protein  38.18 
 
 		 173 aa  86.3  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0499719  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0005  hypothetical protein  40.16 
 
 		 273 aa  85.9  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0987513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0006  hypothetical protein  41.32 
 
 		 198 aa  86.7  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00159718  hitchhiker  0.00351653 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0005  hypothetical protein  45.54 
 
 		 201 aa  85.9  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000127236 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00050  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  41.26 
 
 		 217 aa  85.1  4e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00080644  normal  0.335319 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00040  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  40.12 
 
 		 266 aa  84  8e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.221602  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0005  protein of unknown function DUF721  41.49 
 
 		 179 aa  83.2  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0005  hypothetical protein  37.1 
 
 		 177 aa  80.9  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.40327 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0004  hypothetical protein  36.89 
 
 		 164 aa  79  0.00000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1433  Zn-ribbon-containing RNA-binding protein  35.45 
 
 		 156 aa  78.6  0.00000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0005  protein of unknown function DUF721  41.67 
 
 		 143 aa  77.8  0.00000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00151548  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0005  protein of unknown function DUF721  37.17 
 
 		 188 aa  73.6  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0042  hypothetical protein  33.02 
 
 		 155 aa  72.8  0.000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0005  protein of unknown function DUF721  39.18 
 
 		 117 aa  71.6  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00444406 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2995  hypothetical protein  34.48 
 
 		 266 aa  53.9  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.333747  normal  0.629228 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0004  hypothetical protein  37.29 
 
 		 97 aa  53.1  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2009  hypothetical protein  25.81 
 
 		 97 aa  50.8  0.000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3502  protein of unknown function DUF721  32.18 
 
 		 170 aa  49.7  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.428989 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0004  hypothetical protein  27.78 
 
 		 97 aa  49.3  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.52078  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0004  hypothetical protein  28.57 
 
 		 97 aa  47.4  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0004  hypothetical protein  23.91 
 
 		 96 aa  45.8  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.132864 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3498  protein of unknown function DUF721  30.85 
 
 		 153 aa  45.8  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.68574e-33 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3436  hypothetical protein  31.68 
 
 		 151 aa  45.1  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00123738  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0055  protein of unknown function DUF721  31.73 
 
 		 271 aa  44.3  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0003  hypothetical protein  28.72 
 
 		 97 aa  43.5  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.179596  normal  0.528651 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2709  protein of unknown function DUF721  28.41 
 
 		 106 aa  43.5  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3768  hypothetical protein  33.85 
 
 		 152 aa  43.1  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00373156  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0004  hypothetical protein  26.6 
 
 		 102 aa  42.4  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.301106  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0095  Zn-ribbon-containing protein  24.14 
 
 		 101 aa  42.4  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00142092  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3330  hypothetical protein  32.26 
 
 		 149 aa  42.7  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2226  hypothetical protein  28.26 
 
 		 168 aa  41.6  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000216141  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0638  hypothetical protein  28.16 
 
 		 159 aa  40.8  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.128267  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>