55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0004 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0004  protein of unknown function DUF721  100 
 
 		 184 aa  362  1e-99  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0005  hypothetical protein  63.33 
 
 		 190 aa  217  8.999999999999998e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.935209  normal  0.0649143 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0005  hypothetical protein  63.33 
 
 		 190 aa  217  8.999999999999998e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0013  hypothetical protein  63.33 
 
 		 190 aa  217  8.999999999999998e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.104942 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0005  hypothetical protein  62.98 
 
 		 185 aa  209  2e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.731239  normal  0.310544 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0823  hypothetical protein  59.57 
 
 		 188 aa  200  9e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0008  protein of unknown function DUF721  63.89 
 
 		 180 aa  190  1e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10004  hypothetical protein  59.41 
 
 		 187 aa  179  1e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00050  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  59.54 
 
 		 217 aa  150  1e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00080644  normal  0.335319 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0005  protein of unknown function DUF721  56.3 
 
 		 188 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0005  protein of unknown function DUF721  59.2 
 
 		 143 aa  141  6e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00151548  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0005  protein of unknown function DUF721  51.28 
 
 		 185 aa  132  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000106889 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0005  protein of unknown function DUF721  50.78 
 
 		 166 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0005  hypothetical protein  41.01 
 
 		 185 aa  129  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.342856  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0005  protein of unknown function DUF721  45.03 
 
 		 217 aa  126  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00382214 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0005  hypothetical protein  50.39 
 
 		 134 aa  124  7e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.918474  normal  0.25905 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0005  hypothetical protein  42.24 
 
 		 188 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00040  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  44.7 
 
 		 187 aa  117  9.999999999999999e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00050  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  41.72 
 
 		 196 aa  114  7.999999999999999e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0006  hypothetical protein  50 
 
 		 198 aa  114  7.999999999999999e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00159718  hitchhiker  0.00351653 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0005  protein of unknown function DUF721  46.22 
 
 		 173 aa  111  7.000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0005  protein of unknown function DUF721  44.09 
 
 		 171 aa  109  2.0000000000000002e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0005  protein of unknown function DUF721  45.97 
 
 		 207 aa  108  6e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0005  hypothetical protein  50.41 
 
 		 201 aa  107  7.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000127236 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00050  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  40.48 
 
 		 196 aa  105  5e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0005  hypothetical protein  45.3 
 
 		 273 aa  104  6e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0987513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0005  hypothetical protein  44.26 
 
 		 177 aa  103  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.40327 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00040  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  40 
 
 		 266 aa  103  1e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.221602  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0004  hypothetical protein  43.97 
 
 		 164 aa  99.4  3e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0005  hypothetical protein  42.75 
 
 		 183 aa  96.7  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0232127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0006  Zn-ribbon-containing possibly RNA-binding protein and truncated derivatives-like protein  41.67 
 
 		 206 aa  94.7  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.358663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0004  protein of unknown function DUF721  42.42 
 
 		 171 aa  89  3e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00476655  normal  0.0907524 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0005  protein of unknown function DUF721  38.28 
 
 		 172 aa  88.2  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.44696  normal  0.799003 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0005  protein of unknown function DUF721  36.48 
 
 		 179 aa  84  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0005  hypothetical protein  37.38 
 
 		 173 aa  75.1  0.0000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0499719  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1433  Zn-ribbon-containing RNA-binding protein  37.98 
 
 		 156 aa  74.7  0.0000000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0042  hypothetical protein  30.33 
 
 		 155 aa  70.9  0.00000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3436  hypothetical protein  36.17 
 
 		 151 aa  70.5  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00123738  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3498  protein of unknown function DUF721  36.17 
 
 		 153 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.68574e-33 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3768  hypothetical protein  39.44 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00373156  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0005  protein of unknown function DUF721  34.04 
 
 		 117 aa  56.2  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00444406 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0638  hypothetical protein  30 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.128267  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2226  hypothetical protein  31.87 
 
 		 168 aa  55.8  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000216141  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2875  hypothetical protein  29.41 
 
 		 162 aa  50.8  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0140441  hitchhiker  0.0000188483 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2350  hypothetical protein  29 
 
 		 153 aa  44.7  0.0008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.000367866  normal  0.0123481 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2445  hypothetical protein  31.82 
 
 		 156 aa  43.9  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000048803  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0164  hypothetical protein  36.84 
 
 		 185 aa  44.3  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1548  protein of unknown function DUF721  23.75 
 
 		 160 aa  43.5  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0658767  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2563  protein of unknown function DUF721  25.23 
 
 		 178 aa  43.5  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0544  hypothetical protein  35.48 
 
 		 86 aa  42  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000177054  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2691  protein of unknown function DUF721  29.55 
 
 		 95 aa  42  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0004  hypothetical protein  22.73 
 
 		 97 aa  41.6  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.52078  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0004  protein of unknown function DUF721  30.3 
 
 		 105 aa  41.6  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3330  hypothetical protein  23.94 
 
 		 149 aa  41.2  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2009  hypothetical protein  24.44 
 
 		 97 aa  41.2  0.008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>